RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373779.7

PTPRU-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,579 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-202ENST00000373779 RER1O15258 196 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 OR1L3Q8NH93 324 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 F5P12259 2224 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 DEGS1O15121 323 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 CT45A8P0DMV1 189 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 CT45A9P0DMV2 189 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 GLULP15104 373 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 ELLP55199 621 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 FUT7Q11130 342 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 MIDNQ504T8 468 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 CT45A2Q5DJT8 189 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 TMEM92Q6UXU6 159 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 Q6ZS52 159 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 GAB2Q9UQC2 676 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 RAB27BO00194 218 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 CYB561P49447 251 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 LHFPL5Q8TAF8 219 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 ZNF576Q9H609 170 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 PATJQ8NI35 1801 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 C4orf51C9J302 202 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 ANGPTL7O43827 346 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 HLA-HP01893 362 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 OR8G2PQ6IF36 304 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 BRICD5Q6PL45 260 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 MRGPREQ86SM8 312 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 DMBX1Q8NFW5 382 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 FAM96BQ9Y3D0 163 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 ADAM10O14672 748 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 PTGFRP43088 359 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 SLC25A42Q86VD7 318 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 ASB10Q8WXI3 467 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 MYOTQ9UBF9 498 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 DTX4Q9Y2E6 619 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 IGKV1D-16P01601 117 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 NFYBP25208 207 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 GPR3P46089 330 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 GUK1Q16774 197 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 TMEM123Q8N131 208 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 ASB5Q8WWX0 329 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 METTL12A8MUP2 240 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 TNFSF11O14788 317 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 C9orf50Q5SZB4 431 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 SAMD10Q9BYL1 202 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 MAGT1Q9H0U3 335 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 A6NCN8 305 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 SCGB1D1O95968 90 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 CRHP06850 196 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 VSIG10L2P0DP72 767 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 RAB13P51153 203 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 FAM185AQ8N0U4 392 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 OR1J1Q8NGS3 322 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 IFT22Q9H7X7 185 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 ZFP64Q9NPA5 681 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 CCDC88CQ9P219 2028 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 TMEM218A2RU14 115 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 RNF212Q495C1 297 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 TMEM65Q6PI78 240 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 RPS4Y2Q8TD47 263 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 SARGQ9BW04 601 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 NMES1Q9C002 83 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 CHST6Q9GZX3 395 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 DOCK3Q8IZD9 2030 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 GPR31O00270 319 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 BATFQ16520 125 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 LTC4SQ16873 150 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 SYT13Q7L8C5 426 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 OR4D10Q8NGI6 311 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 ZNF426Q9BUY5 554 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 SERTAD4Q9NUC0 356 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 A0A1W2PQD3 144 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 DHODHQ02127 395 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 SP6Q3SY56 376 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 PDZD11Q5EBL8 140 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 RXFP4Q8TDU9 374 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 BTF3L4Q96K17 158 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 YKT6O15498 198 aa15.52■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 GALNSP34059 522 aa15.52■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 HYAL1Q12794 435 aa15.52■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 SLC25A26Q70HW3 274 aa15.52■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 SPSB1Q96BD6 273 aa15.52■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 APH1AQ96BI3 265 aa15.52■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 TM4SF19Q96DZ7 209 aa15.52■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 MYF5P13349 255 aa15.52■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 OR11H4Q8NGC9 324 aa15.52■□□□□ 0.08
PTPRU-202ENST00000373779 ADAP1O75689 374 aa15.52■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 EDN3P14138 238 aa15.52■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 B4GALT1P15291 398 aa15.52■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 CD46P15529 392 aa15.52■□□□□ 0.07
PTPRU-202ENST00000373779 GSK3AP49840 483 aa15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.9 ms