RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558376.5

RABGGTA-204, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTA, Length 1,883 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-204ENST00000558376 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 SLC6A9P48067 706 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 LMO4P61968 165 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 HSD17B12Q53GQ0 312 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 DMRTC1Q5HYR2 192 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 BCL2L15Q5TBC7 163 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 OR51E1Q8TCB6 317 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 GPR148Q8TDV2 347 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 FAM216AQ8WUB2 273 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 YIPF5Q969M3 257 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 TMEM106AQ96A25 262 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 MS4A3Q96HJ5 214 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 GFI1Q99684 422 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 OR2H1Q9GZK4 316 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 WNT5BQ9H1J7 359 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 MMP27Q9H306 513 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 RNF121Q9H920 327 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 B3GNT2Q9NY97 397 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 A0A0B4J203 849 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 RGS5O15539 181 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 GATBO75879 557 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 MAS1P04201 325 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 MSMBP08118 114 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 ACSM4P0C7M7 580 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 CD79AP11912 226 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 PRSS12P56730 875 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 MOGQ16653 247 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 IDNKQ5T6J7 187 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 ASPHD2Q6ICH7 369 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 PRSS45Q7RTY3 260 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 LRP11Q86VZ4 500 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 ELMOD2Q8IZ81 293 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 DNAAF1Q8NEP3 725 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 OR8B12Q8NGG6 310 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 OR1F12Q8NHA8 337 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 ZNF75AQ96N20 296 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 KCNJ15Q99712 375 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 PCDHB10Q9UN67 800 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 A0A0G2JK05 382 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 FARS2O95363 451 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 ALDH3B1P43353 468 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 MTNR1BP49286 362 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 EVX1P49640 407 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 HILS1P60008 231 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 RHOUQ7L0Q8 258 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 SNX29P2Q8IUI4 249 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 DTX3Q8N9I9 347 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 RDH5Q92781 318 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 SYT3Q9BQG1 590 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 COMMD3Q9UBI1 195 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 DAPK2Q9UIK4 370 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 A0A1B0GTI1 187 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 M0R233 179 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 TBX1O43435 398 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 ARL6IP5O75915 188 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 PAHP00439 452 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 ZNF35P13682 527 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 ADRA2CP18825 462 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 RAB3BP20337 219 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 CCNOP22674 350 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 MYL9P24844 172 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 DCTDP32321 178 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 RAB1AP62820 205 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 GRB2P62993 217 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 SNAI3Q3KNW1 292 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 LAX1Q8IWV1 398 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 OR13C3Q8NGS6 347 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 FGGYQ96C11 551 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 FAHD2AQ96GK7 314 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 ABCB9Q9NP78 766 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 GPR84Q9NQS5 396 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 FZR1Q9UM11 496 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 DHDHQ9UQ10 334 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 LOC100509620A0A075B734 347 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 LOC105371242A0A075B767 164 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 OR6C6A6NF89 314 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 TRIM77I1YAP6 450 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 M0R135 149 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 RP2O75695 350 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 ISG15P05161 165 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 EPHA1P21709 976 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTA-204ENST00000558376 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.6 ms