RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479153.1

SUMO3-206, Transcript of small ubiquitin-like modifier 3, human

TSL 2

Gene SUMO3, Length 1,736 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SUMO3-206	ENST00000479153	JUNB	P17275	347 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	GABRA5	P31644	462 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	TNFAIP6	P98066	277 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	FABP5	Q01469	135 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	UBE2V2	Q15819	145 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	MS4A15	Q8N5U1	240 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	OR13C9	Q8NGT0	318 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	TRMT10A	Q8TBZ6	339 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	UBASH3B	Q8TF42	649 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	PIGT	Q969N2	578 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	TMIGD2	Q96BF3	282 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	ITPKC	Q96DU7	683 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	OR2V2	Q96R30	315 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	FGF23	Q9GZV9	251 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	TAS2R4	Q9NYW5	299 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	TREM2	Q9NZC2	230 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	ZDHHC8	Q9ULC8	765 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	MPC1	Q9Y5U8	109 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	NAV2	Q8IVL1	2488 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	TANC2	Q9HCD6	1990 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	ANXA2P2	A6NMY6	339 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153		H7C417	338 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	HPX	P02790	462 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	TFAP2A	P05549	437 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	CD36	P16671	472 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	DNASE1	P24855	282 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	MAB21L1	Q13394	359 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	ZBTB37	Q5TC79	503 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	PRAMEF6	Q5VXH4	476 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	TMEM42	Q69YG0	159 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	ASPHD2	Q6ICH7	369 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	TMEM91	Q6ZNR0	172 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	CEACAM19	Q7Z692	300 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	SERPINA12	Q8IW75	414 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	ITLN1	Q8WWA0	313 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	HPSE2	Q8WWQ2	592 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	PERP	Q96FX8	193 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	DERL3	Q96Q80	235 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	CHST5	Q9GZS9	411 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	SLC22A4	Q9H015	551 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	RAB1B	Q9H0U4	201 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	NOX4	Q9NPH5	578 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	DECR2	Q9NUI1	292 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	LOC100289279	A0A1B0GTE1	492 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	GABRP	O00591	440 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	PIN1P1	O15428	100 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	RGS9	O75916	674 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	SERPINA3	P01011	423 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	GRP	P07492	148 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	TNFSF4	P23510	183 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	THBS2	P35442	1172 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	TGFBR2	P37173	567 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	GPM6A	P51674	278 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	PARP16	Q8N5Y8	322 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	OR51A2	Q8NGJ7	313 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	PP6455	Q8WZ26	134 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	OR5P3	Q8WZ94	311 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	C10orf35	Q96D05	121 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	TRMT61A	Q96FX7	289 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	RNF170	Q96K19	258 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	HIST1H2AA	Q96QV6	131 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	OR51E2	Q9H255	320 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	PPIL3	Q9H2H8	161 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	ZCCHC4	Q9H5U6	513 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	SAP30L	Q9HAJ7	183 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	TRBV5-7	A0A0A0MS05	114 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	IGKV1-9	A0A0C4DH69	117 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	KIR2DP1	A0A0G2JNF4	349 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153		A0A1B0GWJ7	208 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	FAM230A	A0A1W2PPH8	454 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	ZNF732	B4DXR9	585 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	LYNX1	G3V0Z9	82 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	CDC14B	O60729	498 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	SC5D	O75845	299 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	OCM	P0CE72	109 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	LYNX1	P0DP58	116 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	GADD45A	P24522	165 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	TRAM1	Q15629	374 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	CEACAM21	Q3KPI0	293 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	UNQ9370/PRO34162	Q6UXP9	181 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	WDR86	Q86TI4	376 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	TGIF2LY	Q8IUE0	185 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	OR5D14	Q8NGL3	314 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	MEGF10	Q96KG7	1140 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	SPACA5	Q96QH8	159 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	DIRC2	Q96SL1	478 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	NKX3-1	Q99801	234 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	MICU1	Q9BPX6	476 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	CXXC4	Q9H2H0	198 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	EXOSC4	Q9NPD3	245 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	UFSP2	Q9NUQ7	469 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	IL19	Q9UHD0	177 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	SCOC	Q9UIL1	159 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	FBXO9	Q9UK97	447 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	NOTCH2	Q04721	2471 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	TRAV8-7	A0A075B6U6	113 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	GATB	O75879	557 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	IGHV4-39	P01824	125 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	ERCC1	P07992	297 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
SUMO3-206	ENST00000479153	ADH4	P08319	380 aa		11.11	□□□□□ -0.63

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