RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 CCDC178Q5BJE1 867 aa23.77■■□□□ 1.4
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PTPRJ-208ENST00000615445 WDR78Q5VTH9 848 aa23.77■■□□□ 1.4
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PTPRJ-208ENST00000615445 BMP15O95972 392 aa23.77■■□□□ 1.4
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PTPRJ-208ENST00000615445 CCDC102AQ96A19 550 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRJ-208ENST00000615445 FAM135BQ49AJ0 1406 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRJ-208ENST00000615445 CALML3P27482 149 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRJ-208ENST00000615445 TYRO3Q06418 890 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRJ-208ENST00000615445 AOPEPQ8N6M6 819 aa23.67■■□□□ 1.38
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