RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560983.1

HERC1-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1, humanhuman

TSL 2

Gene HERC1, Length 457 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1-211ENST00000560983 EID1Q9Y6B2 187 aa6.28□□□□□ -1.4
HERC1-211ENST00000560983 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
HERC1-211ENST00000560983 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
HERC1-211ENST00000560983 FAM196BA6NMK8 535 aa6.27□□□□□ -1.41
HERC1-211ENST00000560983 ALBP02768 609 aa6.27□□□□□ -1.41
HERC1-211ENST00000560983 IGFBP4P22692 258 aa6.27□□□□□ -1.41
HERC1-211ENST00000560983 ITGB7P26010 798 aa6.27□□□□□ -1.41
HERC1-211ENST00000560983 ADH7P40394 386 aa6.27□□□□□ -1.41
HERC1-211ENST00000560983 HIF1AQ16665 826 aa6.27□□□□□ -1.41
HERC1-211ENST00000560983 BTLAQ7Z6A9 289 aa6.27□□□□□ -1.41
HERC1-211ENST00000560983 MICALL1Q8N3F8 863 aa6.27□□□□□ -1.41
HERC1-211ENST00000560983 ARXQ96QS3 562 aa6.27□□□□□ -1.41
HERC1-211ENST00000560983 EFCC1Q9HA90 598 aa6.27□□□□□ -1.41
HERC1-211ENST00000560983 PHLPP1O60346 1717 aa6.27□□□□□ -1.41
HERC1-211ENST00000560983 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
HERC1-211ENST00000560983 SYCP2Q9BX26 1530 aa6.26□□□□□ -1.41
HERC1-211ENST00000560983 M0R082 166 aa6.26□□□□□ -1.41
HERC1-211ENST00000560983 FURINP09958 794 aa6.26□□□□□ -1.41
HERC1-211ENST00000560983 GRNP28799 593 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
HERC1-211ENST00000560983 RTN1Q16799 776 aa6.26□□□□□ -1.41
HERC1-211ENST00000560983 BRINP3Q76B58 766 aa6.26□□□□□ -1.41
HERC1-211ENST00000560983 ZNF417Q8TAU3 575 aa6.26□□□□□ -1.41
HERC1-211ENST00000560983 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
HERC1-211ENST00000560983 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
HERC1-211ENST00000560983 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
HERC1-211ENST00000560983 BCS1LQ9Y276 419 aa6.26□□□□□ -1.41
HERC1-211ENST00000560983 FMN1Q68DA7 1419 aa6.25□□□□□ -1.41
HERC1-211ENST00000560983 SLIT1O75093 1534 aa6.25□□□□□ -1.41
HERC1-211ENST00000560983 SPDYE3A6NKU9 549 aa6.25□□□□□ -1.41
HERC1-211ENST00000560983 USP17L15C9J2P7 530 aa6.25□□□□□ -1.41
HERC1-211ENST00000560983 USP17L10C9JJH3 530 aa6.25□□□□□ -1.41
HERC1-211ENST00000560983 USP17L13C9JLJ4 530 aa6.25□□□□□ -1.41
HERC1-211ENST00000560983 USP17L12C9JPN9 530 aa6.25□□□□□ -1.41
HERC1-211ENST00000560983 USP17L11C9JVI0 530 aa6.25□□□□□ -1.41
HERC1-211ENST00000560983 USP17L21D6R901 530 aa6.25□□□□□ -1.41
HERC1-211ENST00000560983 USP17L18D6R9N7 530 aa6.25□□□□□ -1.41
HERC1-211ENST00000560983 USP17L22D6RA61 530 aa6.25□□□□□ -1.41
HERC1-211ENST00000560983 USP17L17D6RBQ6 530 aa6.25□□□□□ -1.41
HERC1-211ENST00000560983 USP17L19D6RCP7 530 aa6.25□□□□□ -1.41
HERC1-211ENST00000560983 USP17L20D6RJB6 530 aa6.25□□□□□ -1.41
HERC1-211ENST00000560983 TGFBR3LH3BV60 316 aa6.25□□□□□ -1.41
HERC1-211ENST00000560983 USP17L24Q0WX57 530 aa6.25□□□□□ -1.41
HERC1-211ENST00000560983 DPYDQ12882 1025 aa6.25□□□□□ -1.41
HERC1-211ENST00000560983 NEUROD1Q13562 356 aa6.25□□□□□ -1.41
HERC1-211ENST00000560983 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
HERC1-211ENST00000560983 USP21Q9UK80 565 aa6.25□□□□□ -1.41
HERC1-211ENST00000560983 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
HERC1-211ENST00000560983 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
HERC1-211ENST00000560983 TMEM2Q9UHN6 1383 aa6.25□□□□□ -1.41
HERC1-211ENST00000560983 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
HERC1-211ENST00000560983 LRP5O75197 1615 aa6.25□□□□□ -1.41
HERC1-211ENST00000560983 PREX2Q70Z35 1606 aa6.25□□□□□ -1.41
HERC1-211ENST00000560983 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa6.25□□□□□ -1.41
HERC1-211ENST00000560983 MBD5Q9P267 1494 aa6.24□□□□□ -1.41
HERC1-211ENST00000560983 XP32Q5T750 250 aa6.24□□□□□ -1.41
HERC1-211ENST00000560983 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
HERC1-211ENST00000560983 C8orf86Q6ZUL3 223 aa6.24□□□□□ -1.41
HERC1-211ENST00000560983 ANKMY2Q8IV38 441 aa6.24□□□□□ -1.41
HERC1-211ENST00000560983 C19orf44Q9H6X5 657 aa6.24□□□□□ -1.41
HERC1-211ENST00000560983 SETD5Q9C0A6 1442 aa6.24□□□□□ -1.41
HERC1-211ENST00000560983 DIP2AQ14689 1571 aa6.23□□□□□ -1.41
HERC1-211ENST00000560983 ERVK-7P63135 1459 aa6.23□□□□□ -1.41
HERC1-211ENST00000560983 WEE1P30291 646 aa6.23□□□□□ -1.41
HERC1-211ENST00000560983 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
HERC1-211ENST00000560983 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
HERC1-211ENST00000560983 GSX2Q9BZM3 304 aa6.23□□□□□ -1.41
HERC1-211ENST00000560983 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
HERC1-211ENST00000560983 ABCC3O15438 1527 aa6.23□□□□□ -1.41
HERC1-211ENST00000560983 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
HERC1-211ENST00000560983 TET3O43151 1660 aa6.23□□□□□ -1.41
HERC1-211ENST00000560983 BCL9LQ86UU0 1499 aa6.22□□□□□ -1.41
HERC1-211ENST00000560983 GATA4P43694 442 aa6.22□□□□□ -1.41
HERC1-211ENST00000560983 CFAP70Q5T0N1 1121 aa6.22□□□□□ -1.41
HERC1-211ENST00000560983 MYO19Q96H55 970 aa6.22□□□□□ -1.41
HERC1-211ENST00000560983 C11orf16Q9NQ32 467 aa6.22□□□□□ -1.41
HERC1-211ENST00000560983 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa6.22□□□□□ -1.41
HERC1-211ENST00000560983 CEP350Q5VT06 3117 aa6.22□□□□□ -1.41
HERC1-211ENST00000560983 NWD1Q149M9 1564 aa6.22□□□□□ -1.41
HERC1-211ENST00000560983 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
HERC1-211ENST00000560983 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa6.22□□□□□ -1.41
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HERC1-211ENST00000560983 ATF3P18847 181 aa6.21□□□□□ -1.42
HERC1-211ENST00000560983 INPP5BP32019 993 aa6.21□□□□□ -1.42
HERC1-211ENST00000560983 C1QTNF8P60827 252 aa6.21□□□□□ -1.42
HERC1-211ENST00000560983 IDI1Q13907 227 aa6.21□□□□□ -1.42
HERC1-211ENST00000560983 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
HERC1-211ENST00000560983 PRRT3Q5FWE3 981 aa6.21□□□□□ -1.42
HERC1-211ENST00000560983 NKAPLQ5M9Q1 402 aa6.21□□□□□ -1.42
HERC1-211ENST00000560983 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
HERC1-211ENST00000560983 BHMTQ93088 406 aa6.21□□□□□ -1.42
HERC1-211ENST00000560983 VRTNQ9H8Y1 702 aa6.21□□□□□ -1.42
HERC1-211ENST00000560983 NAGPAQ9UK23 515 aa6.21□□□□□ -1.42
HERC1-211ENST00000560983 SLC6A14Q9UN76 642 aa6.21□□□□□ -1.42
HERC1-211ENST00000560983 ATRNO75882 1429 aa6.21□□□□□ -1.42
HERC1-211ENST00000560983 TIAM1Q13009 1591 aa6.21□□□□□ -1.42
HERC1-211ENST00000560983 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa6.21□□□□□ -1.42
HERC1-211ENST00000560983 PNPLA6Q8IY17 1366 aa6.2□□□□□ -1.42
HERC1-211ENST00000560983 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
HERC1-211ENST00000560983 CCINQ13939 588 aa6.2□□□□□ -1.42
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