RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 PRRT1Q99946 306 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 GON7Q9BXV9 100 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 TRAV17A0A0B4J275 112 aa7.1□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 UBE2QL1A1L167 161 aa7.1□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa7.1□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 CEACAM4O75871 244 aa7.1□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 NRASP01111 189 aa7.1□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 HLA-HP01893 362 aa7.1□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 CPT2P23786 658 aa7.1□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 ARR3P36575 388 aa7.1□□□□□ -1.27
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PDE4D-208ENST00000502484 NLRC3Q7RTR2 1065 aa7.1□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 C9orf62Q8N4C0 152 aa7.1□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 OR10K1Q8NGX5 313 aa7.1□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 TECTBQ96PL2 329 aa7.1□□□□□ -1.27
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PDE4D-208ENST00000502484 G3V3Q6 166 aa7.1□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 RAD51DO75771 328 aa7.1□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 HRH1P35367 487 aa7.1□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 CBX5P45973 191 aa7.1□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 PRSS12P56730 875 aa7.1□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 RAB1AP62820 205 aa7.1□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 ARL6IP1Q15041 203 aa7.1□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 FBXW9Q5XUX1 488 aa7.1□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 ASCL4Q6XD76 172 aa7.1□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 CD163Q86VB7 1156 aa7.1□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 OR11H4Q8NGC9 324 aa7.1□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 CCDC107Q8WV48 283 aa7.1□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 SNAPC3Q92966 411 aa7.1□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 BORCS8Q96FH0 119 aa7.1□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 CHST6Q9GZX3 395 aa7.1□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 POFUT1Q9H488 388 aa7.1□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 C12orf49Q9H741 205 aa7.1□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 CA10Q9NS85 328 aa7.1□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 MGAT4AQ9UM21 535 aa7.1□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 IGSF10Q6WRI0 2623 aa7.1□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa7.09□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 KALRNO60229 2985 aa7.09□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 CA11O75493 328 aa7.09□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 OR2A4O95047 310 aa7.09□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 GIPP09681 153 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM225BP0DP42 221 aa7.09□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 CD79AP11912 226 aa7.09□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 DNASE1P24855 282 aa7.09□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 MPGP29372 298 aa7.09□□□□□ -1.27
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PDE4D-208ENST00000502484 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 OR1K1Q8NGR3 316 aa7.09□□□□□ -1.27
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PDE4D-208ENST00000502484 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 ST8SIA4Q92187 359 aa7.09□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 MRGPRFQ96AM1 343 aa7.09□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 Q96M66 194 aa7.09□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 OR2A7Q96R45 310 aa7.09□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 PECRQ9BY49 303 aa7.09□□□□□ -1.27
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PDE4D-208ENST00000502484 GLRX2Q9NS18 164 aa7.09□□□□□ -1.27
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PDE4D-208ENST00000502484 C5orf49A4QMS7 147 aa7.09□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 SERPINE3A8MV23 424 aa7.09□□□□□ -1.27
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PDE4D-208ENST00000502484 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
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PDE4D-208ENST00000502484 NDUFA5Q16718 116 aa7.09□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 ACTBL2Q562R1 376 aa7.09□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 RTL6Q6ICC9 239 aa7.09□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 ZDHHC22Q8N966 263 aa7.09□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 PXT1Q8NFP0 134 aa7.09□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 OR2AK2Q8NG84 335 aa7.09□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 OR4K15Q8NH41 348 aa7.09□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 POM121L2Q96KW2 1035 aa7.09□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 SLC7A11Q9UPY5 501 aa7.09□□□□□ -1.27
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