RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561524.5

KIFC3-208, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 4

Gene KIFC3, Length 577 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-208	ENST00000561524	TCEANC	Q8N8B7	351 aa		13.76	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	C8orf46	Q8TAG6	207 aa		13.76	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	FAM81A	Q8TBF8	368 aa		13.76	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	GATAD2B	Q8WXI9	593 aa		13.76	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	ST8SIA4	Q92187	359 aa		13.76	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	RPL3L	Q92901	407 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	ZDHHC16	Q969W1	377 aa		13.76	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	MED30	Q96HR3	178 aa		13.76	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	DUX5	Q96PT3	197 aa		13.76	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	OR51I2	Q9H344	312 aa		13.76	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	MOB1A	Q9H8S9	216 aa		13.76	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	DNAJB11	Q9UBS4	358 aa		13.76	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	COPS3	Q9UNS2	423 aa		13.76	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524		A0A1B0GVI7	797 aa		13.75	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	SRSF10	O75494	262 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	DHRS3	O75911	302 aa		13.75	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	AMY2B	P19961	511 aa		13.75	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	EPHA2	P29317	976 aa		13.75	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	LRRC10	Q5BKY1	277 aa		13.75	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	SHISA2	Q6UWI4	295 aa		13.75	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	C1orf122	Q6ZSJ8	110 aa		13.75	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524		Q6ZSR3	168 aa		13.75	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	KCTD8	Q6ZWB6	473 aa		13.75	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	THAP5	Q7Z6K1	395 aa		13.75	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	KIR3DL3	Q8N743	410 aa		13.75	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	ZNF671	Q8TAW3	534 aa		13.75	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	FGF23	Q9GZV9	251 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	ADGRL4	Q9HBW9	690 aa		13.75	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	GPR84	Q9NQS5	396 aa		13.75	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	ACOXL	Q9NUZ1	547 aa		13.75	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	CLN6	Q9NWW5	311 aa		13.75	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	SOX21	Q9Y651	276 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	POMT1	Q9Y6A1	747 aa		13.75	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	IGHV1-69D	A0A0B4J2H0	117 aa		13.74	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	DHRS7C	A6NNS2	312 aa		13.74	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	PRR32	B1ATL7	298 aa		13.74	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	PSMD9	O00233	223 aa		13.74	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	MITF	O75030	526 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	IGHV1-69	P01742	117 aa		13.74	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	TTR	P02766	147 aa		13.74	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	CAV3	P56539	151 aa		13.74	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	CXCR4	P61073	352 aa		13.74	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	ARF6	P62330	175 aa		13.74	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	TMED1	Q13445	227 aa		13.74	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	ZNF322	Q6U7Q0	402 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	SLC35F2	Q8IXU6	374 aa		13.74	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	CMTM4	Q8IZR5	234 aa		13.74	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	ANGPTL6	Q8NI99	470 aa		13.74	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	OR51E1	Q8TCB6	317 aa		13.74	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	NPRL2	Q8WTW4	380 aa		13.74	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	CENPN	Q96H22	339 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	DCTN5	Q9BTE1	182 aa		13.74	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	WDR13	Q9H1Z4	485 aa		13.74	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	RASL12	Q9NYN1	266 aa		13.74	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	WARS2	Q9UGM6	360 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	ENPP5	Q9UJA9	477 aa		13.74	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	IKZF2	Q9UKS7	526 aa		13.74	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	MMP24	Q9Y5R2	645 aa		13.74	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524		A0A1B0GUS0	222 aa		13.73	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	NKX6-3	A6NJ46	265 aa		13.73	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	ZNF732	B4DXR9	585 aa		13.73	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	ZNF670-ZNF695	F2Z2N8	137 aa		13.73	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	AKR7A2	O43488	359 aa		13.73	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	ACAA1	P09110	424 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	GLRA1	P23415	457 aa		13.73	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	GPM6A	P51674	278 aa		13.73	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	ELMOD2	Q8IZ81	293 aa		13.73	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	FAM216B	Q8N7L0	139 aa		13.73	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	LRTOMT	Q8WZ04	291 aa		13.73	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	LHX4	Q969G2	390 aa		13.73	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	SEH1L	Q96EE3	360 aa		13.73	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	GABARAPL3	Q9BY60	117 aa		13.73	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	NLK	Q9UBE8	527 aa		13.73	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	SNX5	Q9Y5X3	404 aa		13.73	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524		R4GMQ9	66 aa		13.73	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	MDFIC2	A0A1B0GVS7	189 aa		13.72	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524		A0A1B0GW55	424 aa		13.72	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	OR2AT4	A6NND4	320 aa		13.72	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	LOC110117498-PIK3R3	F6TDL0	507 aa		13.72	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	DLGAP1	O14490	977 aa		13.72	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	SIGLEC5	O15389	551 aa		13.72	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	NRAS	P01111	189 aa		13.72	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	MELTF	P08582	738 aa		13.72	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	DUX4L2	P0CJ85	424 aa		13.72	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	DUX4L3	P0CJ86	424 aa		13.72	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	DUX4L4	P0CJ87	422 aa		13.72	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	DUX4L5	P0CJ88	424 aa		13.72	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	DUX4L6	P0CJ89	424 aa		13.72	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	DUX4L7	P0CJ90	424 aa		13.72	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	ELF3	P78545	371 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	GUCA2A	Q02747	115 aa		13.72	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	RUSC1-AS1	Q66K80	236 aa		13.72	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	TMEM42	Q69YG0	159 aa		13.72	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	DUX4L9	Q6RFH8	374 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	BCDIN3D	Q7Z5W3	292 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	AMIGO2	Q86SJ2	522 aa		13.72	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	COMMD2	Q86X83	199 aa		13.72	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	OR5T2	Q8NGG2	359 aa		13.72	□□□□□ -0.21

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