RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592965.2

MBD3-211, Transcript of methyl-CpG binding domain protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene MBD3, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3-211ENST00000592965 CYP4F22Q6NT55 531 aa29.53■■■□□ 2.32
MBD3-211ENST00000592965 TNS4Q8IZW8 715 aa29.53■■■□□ 2.32
MBD3-211ENST00000592965 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
MBD3-211ENST00000592965 COA1Q9GZY4 146 aa29.53■■■□□ 2.32
MBD3-211ENST00000592965 ZNF408Q9H9D4 720 aa29.53■■■□□ 2.32
MBD3-211ENST00000592965 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
MBD3-211ENST00000592965 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
MBD3-211ENST00000592965 USP17L8P0C7I0 530 aa29.51■■■□□ 2.31
MBD3-211ENST00000592965 CHRNDQ07001 517 aa29.51■■■□□ 2.31
MBD3-211ENST00000592965 DACT2Q5SW24 774 aa29.5■■■□□ 2.31
MBD3-211ENST00000592965 TXNRD3Q86VQ6 643 aa29.5■■■□□ 2.31
MBD3-211ENST00000592965 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa29.5■■■□□ 2.31
MBD3-211ENST00000592965 PRDM10Q9NQV6 1147 aa29.5■■■□□ 2.31
MBD3-211ENST00000592965 GGA3Q9NZ52 723 aa29.5■■■□□ 2.31
MBD3-211ENST00000592965 EPHA10Q5JZY3 1008 aa29.49■■■□□ 2.31
MBD3-211ENST00000592965 SLC4A10Q6U841 1118 aa29.49■■■□□ 2.31
MBD3-211ENST00000592965 LMBR1LQ6UX01 489 aa29.49■■■□□ 2.31
MBD3-211ENST00000592965 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP29.49■■■□□ 2.31
MBD3-211ENST00000592965 CHMP3Q9Y3E7 222 aa29.49■■■□□ 2.31
MBD3-211ENST00000592965 ADM5C9JUS6 153 aa29.48■■■□□ 2.31
MBD3-211ENST00000592965 KLRK1P26718 216 aa29.48■■■□□ 2.31
MBD3-211ENST00000592965 STRIP1Q5VSL9 837 aa29.48■■■□□ 2.31
MBD3-211ENST00000592965 DLK2Q6UY11 383 aa29.48■■■□□ 2.31
MBD3-211ENST00000592965 MYO3BQ8WXR4 1341 aa29.47■■■□□ 2.31
MBD3-211ENST00000592965 MAP2K2P36507 400 aa29.47■■■□□ 2.31
MBD3-211ENST00000592965 KCNJ4P48050 445 aa29.47■■■□□ 2.31
MBD3-211ENST00000592965 GRM1Q13255 1194 aa29.47■■■□□ 2.31
MBD3-211ENST00000592965 SULF1Q8IWU6 871 aa29.47■■■□□ 2.31
MBD3-211ENST00000592965 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
MBD3-211ENST00000592965 MYOZ2Q9NPC6 264 aa29.47■■■□□ 2.31
MBD3-211ENST00000592965 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
MBD3-211ENST00000592965 SLFN5Q08AF3 891 aa29.46■■■□□ 2.31
MBD3-211ENST00000592965 SCARF1Q14162 830 aa29.45■■■□□ 2.31
MBD3-211ENST00000592965 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.31
MBD3-211ENST00000592965 PTPRCP08575 1304 aa29.45■■■□□ 2.3
MBD3-211ENST00000592965 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa29.45■■■□□ 2.3
MBD3-211ENST00000592965 IRS2Q9Y4H2 1338 aa29.45■■■□□ 2.3
MBD3-211ENST00000592965 CCDC57Q2TAC2 916 aa29.44■■■□□ 2.3
MBD3-211ENST00000592965 UTYO14607 1347 aa29.44■■■□□ 2.3
MBD3-211ENST00000592965 AOC2O75106 756 aa29.43■■■□□ 2.3
MBD3-211ENST00000592965 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP29.43■■■□□ 2.3
MBD3-211ENST00000592965 MMP14P50281 582 aa29.43■■■□□ 2.3
MBD3-211ENST00000592965 HUNKP57058 714 aa29.43■■■□□ 2.3
MBD3-211ENST00000592965 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP29.43■■■□□ 2.3
MBD3-211ENST00000592965 MXD3Q9BW11 206 aa29.43■■■□□ 2.3
MBD3-211ENST00000592965 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP29.43■■■□□ 2.3
MBD3-211ENST00000592965 SSH1Q8WYL5 1049 aa29.42■■■□□ 2.3
MBD3-211ENST00000592965 FBXW7Q969H0 707 aa29.42■■■□□ 2.3
MBD3-211ENST00000592965 CCER2I3L3R5 266 aa29.41■■■□□ 2.3
MBD3-211ENST00000592965 TAF5LO75529 589 aa29.41■■■□□ 2.3
MBD3-211ENST00000592965 LBX1P52954 281 aa29.41■■■□□ 2.3
MBD3-211ENST00000592965 TAF7LQ5H9L4 462 aa29.41■■■□□ 2.3
MBD3-211ENST00000592965 TTLL5Q6EMB2 1281 aa29.41■■■□□ 2.3
MBD3-211ENST00000592965 OGFOD1Q8N543 542 aa29.41■■■□□ 2.3
MBD3-211ENST00000592965 C2orf69Q8N8R5 385 aa29.41■■■□□ 2.3
MBD3-211ENST00000592965 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP29.41■■■□□ 2.3
MBD3-211ENST00000592965 SUCLG2Q96I99 432 aa29.41■■■□□ 2.3
MBD3-211ENST00000592965 SNAP23O00161 211 aa29.4■■■□□ 2.3
MBD3-211ENST00000592965 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa29.4■■■□□ 2.3
MBD3-211ENST00000592965 CDCA5Q96FF9 252 aa29.4■■■□□ 2.3
MBD3-211ENST00000592965 KAZALD1Q96I82 304 aa29.4■■■□□ 2.3
MBD3-211ENST00000592965 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP29.4■■■□□ 2.3
MBD3-211ENST00000592965 BEGAINQ9BUH8 593 aa29.4■■■□□ 2.3
MBD3-211ENST00000592965 CD209Q9NNX6 404 aa29.4■■■□□ 2.3
MBD3-211ENST00000592965 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP29.39■■■□□ 2.3
MBD3-211ENST00000592965 CDCA7LQ96GN5 454 aa29.38■■■□□ 2.29
MBD3-211ENST00000592965 CNNM1Q9NRU3 951 aa29.38■■■□□ 2.29
MBD3-211ENST00000592965 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa29.37■■■□□ 2.29
MBD3-211ENST00000592965 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP29.37■■■□□ 2.29
MBD3-211ENST00000592965 GTF2IP78347 998 aa29.37■■■□□ 2.29
MBD3-211ENST00000592965 NOGQ13253 232 aa29.37■■■□□ 2.29
MBD3-211ENST00000592965 ALDH1L2Q3SY69 923 aa29.37■■■□□ 2.29
MBD3-211ENST00000592965 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
MBD3-211ENST00000592965 NBPF9Q3BBW0 867 aa29.36■■■□□ 2.29
MBD3-211ENST00000592965 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
MBD3-211ENST00000592965 ZNF804AQ7Z570 1209 aa29.36■■■□□ 2.29
MBD3-211ENST00000592965 IL1R1P14778 569 aa29.35■■■□□ 2.29
MBD3-211ENST00000592965 RGMBQ6NW40 437 aa29.35■■■□□ 2.29
MBD3-211ENST00000592965 WNT10BO00744 389 aa29.34■■■□□ 2.29
MBD3-211ENST00000592965 CA12O43570 354 aa29.34■■■□□ 2.29
MBD3-211ENST00000592965 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
MBD3-211ENST00000592965 HDAC9Q9UKV0 1011 aa29.34■■■□□ 2.29
MBD3-211ENST00000592965 KIAA0825Q8IV33 1275 aa29.33■■■□□ 2.29
MBD3-211ENST00000592965 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP29.32■■■□□ 2.28
MBD3-211ENST00000592965 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP29.32■■■□□ 2.28
MBD3-211ENST00000592965 FKBP1BP68106 108 aa29.32■■■□□ 2.28
MBD3-211ENST00000592965 ANKRD44Q8N8A2 993 aa29.32■■■□□ 2.28
MBD3-211ENST00000592965 CCDC102AQ96A19 550 aa29.32■■■□□ 2.28
MBD3-211ENST00000592965 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP29.32■■■□□ 2.28
MBD3-211ENST00000592965 ECM29Q5VYK3 1845 aa29.31■■■□□ 2.28
MBD3-211ENST00000592965 PLIN1O60240 522 aa29.31■■■□□ 2.28
MBD3-211ENST00000592965 SASH1O94885 1247 aa29.31■■■□□ 2.28
MBD3-211ENST00000592965 UBE4AQ14139 1066 aa29.31■■■□□ 2.28
MBD3-211ENST00000592965 CERS5Q8N5B7 392 aa29.31■■■□□ 2.28
MBD3-211ENST00000592965 SMC4Q9NTJ3 1288 aa29.31■■■□□ 2.28
MBD3-211ENST00000592965 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
MBD3-211ENST00000592965 ZIC5Q96T25 663 aa29.3■■■□□ 2.28
MBD3-211ENST00000592965 CAPN15O75808 1086 aa29.29■■■□□ 2.28
MBD3-211ENST00000592965 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
MBD3-211ENST00000592965 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP29.29■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.3 ms