RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529677.1

PACS1-208, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene PACS1, Length 679 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-208ENST00000529677 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
PACS1-208ENST00000529677 USP48Q86UV5 1035 aa21.06■□□□□ 0.96
PACS1-208ENST00000529677 SUCLG2Q96I99 432 aa21.06■□□□□ 0.96
PACS1-208ENST00000529677 CRAMP1Q96RY5 1269 aa21.06■□□□□ 0.96
PACS1-208ENST00000529677 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
PACS1-208ENST00000529677 GNAI2P04899 355 aa21.05■□□□□ 0.96
PACS1-208ENST00000529677 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
PACS1-208ENST00000529677 GRIPAP1Q4V328 841 aa21.05■□□□□ 0.96
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PACS1-208ENST00000529677 YDJCA8MPS7 323 aa21.04■□□□□ 0.96
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PACS1-208ENST00000529677 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
PACS1-208ENST00000529677 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
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PACS1-208ENST00000529677 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
PACS1-208ENST00000529677 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
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PACS1-208ENST00000529677 RAD17O75943 681 aa21.02■□□□□ 0.96
PACS1-208ENST00000529677 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
PACS1-208ENST00000529677 EPHA10Q5JZY3 1008 aa21.02■□□□□ 0.96
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PACS1-208ENST00000529677 VPS33BQ9H267 617 aa21.01■□□□□ 0.95
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PACS1-208ENST00000529677 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa21.01■□□□□ 0.95
PACS1-208ENST00000529677 ADM5C9JUS6 153 aa21■□□□□ 0.95
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PACS1-208ENST00000529677 CTSWP56202 376 aa21■□□□□ 0.95
PACS1-208ENST00000529677 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
PACS1-208ENST00000529677 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
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PACS1-208ENST00000529677 TAF1P21675 1872 aa21■□□□□ 0.95
PACS1-208ENST00000529677 KIAA2012Q0VF49 1180 aa20.99■□□□□ 0.95
PACS1-208ENST00000529677 CEP85Q6P2H3 762 aa20.99■□□□□ 0.95
PACS1-208ENST00000529677 SAMD7Q7Z3H4 446 aa20.99■□□□□ 0.95
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PACS1-208ENST00000529677 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
PACS1-208ENST00000529677 C1orf115Q9H7X2 142 aa20.99■□□□□ 0.95
PACS1-208ENST00000529677 LRRC37AA6NMS7 1700 aa20.98■□□□□ 0.95
PACS1-208ENST00000529677 MICALL2Q8IY33 904 aa20.98■□□□□ 0.95
PACS1-208ENST00000529677 TTLL11Q8NHH1 800 aa20.98■□□□□ 0.95
PACS1-208ENST00000529677 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
PACS1-208ENST00000529677 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
PACS1-208ENST00000529677 ATP8B2P98198 1209 aa20.97■□□□□ 0.95
PACS1-208ENST00000529677 LMBR1LQ6UX01 489 aa20.97■□□□□ 0.95
PACS1-208ENST00000529677 CCDC102AQ96A19 550 aa20.97■□□□□ 0.95
PACS1-208ENST00000529677 NLRP3Q96P20 1036 aa20.97■□□□□ 0.95
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PACS1-208ENST00000529677 SSH3Q8TE77 659 aa20.95■□□□□ 0.94
PACS1-208ENST00000529677 CCDC152Q4G0S7 254 aa20.94■□□□□ 0.94
PACS1-208ENST00000529677 RASAL3Q86YV0 1011 aa20.94■□□□□ 0.94
PACS1-208ENST00000529677 SZT2Q5T011 3432 aa20.94■□□□□ 0.94
PACS1-208ENST00000529677 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa20.93■□□□□ 0.94
PACS1-208ENST00000529677 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
PACS1-208ENST00000529677 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
PACS1-208ENST00000529677 GCC1Q96CN9 775 aa20.93■□□□□ 0.94
PACS1-208ENST00000529677 CENPFP49454 3210 aa20.93■□□□□ 0.94
PACS1-208ENST00000529677 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
PACS1-208ENST00000529677 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP20.92■□□□□ 0.94
PACS1-208ENST00000529677 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
PACS1-208ENST00000529677 TNIP1Q15025 636 aa20.92■□□□□ 0.94
PACS1-208ENST00000529677 C2orf69Q8N8R5 385 aa20.92■□□□□ 0.94
PACS1-208ENST00000529677 SUPT20HQ8NEM7 779 aa20.92■□□□□ 0.94
PACS1-208ENST00000529677 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
PACS1-208ENST00000529677 GREM2Q9H772 168 aa20.92■□□□□ 0.94
PACS1-208ENST00000529677 SCN9AQ15858 1988 aa20.92■□□□□ 0.94
PACS1-208ENST00000529677 SRGAP3O43295 1099 aa20.91■□□□□ 0.94
PACS1-208ENST00000529677 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
PACS1-208ENST00000529677 H7C1D1 291 aa20.9■□□□□ 0.94
PACS1-208ENST00000529677 PSMD14O00487 310 aa20.9■□□□□ 0.94
PACS1-208ENST00000529677 HMMRO75330 724 aa20.9■□□□□ 0.94
PACS1-208ENST00000529677 SP8Q8IXZ3 490 aa20.9■□□□□ 0.94
PACS1-208ENST00000529677 MPNDQ8N594 471 aa20.9■□□□□ 0.94
PACS1-208ENST00000529677 DPF2Q92785 391 aa20.9■□□□□ 0.94
PACS1-208ENST00000529677 COPRSQ9NQ92 184 aa20.9■□□□□ 0.94
PACS1-208ENST00000529677 ITGA6P23229 1130 aa20.89■□□□□ 0.93
PACS1-208ENST00000529677 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
PACS1-208ENST00000529677 KCNQ5Q9NR82 932 aa20.89■□□□□ 0.93
PACS1-208ENST00000529677 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
PACS1-208ENST00000529677 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa20.88■□□□□ 0.93
PACS1-208ENST00000529677 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa20.88■□□□□ 0.93
PACS1-208ENST00000529677 TBC1D8O95759 1140 aa20.88■□□□□ 0.93
PACS1-208ENST00000529677 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
PACS1-208ENST00000529677 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
PACS1-208ENST00000529677 CCDC57Q2TAC2 916 aa20.88■□□□□ 0.93
PACS1-208ENST00000529677 SEC31BQ9NQW1 1179 aa20.88■□□□□ 0.93
PACS1-208ENST00000529677 SPEF2Q9C093 1822 aa20.88■□□□□ 0.93
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