RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582821.5

GGA3-215, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 2

Gene GGA3, Length 1,018 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-215	ENST00000582821	TMEM246	Q9BRR3	403 aa		11.7	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	PBOV1	Q9GZY1	135 aa		11.7	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	RNPEPL1	Q9HAU8	725 aa		11.7	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	NUFIP1	Q9UHK0	495 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	IKZF2	Q9UKS7	526 aa		11.7	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		11.7	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	SRP14	P37108	136 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	GNAL	P38405	381 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	MAP2K3	P46734	347 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	IL5RA	Q01344	420 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	OCLN	Q16625	522 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	ZIK1	Q3SY52	487 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	FAM201A	Q5SY85	155 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	ZNF684	Q5T5D7	378 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	MEDAG	Q5VYS4	303 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	DCDC5	Q6ZRR9	648 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	ZBTB49	Q6ZSB9	765 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	OR1M1	Q8NGA1	313 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	UBE2F	Q969M7	185 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	ITPKC	Q96DU7	683 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	TMPRSS13	Q9BYE2	586 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	TLNRD1	Q9H1K6	362 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	IMPAD1	Q9NX62	359 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	MRM2	Q9UI43	246 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	AKAP8L	Q9ULX6	646 aa	Known RBP eCLIP	11.69	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821		R4GMQ9	66 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	ANXA2P2	A6NMY6	339 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	LGALS8	O00214	317 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	NDUFA2	O43678	99 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	SULT1C4	O75897	302 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	ZNF205	O95201	554 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	AVP	P01185	164 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	GRP	P07492	148 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	PSMB10	P40306	273 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	SEC61A1	P61619	476 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	LCN2	P80188	198 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	KCNJ8	Q15842	424 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	ESCO2	Q56NI9	601 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	ZBTB37	Q5TC79	503 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	DCAF12L2	Q5VW00	463 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821		Q6ZSR3	168 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	WDR86	Q86TI4	376 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	ELMOD2	Q8IZ81	293 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	RFLNB	Q8N5W9	214 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	OR5P3	Q8WZ94	311 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	PPP1R14A	Q96A00	147 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	MBOAT4	Q96T53	435 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	MICU1	Q9BPX6	476 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	PAPOLG	Q9BWT3	736 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	PPP1R3E	Q9H7J1	279 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	MOB1A	Q9H8S9	216 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	TRIM36	Q9NQ86	728 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	C1orf123	Q9NWV4	160 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	SNX5	Q9Y5X3	404 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	TRAV38-1	A0A0B4J264	116 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	ZNF816-ZNF321P	A0A0X1KG74	233 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821		A0A1W2PQL4	384 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	TMEM210	A6NLX4	147 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	ZNF850	A8MQ14	1090 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	LOC110117498-PIK3R3	F6TDL0	507 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	TRAPPC2L	H3BP13	241 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	MAGEB4	O15481	346 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	ENTPD6	O75354	484 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	TTR	P02766	147 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	KRT8	P05787	483 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	RPS2	P15880	293 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	GABRB1	P18505	474 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	ATP6V1E1	P36543	226 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	MTNR1A	P48039	350 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	RIPPLY1	Q0D2K3	151 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	ZNF154	Q13106	437 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	PRDX4	Q13162	271 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	ZNF826P	Q6ZT77	177 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	NLRC3	Q7RTR2	1065 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	SSX6	Q7RTT6	188 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	GCSAM	Q8N6F7	178 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	OR51E1	Q8TCB6	317 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	PIGC	Q92535	297 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	RDH12	Q96NR8	316 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	MDFI	Q99750	246 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	RTL8A	Q9BWD3	113 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	C7orf69	Q9H7B7	122 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	GPR84	Q9NQS5	396 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	MMP26	Q9NRE1	261 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	METRN	Q9UJH8	293 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	OR52A1	Q9UKL2	312 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	GMPPB	Q9Y5P6	360 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	INSIG2	Q9Y5U4	225 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	OOEP	A6NGQ2	149 aa		11.66	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	METTL15	A6NJ78	407 aa		11.66	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821		A6NLC8	198 aa		11.66	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	SNTN	A6NMZ2	147 aa		11.66	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821		J3QRE1	110 aa		11.66	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	SLC16A6	O15403	523 aa		11.66	□□□□□ -0.54
GGA3-215	ENST00000582821	MPZL2	O60487	215 aa		11.66	□□□□□ -0.54

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