RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617119.4

UBE2V1-223, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 V1, human

TSL 4 BASIC

Gene UBE2V1, Length 2,432 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBE2V1-223	ENST00000617119	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		10.28	□□□□□ -0.76
UBE2V1-223	ENST00000617119	NEMF	O60524	1076 aa		10.28	□□□□□ -0.76
UBE2V1-223	ENST00000617119	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		10.28	□□□□□ -0.76
UBE2V1-223	ENST00000617119	KRT32	Q14532	448 aa		10.28	□□□□□ -0.76
UBE2V1-223	ENST00000617119	TNNI3K	Q59H18	835 aa		10.28	□□□□□ -0.76
UBE2V1-223	ENST00000617119	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
UBE2V1-223	ENST00000617119	ARMCX5	Q6P1M9	558 aa		10.28	□□□□□ -0.76
UBE2V1-223	ENST00000617119	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
UBE2V1-223	ENST00000617119	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		10.28	□□□□□ -0.76
UBE2V1-223	ENST00000617119	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		10.28	□□□□□ -0.76
UBE2V1-223	ENST00000617119	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		10.28	□□□□□ -0.76
UBE2V1-223	ENST00000617119	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.76
UBE2V1-223	ENST00000617119	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.76
UBE2V1-223	ENST00000617119	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.76
UBE2V1-223	ENST00000617119	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.76
UBE2V1-223	ENST00000617119	FSIP1	Q8NA03	581 aa		10.27	□□□□□ -0.76
UBE2V1-223	ENST00000617119	ERO1A	Q96HE7	468 aa		10.27	□□□□□ -0.76
UBE2V1-223	ENST00000617119	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		10.27	□□□□□ -0.76
UBE2V1-223	ENST00000617119	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	10.27	□□□□□ -0.76
UBE2V1-223	ENST00000617119		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.76
UBE2V1-223	ENST00000617119	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		10.27	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	CTAGE5	O15320	804 aa		10.27	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	GCKR	Q14397	625 aa		10.27	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		10.27	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	TSPYL1	Q9H0U9	437 aa		10.27	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		10.27	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		10.27	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	NPHP1	O15259	732 aa		10.26	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	FANCG	O15287	622 aa		10.26	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	FDPS	P14324	419 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	CCDC93	Q567U6	631 aa		10.26	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	PPP1R13B	Q96KQ4	1090 aa		10.26	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		10.26	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	L2HGDH	Q9H9P8	463 aa		10.26	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	ANO10	Q9NW15	660 aa		10.26	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	EID1	Q9Y6B2	187 aa		10.26	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		10.26	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119		A0A1B0GVL5	298 aa		10.26	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	ERICH4	A6NGS2	130 aa		10.26	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	BECN2	A8MW95	431 aa		10.26	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	SLU7	O95391	586 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	NDUFA8	P51970	172 aa		10.26	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		10.26	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	CCDC73	Q6ZRK6	1079 aa		10.26	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		10.26	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	XPO4	Q9C0E2	1151 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	COPRS	Q9NQ92	184 aa		10.26	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		10.25	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	PALLD	Q8WX93	1383 aa		10.25	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	MYL6B	P14649	208 aa		10.25	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	ME1	P48163	572 aa		10.25	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	SLC39A6	Q13433	755 aa		10.25	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	ERCC6L	Q2NKX8	1250 aa		10.25	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		10.25	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	CHST3	Q7LGC8	479 aa		10.25	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	MYD88	Q99836	296 aa		10.25	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	HAUS7	Q99871	368 aa		10.25	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	CYP2C19	P33261	490 aa		10.25	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	NCAPH	Q15003	741 aa		10.25	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		10.25	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		10.25	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		10.25	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		10.25	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	HSD3B7	Q9H2F3	369 aa		10.25	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		10.25	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		10.25	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	FHOD1	Q9Y613	1164 aa		10.25	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	CLIC4	Q9Y696	253 aa		10.25	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		10.24	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	SYT10	Q6XYQ8	523 aa		10.24	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	IFNK	Q9P0W0	207 aa		10.24	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		10.24	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		10.24	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		10.24	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	TMC6	Q7Z403	805 aa		10.24	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		10.24	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	C4A	P0C0L4	1744 aa		10.23	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	C4B	P0C0L5	1744 aa		10.23	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119		E7EWF7	191 aa		10.23	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		10.23	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	COPS6	Q7L5N1	327 aa		10.23	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		10.23	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		10.23	□□□□□ -0.77
UBE2V1-223	ENST00000617119	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 91.2 ms