RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 RNFT2Q96EX2 444 aa10.56□□□□□ -0.72
PRAME-212ENST00000485532 COG8Q96MW5 612 aa10.56□□□□□ -0.72
PRAME-212ENST00000485532 SLC30A2Q9BRI3 323 aa10.56□□□□□ -0.72
PRAME-212ENST00000485532 TMEM246Q9BRR3 403 aa10.56□□□□□ -0.72
PRAME-212ENST00000485532 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP10.56□□□□□ -0.72
PRAME-212ENST00000485532 ZNF696Q9H7X3 374 aa10.56□□□□□ -0.72
PRAME-212ENST00000485532 OR5V1Q9UGF6 321 aa10.56□□□□□ -0.72
PRAME-212ENST00000485532 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
PRAME-212ENST00000485532 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa10.56□□□□□ -0.72
PRAME-212ENST00000485532 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP10.56□□□□□ -0.72
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PRAME-212ENST00000485532 SLC18B1Q6NT16 456 aa10.54□□□□□ -0.72
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PRAME-212ENST00000485532 TMEM100Q9NV29 134 aa10.54□□□□□ -0.72
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PRAME-212ENST00000485532 BLVRAP53004 296 aa10.53□□□□□ -0.72
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PRAME-212ENST00000485532 ZNF404Q494X3 552 aa10.53□□□□□ -0.72
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PRAME-212ENST00000485532 BRD3OSQ6XYD6 125 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-212ENST00000485532 OR52I1Q8NGK6 324 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-212ENST00000485532 RAB40AQ8WXH6 277 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-212ENST00000485532 INTS14Q96SY0 518 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-212ENST00000485532 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
PRAME-212ENST00000485532 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
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