RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373779.7

PTPRU-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,579 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-202ENST00000373779 LCN15Q6UWW0 184 aa15.52■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 SIT1Q9Y3P8 196 aa15.52■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 DHRS3O75911 302 aa15.52■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 BGLAPP02818 100 aa15.52■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 PPIAP62937 165 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 SSX2Q16385 188 aa15.52■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa15.52■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 MCHR2Q969V1 340 aa15.52■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 CKAP5Q14008 2032 aa15.52■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 SPINT1O43278 529 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 CXCL13O43927 109 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 SLC37A1P57057 533 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 ZNF321PQ8N8H1 164 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 SCN3AQ9NY46 2000 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 FUT6P51993 359 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 TUSC1Q2TAM9 212 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 KCNE4Q8WWG9 221 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 GABRA2P47869 451 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 SLC25A38Q96DW6 304 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 GNG12Q9UBI6 72 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 C2CD4DB7Z1M9 353 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 GLAP06280 429 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 THNSL2Q86YJ6 484 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 UQCC1Q9NVA1 299 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 SHISA3A0PJX4 238 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 NMBP08949 121 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 KITLGP21583 273 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 KIR3DL2P43630 455 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 OR10G3Q8NGC4 313 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 OR4A16Q8NH70 328 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 ZNF345Q14585 488 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 DCAF12L2Q5VW00 463 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 CLEC18BQ6UXF7 455 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 C6orf201Q7Z4U5 140 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 RDH5Q92781 318 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 UHRF2Q96PU4 802 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 MED9Q9NWA0 146 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 RNF150Q9ULK6 438 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 TO15178 435 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 SRFP11831 508 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 PTGER4P35408 488 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 SSX9Q7RTT3 188 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 AKR7LQ8NHP1 331 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 B3GAT1Q9P2W7 334 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 FBXL17Q9UF56 701 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 GPR160Q9UJ42 338 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 GGNBP1Q5YKI7 109 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 ZNF787Q6DD87 383 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 OVCH2Q7RTZ1 564 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 FBXL14Q8N1E6 418 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 CFDP00746 253 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 NQO2P16083 231 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 IFI44Q8TCB0 444 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 ARV1Q9H2C2 271 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 C5orf49A4QMS7 147 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 CYB5BO43169 146 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 NAT1P18440 290 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 LINC00696Q6ZRV3 163 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 ANKRD37Q7Z713 158 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 OR8B12Q8NGG6 310 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 RTL8AQ9BWD3 113 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 PLSCR5A0PG75 271 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 ARGFXA6NJG6 315 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 ACTL6BO94805 426 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 HAAOP46952 286 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 TBC1D28Q2M2D7 210 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 TMEM41BQ5BJD5 291 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 SPANXN5Q5MJ07 72 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 OR1F12Q8NHA8 337 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 TVP23CQ96ET8 276 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 CCDC74BQ96LY2 380 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 TNFSF18Q9UNG2 199 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 BTBD17A6NE02 478 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 PPP5D1E7EU14 171 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 PIAS2O75928 621 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 MITD1Q8WV92 249 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 KCNE5Q9UJ90 142 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 ZNF727A8MUV8 499 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 RPS2P15880 293 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 TMEM68Q96MH6 324 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.3 ms