RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000625282.2

SPTAN1-210, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, humanhuman

TSL 2

Gene SPTAN1, Length 4,102 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1-210ENST00000625282 RTL6Q6ICC9 239 aa8.07□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 DNM1P46Q6ZS02 220 aa8.07□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 SFTPA1Q8IWL2 248 aa8.07□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 TMEM183AQ8IXX5 376 aa8.07□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 NPEPL1Q8NDH3 523 aa8.07□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 RCBTB1Q8NDN9 531 aa8.07□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 OR13D1Q8NGV5 346 aa8.07□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 OR2G3Q8NGZ4 309 aa8.07□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 LAMP3Q9UQV4 416 aa8.07□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 DNAH12Q6ZR08 3092 aa8.07□□□□□ -1.12
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SPTAN1-210ENST00000625282 C2CD4DB7Z1M9 353 aa8.06□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 ZNF878C9JN71 531 aa8.06□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 CLDN34H7C241 214 aa8.06□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 UPK3AO75631 287 aa8.06□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 METAP1P53582 386 aa8.06□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 DUSP8Q13202 625 aa8.06□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 GPR18Q14330 331 aa8.06□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 ANKRD55Q3KP44 614 aa8.06□□□□□ -1.12
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SPTAN1-210ENST00000625282 SLC48A1Q6P1K1 146 aa8.06□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 OR1P1Q8NH06 330 aa8.06□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 GPR119Q8TDV5 335 aa8.06□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 RNF128Q8TEB7 428 aa8.06□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 THRSPQ92748 146 aa8.06□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 ERGIC1Q969X5 290 aa8.06□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 LRRC3BQ96PB8 259 aa8.06□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 DIRC2Q96SL1 478 aa8.06□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 SLC26A1Q9H2B4 701 aa8.06□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 WDR76Q9H967 626 aa8.06□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 SLC17A5Q9NRA2 495 aa8.06□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
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SPTAN1-210ENST00000625282 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa8.06□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 CA11O75493 328 aa8.06□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 SEMA4FO95754 770 aa8.06□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 RENP00797 406 aa8.06□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 MMP9P14780 707 aa8.06□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 CXCR1P25024 350 aa8.06□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 AADACL3Q5VUY0 350 aa8.06□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 NPSR1Q6W5P4 371 aa8.06□□□□□ -1.12
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SPTAN1-210ENST00000625282 C5orf24Q7Z6I8 188 aa8.06□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 ALG14Q96F25 216 aa8.06□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa8.06□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 LPAR4Q99677 370 aa8.06□□□□□ -1.12
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SPTAN1-210ENST00000625282 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa8.06□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 AK3Q9UIJ7 227 aa8.06□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 PADI1Q9ULC6 663 aa8.06□□□□□ -1.12
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SPTAN1-210ENST00000625282 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 DANCRP0C864 163 aa8.06□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 MSX1P28360 303 aa8.06□□□□□ -1.12
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SPTAN1-210ENST00000625282 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 TMEM215Q68D42 235 aa8.06□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa8.06□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 ADGRG7Q96K78 797 aa8.06□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 PELI2Q9HAT8 420 aa8.06□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 FOXJ2Q9P0K8 574 aa8.06□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 ADAM29Q9UKF5 820 aa8.06□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 ZNF860A6NHJ4 632 aa8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 B4E171 279 aa8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 MPIG6BO95866 241 aa8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 EMP2P54851 167 aa8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 DCAF10Q5QP82 559 aa8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 TMEM268Q5VZI3 342 aa8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 FAM174AQ8TBP5 190 aa8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 LMLNQ96KR4 655 aa8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 C4orf45Q96LM5 186 aa8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 STACQ99469 402 aa8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 PARD6AQ9NPB6 346 aa8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 FKBP11Q9NYL4 201 aa8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 EHFQ9NZC4 300 aa8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 SPACA6W5XKT8 324 aa8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 A0A087WUJ7 227 aa8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 FUT3P21217 361 aa8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 HLA-DRB3P79483 266 aa8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 TAF9Q16594 264 aa8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 ZNF774Q6NX45 483 aa8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 MARCH3Q86UD3 253 aa8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 ZNF100Q8IYN0 542 aa8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 KLHDC7BQ96G42 594 aa8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 MRGPRX3Q96LB0 322 aa8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 GPER1Q99527 375 aa8.05□□□□□ -1.12
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