RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544213.5

PUS1-210, Transcript of pseudouridylate synthase 1, humanhuman

TSL 5

Gene PUS1, Length 687 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS1-210ENST00000544213 FSTL1Q12841 308 aa30.12■■■□□ 2.41
PUS1-210ENST00000544213 KLHDC4Q8TBB5 520 aa30.12■■■□□ 2.41
PUS1-210ENST00000544213 PANK1Q8TE04 598 aa30.12■■■□□ 2.41
PUS1-210ENST00000544213 COPRSQ9NQ92 184 aa30.12■■■□□ 2.41
PUS1-210ENST00000544213 PDE3AQ14432 1141 aa30.11■■■□□ 2.41
PUS1-210ENST00000544213 SMC1BQ8NDV3 1235 aa30.11■■■□□ 2.41
PUS1-210ENST00000544213 DPF2Q92785 391 aa30.11■■■□□ 2.41
PUS1-210ENST00000544213 GPRC5DQ9NZD1 345 aa30.11■■■□□ 2.41
PUS1-210ENST00000544213 PDE8BO95263 885 aa30.1■■■□□ 2.41
PUS1-210ENST00000544213 VIL1P09327 827 aaKnown RBP30.1■■■□□ 2.41
PUS1-210ENST00000544213 ZNF804AQ7Z570 1209 aa30.1■■■□□ 2.41
PUS1-210ENST00000544213 TXNRD3Q86VQ6 643 aa30.1■■■□□ 2.41
PUS1-210ENST00000544213 DDX19BQ9UMR2 479 aa30.1■■■□□ 2.41
PUS1-210ENST00000544213 ZNF609O15014 1411 aa30.09■■■□□ 2.41
PUS1-210ENST00000544213 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP30.09■■■□□ 2.41
PUS1-210ENST00000544213 MVPQ14764 893 aaKnown RBP30.09■■■□□ 2.41
PUS1-210ENST00000544213 VGLL2Q8N8G2 317 aa30.09■■■□□ 2.41
PUS1-210ENST00000544213 IRS2Q9Y4H2 1338 aa30.09■■■□□ 2.41
PUS1-210ENST00000544213 USP17L3A6NCW0 530 aa30.08■■■□□ 2.41
PUS1-210ENST00000544213 USP17L4A6NCW7 530 aa30.08■■■□□ 2.41
PUS1-210ENST00000544213 IL15P40933 162 aaPredicted RBP30.08■■■□□ 2.41
PUS1-210ENST00000544213 USP17L1Q7RTZ2 530 aa30.08■■■□□ 2.41
PUS1-210ENST00000544213 KLRK1P26718 216 aa30.07■■■□□ 2.4
PUS1-210ENST00000544213 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP30.07■■■□□ 2.4
PUS1-210ENST00000544213 LDHDQ86WU2 507 aa30.07■■■□□ 2.4
PUS1-210ENST00000544213 AGBL3Q8NEM8 1001 aa30.07■■■□□ 2.4
PUS1-210ENST00000544213 KCNQ5Q9NR82 932 aa30.07■■■□□ 2.4
PUS1-210ENST00000544213 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP30.07■■■□□ 2.4
PUS1-210ENST00000544213 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP30.06■■■□□ 2.4
PUS1-210ENST00000544213 ATG9AQ7Z3C6 839 aa30.06■■■□□ 2.4
PUS1-210ENST00000544213 CD209Q9NNX6 404 aa30.06■■■□□ 2.4
PUS1-210ENST00000544213 H7C1D1 291 aa30.05■■■□□ 2.4
PUS1-210ENST00000544213 SNAP23O00161 211 aa30.05■■■□□ 2.4
PUS1-210ENST00000544213 EPS15P42566 896 aa30.05■■■□□ 2.4
PUS1-210ENST00000544213 STRIP1Q5VSL9 837 aa30.05■■■□□ 2.4
PUS1-210ENST00000544213 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP30.05■■■□□ 2.4
PUS1-210ENST00000544213 SIL1Q9H173 461 aa30.05■■■□□ 2.4
PUS1-210ENST00000544213 MYO3BQ8WXR4 1341 aa30.04■■■□□ 2.4
PUS1-210ENST00000544213 IL1R1P14778 569 aa30.04■■■□□ 2.4
PUS1-210ENST00000544213 ATP8B2P98198 1209 aa30.04■■■□□ 2.4
PUS1-210ENST00000544213 CEP126Q9P2H0 1117 aa30.04■■■□□ 2.4
PUS1-210ENST00000544213 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
PUS1-210ENST00000544213 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP30.03■■■□□ 2.4
PUS1-210ENST00000544213 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP30.03■■■□□ 2.4
PUS1-210ENST00000544213 CHADLQ6NUI6 762 aa30.03■■■□□ 2.4
PUS1-210ENST00000544213 COG6Q9Y2V7 657 aa30.03■■■□□ 2.4
PUS1-210ENST00000544213 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP30.03■■■□□ 2.4
PUS1-210ENST00000544213 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa30.03■■■□□ 2.4
PUS1-210ENST00000544213 MMP14P50281 582 aa30.02■■■□□ 2.4
PUS1-210ENST00000544213 CAVIN4Q5BKX8 364 aa30.02■■■□□ 2.4
PUS1-210ENST00000544213 TTLL5Q6EMB2 1281 aa30.02■■■□□ 2.4
PUS1-210ENST00000544213 LPIN2Q92539 896 aa30.02■■■□□ 2.4
PUS1-210ENST00000544213 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
PUS1-210ENST00000544213 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa30.01■■■□□ 2.39
PUS1-210ENST00000544213 FGFR2P21802 821 aa30.01■■■□□ 2.39
PUS1-210ENST00000544213 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.39
PUS1-210ENST00000544213 MICALL2Q8IY33 904 aa30.01■■■□□ 2.39
PUS1-210ENST00000544213 SSH3Q8TE77 659 aa30.01■■■□□ 2.39
PUS1-210ENST00000544213 SLC5A1P13866 664 aa30■■■□□ 2.39
PUS1-210ENST00000544213 POLA2Q14181 598 aa30■■■□□ 2.39
PUS1-210ENST00000544213 VPS37DQ86XT2 251 aa30■■■□□ 2.39
PUS1-210ENST00000544213 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP29.99■■■□□ 2.39
PUS1-210ENST00000544213 DACT2Q5SW24 774 aa29.99■■■□□ 2.39
PUS1-210ENST00000544213 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP29.99■■■□□ 2.39
PUS1-210ENST00000544213 C1orf115Q9H7X2 142 aa29.99■■■□□ 2.39
PUS1-210ENST00000544213 CLEC11AQ9Y240 323 aa29.99■■■□□ 2.39
PUS1-210ENST00000544213 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP29.98■■■□□ 2.39
PUS1-210ENST00000544213 SASH1O94885 1247 aa29.97■■■□□ 2.39
PUS1-210ENST00000544213 GYG1P46976 350 aa29.97■■■□□ 2.39
PUS1-210ENST00000544213 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
PUS1-210ENST00000544213 GTF2IP78347 998 aa29.97■■■□□ 2.39
PUS1-210ENST00000544213 FBXO33Q7Z6M2 555 aa29.97■■■□□ 2.39
PUS1-210ENST00000544213 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
PUS1-210ENST00000544213 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
PUS1-210ENST00000544213 FBXW7Q969H0 707 aa29.97■■■□□ 2.39
PUS1-210ENST00000544213 GMLQ99445 158 aa29.97■■■□□ 2.39
PUS1-210ENST00000544213 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa29.97■■■□□ 2.39
PUS1-210ENST00000544213 AKAP2Q9Y2D5 859 aa29.97■■■□□ 2.39
PUS1-210ENST00000544213 POTEIP0CG38 1075 aa29.96■■■□□ 2.39
PUS1-210ENST00000544213 POTEJP0CG39 1038 aa29.96■■■□□ 2.39
PUS1-210ENST00000544213 HSPA6P17066 643 aa29.96■■■□□ 2.39
PUS1-210ENST00000544213 CEP85Q6P2H3 762 aa29.96■■■□□ 2.39
PUS1-210ENST00000544213 USP17L8P0C7I0 530 aa29.95■■■□□ 2.39
PUS1-210ENST00000544213 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP29.95■■■□□ 2.39
PUS1-210ENST00000544213 ATP2B3Q16720 1220 aa29.95■■■□□ 2.39
PUS1-210ENST00000544213 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP29.95■■■□□ 2.39
PUS1-210ENST00000544213 OGFOD1Q8N543 542 aa29.94■■■□□ 2.38
PUS1-210ENST00000544213 FAM205AQ6ZU69 1335 aa29.94■■■□□ 2.38
PUS1-210ENST00000544213 RRP1P56182 461 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
PUS1-210ENST00000544213 C20orf194Q5TEA3 1177 aa29.93■■■□□ 2.38
PUS1-210ENST00000544213 PGAP2Q9UHJ9 254 aa29.92■■■□□ 2.38
PUS1-210ENST00000544213 HDAC9Q9UKV0 1011 aa29.92■■■□□ 2.38
PUS1-210ENST00000544213 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
PUS1-210ENST00000544213 ARAP2Q8WZ64 1704 aa29.91■■■□□ 2.38
PUS1-210ENST00000544213 SHTN1A0MZ66 631 aa29.9■■■□□ 2.38
PUS1-210ENST00000544213 HMMRO75330 724 aa29.9■■■□□ 2.38
PUS1-210ENST00000544213 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP29.9■■■□□ 2.38
PUS1-210ENST00000544213 SURF6O75683 361 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
PUS1-210ENST00000544213 APLP1P51693 650 aa29.9■■■□□ 2.38
PUS1-210ENST00000544213 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa29.9■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 129.7 ms