RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330334.7

HDDC3-201, Transcript of HD domain containing 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HDDC3, Length 1,047 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3-201ENST00000330334 ATP5HO75947 161 aa14.63□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 ACTR3P61158 418 aa14.63□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa14.63□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 AADACL4Q5VUY2 407 aa14.63□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 SLX4IPQ5VYV7 408 aa14.63□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 NXNL2Q5VZ03 156 aa14.63□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 KDM4DQ6B0I6 523 aa14.63□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 ZNF788Q6ZQV5 615 aa14.63□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa14.63□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 CMTM4Q8IZR5 234 aa14.63□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 FAM216BQ8N7L0 139 aa14.63□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 ANGPTL6Q8NI99 470 aa14.63□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 NPRL2Q8WTW4 380 aa14.63□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 SSMEM1Q8WWF3 244 aa14.63□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 TMIGD2Q96BF3 282 aa14.63□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 SEH1LQ96EE3 360 aa14.63□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 DCTN5Q9BTE1 182 aa14.63□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 PBOV1Q9GZY1 135 aa14.63□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 WDR13Q9H1Z4 485 aa14.63□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 OR51I2Q9H344 312 aa14.63□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 DNAJB11Q9UBS4 358 aa14.63□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 ENOPH1Q9UHY7 261 aa14.63□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 A0A1B0GW55 424 aa14.62□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 OR5B21A6NL26 309 aa14.62□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 ZAR1LA6NP61 321 aa14.62□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 MELTFP08582 738 aa14.62□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 DUX4L2P0CJ85 424 aa14.62□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 DUX4L3P0CJ86 424 aa14.62□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 DUX4L4P0CJ87 422 aa14.62□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 DUX4L5P0CJ88 424 aa14.62□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 DUX4L6P0CJ89 424 aa14.62□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 DUX4L7P0CJ90 424 aa14.62□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 FASP25445 335 aa14.62□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 RIDAP52758 137 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa14.62□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 KCTD8Q6ZWB6 473 aa14.62□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa14.62□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 OR5T2Q8NGG2 359 aa14.62□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 ZNF671Q8TAW3 534 aa14.62□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 TBC1D15Q8TC07 691 aa14.62□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 TMEM163Q8TC26 289 aa14.62□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 LHX4Q969G2 390 aa14.62□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 GPR84Q9NQS5 396 aa14.62□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 KRT84Q9NSB2 600 aa14.62□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 DUX4Q9UBX2 424 aa14.62□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 COPS3Q9UNS2 423 aa14.62□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 AP4S1Q9Y587 144 aa14.62□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 FAM181BA6NEQ2 426 aa14.61□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 PRR32B1ATL7 298 aa14.61□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 PSMD9O00233 223 aa14.61□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 SIGLEC5O15389 551 aa14.61□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 AKR7A2O43488 359 aa14.61□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 GPM6AP51674 278 aa14.61□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 CAV3P56539 151 aa14.61□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 C12orf73Q69YU5 71 aa14.61□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 VMO1Q7Z5L0 202 aa14.61□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 THAP5Q7Z6K1 395 aa14.61□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 LDLRAD3Q86YD5 345 aa14.61□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 FGFRL1Q8N441 504 aa14.61□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 OR51E1Q8TCB6 317 aa14.61□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa14.61□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 MOB1AQ9H8S9 216 aa14.61□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 RASL12Q9NYN1 266 aa14.61□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 NLKQ9UBE8 527 aa14.61□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa14.61□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 NKX6-3A6NJ46 265 aa14.6□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 OR2AT4A6NND4 320 aa14.6□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 ZNF732B4DXR9 585 aa14.6□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 DHRS3O75911 302 aa14.6□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 NDUFA7O95182 113 aa14.6□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 CRYBA1P05813 215 aa14.6□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 FCGR1AP12314 374 aa14.6□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 EPHA2P29317 976 aa14.6□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 GUCA2AQ02747 115 aa14.6□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 EGR3Q06889 387 aa14.6□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 IKZF1Q13422 519 aa14.6□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 Q6ZSR3 168 aa14.6□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 TCEANCQ8N8B7 351 aa14.6□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 OR4F5Q8NH21 305 aa14.6□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 DYRK2Q92630 601 aa14.6□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 GAFA1Q96PS6 74 aa14.6□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 CHIAQ9BZP6 476 aa14.6□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 ADGRL4Q9HBW9 690 aa14.6□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 SNTG1Q9NSN8 517 aa14.6□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 CLN6Q9NWW5 311 aa14.6□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 ENPP5Q9UJA9 477 aa14.6□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 IKZF2Q9UKS7 526 aa14.6□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 DHRS7CA6NNS2 312 aa14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.6 ms