RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561524.5

KIFC3-208, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 4

Gene KIFC3, Length 577 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-208	ENST00000561524	EGR1	P18146	543 aa		13.8	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	MAP2K3	P46734	347 aa		13.8	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	PRDX4	Q13162	271 aa		13.8	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	PDCD1	Q15116	288 aa		13.8	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	SLC36A1	Q7Z2H8	476 aa		13.8	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	ZNF679	Q8IYX0	411 aa		13.8	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	OR8B4	Q96RC9	309 aa		13.8	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	MNT	Q99583	582 aa		13.8	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	GABARAPL1	Q9H0R8	117 aa		13.8	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	KRT84	Q9NSB2	600 aa		13.8	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	NBEAL1	Q6ZS30	2694 aa		13.79	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	TMEM269	A0A1B0GVZ9	245 aa		13.79	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	SLC22A31	A6NKX4	558 aa		13.79	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	ZNF850	A8MQ14	1090 aa		13.79	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	CDIPT	O14735	213 aa		13.79	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	TOX4	O94842	621 aa		13.79	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	IGLV3-1	P01715	115 aa		13.79	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	FCGR1A	P12314	374 aa		13.79	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	FAS	P25445	335 aa		13.79	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	HCCS	P53701	268 aa		13.79	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	CSNK2B	P67870	215 aa		13.79	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	SLC9A3R2	Q15599	337 aa		13.79	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	ZBTB37	Q5TC79	503 aa		13.79	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	METTL11B	Q5VVY1	283 aa		13.79	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	SLX4IP	Q5VYV7	408 aa		13.79	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	NXNL2	Q5VZ03	156 aa		13.79	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	KDM4D	Q6B0I6	523 aa		13.79	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	BTN2A1	Q7KYR7	527 aa		13.79	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	MEPCE	Q7L2J0	689 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	SGMS2	Q8NHU3	365 aa		13.79	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	PIGC	Q92535	297 aa		13.79	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	RNF170	Q96K19	258 aa		13.79	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	WDFY2	Q96P53	400 aa		13.79	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	PKP2	Q99959	881 aa		13.79	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	SIRPD	Q9H106	197 aa		13.79	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	PPP1R3E	Q9H7J1	279 aa		13.79	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	NOX4	Q9NPH5	578 aa		13.79	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	FAM206A	Q9NX38	181 aa		13.79	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	HAO2	Q9NYQ3	351 aa		13.79	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	RPUSD1	Q9UJJ7	312 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	AP4S1	Q9Y587	144 aa		13.79	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	ZNF816-ZNF321P	A0A0X1KG74	233 aa		13.78	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	ZAR1L	A6NP61	321 aa		13.78	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	PRKY	O43930	277 aa		13.78	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	FCN3	O75636	299 aa		13.78	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	TGM4	P49221	684 aa		13.78	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	ACTR3	P61158	418 aa		13.78	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	ZNF829	Q3KNS6	432 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	WDR38	Q5JTN6	314 aa		13.78	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	AADACL4	Q5VUY2	407 aa		13.78	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	C12orf73	Q69YU5	71 aa		13.78	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	ZDHHC13	Q8IUH4	622 aa		13.78	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	ZDHHC23	Q8IYP9	409 aa		13.78	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	SCCPDH	Q8NBX0	429 aa		13.78	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	LY6G5B	Q8NDX9	201 aa		13.78	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	HIST1H2AA	Q96QV6	131 aa		13.78	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	TBX15	Q96SF7	602 aa		13.78	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	CNN2	Q99439	309 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	PCGF1	Q9BSM1	259 aa		13.78	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		13.78	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	CNTD2	Q9H8S5	307 aa		13.78	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	H2AFY2	Q9P0M6	372 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	KPTN	Q9Y664	436 aa		13.78	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	IGHV3OR15-7	A0A075B7D8	119 aa		13.77	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	IGHV3OR16-10	A0A075B7F0	116 aa		13.77	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	CENPVL3	A0A0U1RRI6	287 aa		13.77	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	RIDA	P52758	137 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	GNG3	P63215	75 aa		13.77	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	RIPPLY1	Q0D2K3	151 aa		13.77	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	CEACAM21	Q3KPI0	293 aa		13.77	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	STUM	Q69YW2	141 aa		13.77	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	C16orf87	Q6PH81	154 aa		13.77	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	BRD3OS	Q6XYD6	125 aa		13.77	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524		Q6YL49	198 aa		13.77	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	TMEM86B	Q8N661	226 aa		13.77	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	OR5A2	Q8NGI9	324 aa		13.77	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	TMEM163	Q8TC26	289 aa		13.77	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	HPSE2	Q8WWQ2	592 aa		13.77	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	FAM71F1	Q96KD3	344 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	RAB3IP	Q96QF0	476 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	CCL13	Q99616	98 aa		13.77	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	ZNF747	Q9BV97	191 aa		13.77	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	OSBPL10	Q9BXB5	764 aa		13.77	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	PBOV1	Q9GZY1	135 aa		13.77	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	NUFIP1	Q9UHK0	495 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	OR5B21	A6NL26	309 aa		13.76	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	POM121C	A8CG34	1229 aa		13.76	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	NDUFB3	O43676	98 aa		13.76	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	MTRF1	O75570	445 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	SFTPB	P07988	381 aa		13.76	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	MRPL3	P09001	348 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	IL13RA1	P78552	427 aa		13.76	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	EGR3	Q06889	387 aa		13.76	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	POU4F2	Q12837	409 aa		13.76	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	DEFB112	Q30KQ8	113 aa		13.76	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	CDON	Q4KMG0	1287 aa		13.76	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	C1orf146	Q5VVC0	180 aa		13.76	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	METAP1D	Q6UB28	335 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	ZNF788	Q6ZQV5	615 aa		13.76	□□□□□ -0.21
KIFC3-208	ENST00000561524	GID4	Q8IVV7	300 aa		13.76	□□□□□ -0.21

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