RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591126.5

SMAD4-212, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SMAD4, Length 4,970 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-212ENST00000591126 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
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SMAD4-212ENST00000591126 SLC10A4Q96EP9 437 aa7.33□□□□□ -1.24
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SMAD4-212ENST00000591126 DCTN1Q14203 1278 aa7.33□□□□□ -1.24
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SMAD4-212ENST00000591126 HEG1Q9ULI3 1381 aa7.32□□□□□ -1.24
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SMAD4-212ENST00000591126 USP17L3A6NCW0 530 aa7.32□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 USP17L4A6NCW7 530 aa7.32□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 CALML3P27482 149 aa7.32□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP7.32□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 USP17L1Q7RTZ2 530 aa7.32□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 C6orf50Q9HD87 102 aa7.32□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 CTSWP56202 376 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 ATP8B2P98198 1209 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 CCDC70Q6NSX1 233 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa7.31□□□□□ -1.24
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SMAD4-212ENST00000591126 FDX1P10109 184 aa7.31□□□□□ -1.24
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SMAD4-212ENST00000591126 PLCB2Q00722 1185 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 MCF2L2Q86YR7 1114 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 RGS12O14924 1447 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 OFD1O75665 1012 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 GNA11P29992 359 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 RSPH3Q86UC2 560 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 CHD1LQ86WJ1 897 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 COA7Q96BR5 231 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 RTEL1Q9NZ71 1219 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 KCNH4Q9UQ05 1017 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa7.31□□□□□ -1.24
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SMAD4-212ENST00000591126 F8W031 263 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
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SMAD4-212ENST00000591126 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
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SMAD4-212ENST00000591126 TTLL5Q6EMB2 1281 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 LMNB1P20700 586 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 NBPF11Q86T75 865 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 FILIP1LQ4L180 1135 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 PTPRUQ92729 1446 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 BCORL1Q5H9F3 1711 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 CD163L1Q9NR16 1453 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 USP19O94966 1318 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 ZBTB7AO95365 584 aa7.3□□□□□ -1.24
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