RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531012.1

ARRB1-208, Transcript of arrestin beta 1, human

TSL 2

Gene ARRB1, Length 1,744 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARRB1-208	ENST00000531012	SPRY1	O43609	319 aa	Predicted RBP	12.94	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	RAD51D	O75771	328 aa		12.94	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	NGF	P01138	241 aa		12.94	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	AMY2A	P04746	511 aa		12.94	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	TBP	P20226	339 aa		12.94	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	MPZ	P25189	248 aa		12.94	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	WNT5A	P41221	380 aa		12.94	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	RSU1	Q15404	277 aa		12.94	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	ZNF585A	Q6P3V2	769 aa		12.94	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	LIX1L	Q8IVB5	337 aa		12.94	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	SLC30A7	Q8NEW0	376 aa		12.94	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012		Q96M66	194 aa		12.94	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	TRAF4	Q9BUZ4	470 aa	Predicted RBP	12.94	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	GPN1	Q9HCN4	374 aa	Predicted RBP	12.94	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	DKK4	Q9UBT3	224 aa		12.94	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	LHX6	Q9UPM6	363 aa		12.94	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	SNRPGP15	A8MWD9	76 aa		12.93	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	DISC1	C4P0D8	188 aa		12.93	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	MKRN2OS	H3BPM6	223 aa		12.93	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	SSNA1	O43805	119 aa		12.93	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	ANGPTL7	O43827	346 aa		12.93	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	12.93	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	CST4	P01036	141 aa		12.93	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	CRYAB	P02511	175 aa	Known RBP	12.93	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	C1QB	P02746	253 aa		12.93	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	NAT1	P18440	290 aa		12.93	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	BLVRB	P30043	206 aa	Predicted RBP	12.93	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	UBE2N	P61088	152 aa	Known RBP	12.93	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	HLX	Q14774	488 aa	Predicted RBP	12.93	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	ARL6IP1	Q15041	203 aa		12.93	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	SF3B4	Q15427	424 aa	Known RBP eCLIP	12.93	□□□□□ -0.34	2e-8	■■■■■ 30.8
ARRB1-208	ENST00000531012	GABRA6	Q16445	453 aa		12.93	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	RNASE10	Q5GAN6	216 aa	Known RBP	12.93	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	VWA1	Q6PCB0	445 aa		12.93	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	IDO2	Q6ZQW0	420 aa		12.93	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	SLC36A1	Q7Z2H8	476 aa		12.93	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	BPIFB2	Q8N4F0	458 aa		12.93	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	CSNK2A3	Q8NEV1	391 aa		12.93	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	PXT1	Q8NFP0	134 aa		12.93	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	BOD1	Q96IK1	185 aa		12.93	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	SLC25A21	Q9BQT8	299 aa	Predicted RBP	12.93	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	SEC22C	Q9BRL7	303 aa		12.93	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	PECR	Q9BY49	303 aa		12.93	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	POFUT1	Q9H488	388 aa		12.93	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	SLC2A8	Q9NY64	477 aa		12.93	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	IL36G	Q9NZH8	169 aa		12.93	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	GPR160	Q9UJ42	338 aa		12.93	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	SCP2D1	Q9UJQ7	156 aa		12.93	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	CA11	O75493	328 aa		12.93	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	LYZL6	O75951	148 aa		12.93	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	HTR3B	O95264	441 aa		12.93	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	PLAT	P00750	562 aa		12.93	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	CSTB	P04080	98 aa	Known RBP	12.93	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		12.93	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	HOXB1	P14653	301 aa	Predicted RBP	12.93	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	ZNF14	P17017	642 aa	Predicted RBP	12.93	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	COX5A	P20674	150 aa		12.93	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	CBX5	P45973	191 aa		12.93	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	PDZK1IP1	Q13113	114 aa		12.93	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	PRDX4	Q13162	271 aa		12.93	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	ZMYND11	Q15326	602 aa		12.93	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	TBC1D28	Q2M2D7	210 aa		12.93	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	OR52W1	Q6IF63	320 aa		12.93	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	C1orf162	Q8NEQ5	155 aa	Predicted RBP	12.93	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	ST8SIA4	Q92187	359 aa		12.93	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	WBP1	Q96G27	269 aa		12.93	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	GPR137	Q96N19	417 aa		12.93	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	SLC6A7	Q99884	636 aa		12.93	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	OCSTAMP	Q9BR26	566 aa		12.93	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	PAPOLG	Q9BWT3	736 aa	Known RBP	12.93	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	PLSCR4	Q9NRQ2	329 aa		12.93	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	PLEKHA6	Q9Y2H5	1048 aa		12.93	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	MEIKIN	A0A087WXM9	373 aa		12.92	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	IGKV1-12	A0A0C4DH73	117 aa		12.92	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	12.92	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	12.92	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	12.92	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	SERPINE3	A8MV23	424 aa		12.92	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012		J3QW42	95 aa		12.92	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	IGKV1D-12	P01611	117 aa		12.92	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	RLN1	P04808	185 aa		12.92	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	ANXA3	P12429	323 aa		12.92	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	CXCL3	P19876	107 aa		12.92	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	FOXF2	Q12947	444 aa		12.92	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	ARFRP1	Q13795	201 aa		12.92	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	PLEKHN1	Q494U1	663 aa	Predicted RBP	12.92	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	ZNF626	Q68DY1	528 aa		12.92	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	INO80C	Q6PI98	192 aa	Predicted RBP	12.92	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	SEZ6L2	Q6UXD5	910 aa		12.92	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	RFPL4B	Q6ZWI9	263 aa		12.92	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	SPACA3	Q8IXA5	215 aa		12.92	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	FTMT	Q8N4E7	242 aa		12.92	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	OR5L1	Q8NGL2	311 aa		12.92	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	12.92	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	PRRT1	Q99946	306 aa		12.92	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	EIF3K	Q9UBQ5	218 aa	Known RBP	12.92	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	ZNF222	Q9UK12	451 aa		12.92	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	CELSR3	Q9NYQ7	3312 aa		12.92	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	PQLC2L	A1A4F0	135 aa		12.91	□□□□□ -0.34
ARRB1-208	ENST00000531012	CD300LB	A8K4G0	201 aa		12.91	□□□□□ -0.34

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