RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556247.1

LRP1-210, Transcript of LDL receptor related protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene LRP1, Length 611 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Exosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1-210ENST00000556247 VHLLQ6RSH7 139 aa14.68□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 SLC22A25Q6T423 547 aa14.68□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa14.68□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 CMTM4Q8IZR5 234 aa14.68□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 OR8G5Q8NG78 346 aa14.68□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 OR5A2Q8NGI9 324 aa14.68□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 ZFAND2BQ8WV99 257 aa14.68□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa14.68□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 RNF170Q96K19 258 aa14.68□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 MICU1Q9BPX6 476 aa14.68□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 TMEM100Q9NV29 134 aa14.68□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 RHBDL2Q9NX52 303 aa14.68□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 GHRLQ9UBU3 117 aa14.68□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 FZR1Q9UM11 496 aa14.68□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 NBASA2RRP1 2371 aa14.67□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa14.67□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 TUBAL3A6NHL2 446 aa14.67□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 LILRA1O75019 489 aa14.67□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 TMEM225BP0DP42 221 aa14.67□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 CD40LGP29965 261 aa14.67□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 SELENOVP59797 346 aa14.67□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 ALKBH6Q3KRA9 238 aa14.67□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 NCMAPQ5T1S8 102 aa14.67□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 NUP37Q8NFH4 326 aa14.67□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 OR4M1Q8NGD0 313 aa14.67□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 OR5D18Q8NGL1 313 aa14.67□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 OR8S1Q8NH09 359 aa14.67□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 OR5P3Q8WZ94 311 aa14.67□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 ABCG5Q9H222 651 aa14.67□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 KCNK15Q9H427 330 aa14.67□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 DUSP13Q9UII6 198 aa14.67□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 RAB22AQ9UL26 194 aa14.67□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 PQLC2LA1A4F0 135 aa14.66□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 VSTM5A8MXK1 200 aa14.66□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 ZNF732B4DXR9 585 aa14.66□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 ZNF250P15622 560 aa14.66□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 TFF3Q07654 80 aa14.66□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 MADCAM1Q13477 382 aa14.66□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 IL18Q14116 193 aa14.66□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 OR8G1Q15617 311 aa14.66□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 DTX3Q8N9I9 347 aa14.66□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 PTX4Q96A99 478 aa14.66□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 PHF21AQ96BD5 680 aa14.66□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 SLC25A38Q96DW6 304 aa14.66□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 PLPPR2Q96GM1 343 aa14.66□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 RTL8AQ9BWD3 113 aa14.66□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 SLC22A4Q9H015 551 aa14.66□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 ATG5Q9H1Y0 275 aa14.66□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 POU2F3Q9UKI9 436 aa14.66□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 V9GYH0 126 aa14.66□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa14.65□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 OR5B21A6NL26 309 aa14.65□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 LDLRAD4O15165 306 aa14.65□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 C1QL1O75973 258 aa14.65□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 CD3EP07766 207 aa14.65□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 NAT2P11245 290 aa14.65□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 RAB6AP20340 208 aa14.65□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 ALDH3B1P43353 468 aa14.65□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 MMP15P51511 669 aa14.65□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 GPM6AP51674 278 aa14.65□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 GNG3P63215 75 aa14.65□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 PLA2G7Q13093 441 aa14.65□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 PYDC2Q56P42 97 aa14.65□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 C16orf87Q6PH81 154 aa14.65□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 CRIP3Q6Q6R5 217 aa14.65□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa14.65□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 OR2W3Q7Z3T1 314 aa14.65□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 KCNG3Q8TAE7 436 aa14.65□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 TMEM171Q8WVE6 324 aa14.65□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 HPSE2Q8WWQ2 592 aa14.65□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 ITPKCQ96DU7 683 aa14.65□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 SOSTQ9BQB4 213 aa14.65□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 METTL9Q9H1A3 318 aa14.65□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 DIABLOQ9NR28 239 aa14.65□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 FBLN5Q9UBX5 448 aa14.65□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 RABL2BQ9UNT1 228 aa14.65□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 NBEAQ8NFP9 2946 aa14.65□□□□□ -0.06
LRP1-210ENST00000556247 METTL21EPA6NDL7 271 aa14.64□□□□□ -0.07
LRP1-210ENST00000556247 PLATP00750 562 aa14.64□□□□□ -0.07
LRP1-210ENST00000556247 IGHV3-13P01766 116 aa14.64□□□□□ -0.07
LRP1-210ENST00000556247 VSIG8P0DPA2 414 aa14.64□□□□□ -0.07
LRP1-210ENST00000556247 PITPNBP48739 271 aa14.64□□□□□ -0.07
LRP1-210ENST00000556247 EFNB2P52799 333 aa14.64□□□□□ -0.07
LRP1-210ENST00000556247 ZP1P60852 638 aa14.64□□□□□ -0.07
LRP1-210ENST00000556247 PDZK1IP1Q13113 114 aa14.64□□□□□ -0.07
LRP1-210ENST00000556247 BEX5Q5H9J7 111 aa14.64□□□□□ -0.07
LRP1-210ENST00000556247 OR10K2Q6IF99 312 aa14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59 ms