RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568631.5

RNPS1-223, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, human

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene RNPS1, Length 1,792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNPS1-223	ENST00000568631	HS3ST6	Q96QI5	342 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RNPS1-223	ENST00000568631	CXXC4	Q9H2H0	198 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RNPS1-223	ENST00000568631	AKIP1	Q9NQ31	210 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RNPS1-223	ENST00000568631	C14orf119	Q9NWQ9	140 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RNPS1-223	ENST00000568631	FBLN5	Q9UBX5	448 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RNPS1-223	ENST00000568631	ING4	Q9UNL4	249 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RNPS1-223	ENST00000568631	CLDN25	C9JDP6	229 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RNPS1-223	ENST00000568631		H0YL77	283 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RNPS1-223	ENST00000568631	LDLRAD4	O15165	306 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RNPS1-223	ENST00000568631	MLNR	O43193	412 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RNPS1-223	ENST00000568631	EIF4E	P06730	217 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
RNPS1-223	ENST00000568631	INHBB	P09529	407 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RNPS1-223	ENST00000568631	RNF224	P0DH78	156 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RNPS1-223	ENST00000568631	VSIG8	P0DPA2	414 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RNPS1-223	ENST00000568631	BMP4	P12644	408 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RNPS1-223	ENST00000568631	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
RNPS1-223	ENST00000568631	ZNF45	Q02386	682 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RNPS1-223	ENST00000568631	ZNF672	Q499Z4	452 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
RNPS1-223	ENST00000568631	FAM76B	Q5HYJ3	339 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RNPS1-223	ENST00000568631	OR2W3	Q7Z3T1	314 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RNPS1-223	ENST00000568631	PXT1	Q8NFP0	134 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RNPS1-223	ENST00000568631	OR10AD1	Q8NGE0	317 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RNPS1-223	ENST00000568631	KCNG3	Q8TAE7	436 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RNPS1-223	ENST00000568631	RAB40A	Q8WXH6	277 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RNPS1-223	ENST00000568631	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
RNPS1-223	ENST00000568631	METTL9	Q9H1A3	318 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RNPS1-223	ENST00000568631	ABCG5	Q9H222	651 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RNPS1-223	ENST00000568631	OR51I2	Q9H344	312 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RNPS1-223	ENST00000568631	RHBDL2	Q9NX52	303 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RNPS1-223	ENST00000568631	CISD1	Q9NZ45	108 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
RNPS1-223	ENST00000568631	RAB22A	Q9UL26	194 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RNPS1-223	ENST00000568631	CAD	P27708	2225 aa		13.77	□□□□□ -0.2
RNPS1-223	ENST00000568631	LRP5L	A4QPB2	252 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RNPS1-223	ENST00000568631	SPRY1	O43609	319 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RNPS1-223	ENST00000568631	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RNPS1-223	ENST00000568631	PLAU	P00749	431 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RNPS1-223	ENST00000568631	PLAT	P00750	562 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RNPS1-223	ENST00000568631	RAB6A	P20340	208 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RNPS1-223	ENST00000568631	QRFP	P83859	136 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RNPS1-223	ENST00000568631	GPR176	Q14439	515 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RNPS1-223	ENST00000568631	ZNF846	Q147U1	533 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RNPS1-223	ENST00000568631	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RNPS1-223	ENST00000568631	CNIH2	Q6PI25	160 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RNPS1-223	ENST00000568631	ASCL4	Q6XD76	172 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RNPS1-223	ENST00000568631	C1QL2	Q7Z5L3	287 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RNPS1-223	ENST00000568631	CALHM1	Q8IU99	346 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RNPS1-223	ENST00000568631	SAXO1	Q8IYX7	474 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RNPS1-223	ENST00000568631	ZNF611	Q8N823	705 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RNPS1-223	ENST00000568631	OR2Z1	Q8NG97	314 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RNPS1-223	ENST00000568631	NEUROG1	Q92886	237 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RNPS1-223	ENST00000568631	SLC25A38	Q96DW6	304 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RNPS1-223	ENST00000568631	S100A16	Q96FQ6	103 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RNPS1-223	ENST00000568631	C1orf147	Q96MC9	270 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RNPS1-223	ENST00000568631	DHRS9	Q9BPW9	319 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RNPS1-223	ENST00000568631	CST11	Q9H112	138 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RNPS1-223	ENST00000568631	KCNK15	Q9H427	330 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RNPS1-223	ENST00000568631	ELL3	Q9HB65	397 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RNPS1-223	ENST00000568631	PCDHB16	Q9NRJ7	776 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RNPS1-223	ENST00000568631	EXTL2	Q9UBQ6	330 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RNPS1-223	ENST00000568631	ZSCAN5B	A6NJL1	495 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RNPS1-223	ENST00000568631	TMEM14DP	A8MWL7	114 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RNPS1-223	ENST00000568631	CYB5A	P00167	134 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RNPS1-223	ENST00000568631	ZNF81	P51508	661 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RNPS1-223	ENST00000568631	SRSF1	Q07955	248 aa	Known RBP eCLIP	13.76	□□□□□ -0.21	3e-6	■■■■□ 23.2
RNPS1-223	ENST00000568631	RSU1	Q15404	277 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RNPS1-223	ENST00000568631	EFNB3	Q15768	340 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RNPS1-223	ENST00000568631	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RNPS1-223	ENST00000568631	METAP1D	Q6UB28	335 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RNPS1-223	ENST00000568631	MEX3B	Q6ZN04	569 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RNPS1-223	ENST00000568631	SLC25A26	Q70HW3	274 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RNPS1-223	ENST00000568631	MKX	Q8IYA7	352 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RNPS1-223	ENST00000568631	CMTM4	Q8IZR5	234 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RNPS1-223	ENST00000568631	MFSD4A	Q8N468	514 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RNPS1-223	ENST00000568631	ACBD4	Q8NC06	268 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RNPS1-223	ENST00000568631	OR51F2	Q8NH61	342 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RNPS1-223	ENST00000568631	PKIB	Q9C010	78 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RNPS1-223	ENST00000568631	ZDHHC8	Q9ULC8	765 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RNPS1-223	ENST00000568631	FABP12	A6NFH5	140 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RNPS1-223	ENST00000568631		F5H5P2	479 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RNPS1-223	ENST00000568631	ANGPTL7	O43827	346 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RNPS1-223	ENST00000568631	PLA2G2A	P14555	144 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RNPS1-223	ENST00000568631	FAM189A2	Q15884	450 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RNPS1-223	ENST00000568631	HAGHL	Q6PII5	290 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RNPS1-223	ENST00000568631	CDH24	Q86UP0	819 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RNPS1-223	ENST00000568631	LILRB1	Q8NHL6	650 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RNPS1-223	ENST00000568631	IL36G	Q9NZH8	169 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RNPS1-223	ENST00000568631	ZNF462	Q96JM2	2506 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RNPS1-223	ENST00000568631	METTL21EP	A6NDL7	271 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RNPS1-223	ENST00000568631		B9A039	149 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RNPS1-223	ENST00000568631	PRSS44	E7EML9	344 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RNPS1-223	ENST00000568631		J3QT63	122 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RNPS1-223	ENST00000568631	CRTAP	O75718	401 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RNPS1-223	ENST00000568631	KDM4B	O94953	1096 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RNPS1-223	ENST00000568631	GOSR1	O95249	250 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RNPS1-223	ENST00000568631	CSTB	P04080	98 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RNPS1-223	ENST00000568631	MPZ	P25189	248 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RNPS1-223	ENST00000568631	CD200	P41217	278 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RNPS1-223	ENST00000568631	EFNB2	P52799	333 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RNPS1-223	ENST00000568631	IL24	Q13007	206 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RNPS1-223	ENST00000568631	PLA2G7	Q13093	441 aa		13.75	□□□□□ -0.21

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