RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607681.1

HBP1-215, Transcript of HMG-box transcription factor 1, human

TSL 2

Gene HBP1, Length 476 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HBP1-215	ENST00000607681	PCBP4	P57723	403 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
HBP1-215	ENST00000607681	RACK1	P63244	317 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
HBP1-215	ENST00000607681	ATP11A	P98196	1134 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HBP1-215	ENST00000607681	CCDC85B	Q15834	202 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
HBP1-215	ENST00000607681	ZNF468	Q5VIY5	522 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
HBP1-215	ENST00000607681	ERMP1	Q7Z2K6	904 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HBP1-215	ENST00000607681	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HBP1-215	ENST00000607681	ASAP3	Q8TDY4	903 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HBP1-215	ENST00000607681	DRC1	Q96MC2	740 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HBP1-215	ENST00000607681	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HBP1-215	ENST00000607681	COPRS	Q9NQ92	184 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HBP1-215	ENST00000607681	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
HBP1-215	ENST00000607681	PPM1H	Q9ULR3	514 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HBP1-215	ENST00000607681	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HBP1-215	ENST00000607681		F6X3S4	739 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HBP1-215	ENST00000607681	GHRH	P01286	108 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HBP1-215	ENST00000607681	SIK1	P57059	783 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HBP1-215	ENST00000607681	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
HBP1-215	ENST00000607681	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HBP1-215	ENST00000607681	TMEM102	Q8N9M5	508 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
HBP1-215	ENST00000607681	PBX4	Q9BYU1	374 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HBP1-215	ENST00000607681	BHLHE41	Q9C0J9	482 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
HBP1-215	ENST00000607681	RBSN	Q9H1K0	784 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HBP1-215	ENST00000607681	SRA1	Q9HD15	236 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
HBP1-215	ENST00000607681	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HBP1-215	ENST00000607681	INPP5F	Q9Y2H2	1132 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HBP1-215	ENST00000607681	NFKBIE	O00221	500 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HBP1-215	ENST00000607681	PDE2A	O00408	941 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
HBP1-215	ENST00000607681	SIN3B	O75182	1162 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HBP1-215	ENST00000607681	CPB1	P15086	417 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HBP1-215	ENST00000607681	MX2	P20592	715 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HBP1-215	ENST00000607681	ITPKA	P23677	461 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HBP1-215	ENST00000607681	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
HBP1-215	ENST00000607681	GAS6	Q14393	721 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HBP1-215	ENST00000607681	MAP3K11	Q16584	847 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HBP1-215	ENST00000607681	SPRED3	Q2MJR0	410 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HBP1-215	ENST00000607681	NANOS1	Q8WY41	292 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
HBP1-215	ENST00000607681	NXPE3	Q969Y0	559 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HBP1-215	ENST00000607681	TRIM56	Q9BRZ2	755 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
HBP1-215	ENST00000607681	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
HBP1-215	ENST00000607681	NAGPA	Q9UK23	515 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HBP1-215	ENST00000607681	SLC6A14	Q9UN76	642 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HBP1-215	ENST00000607681		A0A096LPE4	126 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HBP1-215	ENST00000607681		A0A1W2PPZ6	126 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HBP1-215	ENST00000607681	CELA3A	P09093	270 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HBP1-215	ENST00000607681	MAP3K10	Q02779	954 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HBP1-215	ENST00000607681	PCSK7	Q16549	785 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HBP1-215	ENST00000607681	CEP135	Q66GS9	1140 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HBP1-215	ENST00000607681	FAM35A	Q86V20	835 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HBP1-215	ENST00000607681	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HBP1-215	ENST00000607681	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HBP1-215	ENST00000607681	TNFRSF25	Q93038	417 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HBP1-215	ENST00000607681	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HBP1-215	ENST00000607681	ZNF576	Q9H609	170 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HBP1-215	ENST00000607681	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HBP1-215	ENST00000607681	SMNDC1	O75940	238 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
HBP1-215	ENST00000607681	ARAF	P10398	606 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HBP1-215	ENST00000607681	ADH6	P28332	368 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HBP1-215	ENST00000607681	DNAJA1	P31689	397 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HBP1-215	ENST00000607681	ADH7	P40394	386 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HBP1-215	ENST00000607681	PAK2	Q13177	524 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HBP1-215	ENST00000607681	PERM1	Q5SV97	790 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HBP1-215	ENST00000607681	SV2B	Q7L1I2	683 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HBP1-215	ENST00000607681	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HBP1-215	ENST00000607681	UBXN4	Q92575	508 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HBP1-215	ENST00000607681	PLD4	Q96BZ4	506 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HBP1-215	ENST00000607681	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HBP1-215	ENST00000607681	RSRP1	Q9BUV0	290 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HBP1-215	ENST00000607681	MUC3B	Q9H195	1237 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HBP1-215	ENST00000607681	ZFYVE1	Q9HBF4	777 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HBP1-215	ENST00000607681	GPN3	Q9UHW5	284 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HBP1-215	ENST00000607681	KLF15	Q9UIH9	416 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HBP1-215	ENST00000607681	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HBP1-215	ENST00000607681	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HBP1-215	ENST00000607681	ENC1	O14682	589 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HBP1-215	ENST00000607681	PTPRA	P18433	802 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HBP1-215	ENST00000607681	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HBP1-215	ENST00000607681	LIG3	P49916	1009 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HBP1-215	ENST00000607681	FAAP100	Q0VG06	881 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HBP1-215	ENST00000607681	PWP1	Q13610	501 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HBP1-215	ENST00000607681	SUZ12	Q15022	739 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HBP1-215	ENST00000607681	ELMSAN1	Q6PJG2	1045 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HBP1-215	ENST00000607681	RELL1	Q8IUW5	271 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HBP1-215	ENST00000607681	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HBP1-215	ENST00000607681	GPRASP2	Q96D09	838 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HBP1-215	ENST00000607681	TMEM74	Q96NL1	305 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HBP1-215	ENST00000607681	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HBP1-215	ENST00000607681	CEP44	Q9C0F1	390 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HBP1-215	ENST00000607681	SMG9	Q9H0W8	520 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HBP1-215	ENST00000607681	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HBP1-215	ENST00000607681	MBIP	Q9NS73	344 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HBP1-215	ENST00000607681	NXF1	Q9UBU9	619 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HBP1-215	ENST00000607681	PRKAG2	Q9UGJ0	569 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HBP1-215	ENST00000607681	ADAMTS1	Q9UHI8	967 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HBP1-215	ENST00000607681	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HBP1-215	ENST00000607681	TRIM33	Q9UPN9	1127 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HBP1-215	ENST00000607681		H3BM21	787 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HBP1-215	ENST00000607681	PAGE1	O75459	146 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HBP1-215	ENST00000607681	RLBP1	P12271	317 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HBP1-215	ENST00000607681	MAP2K3	P46734	347 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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