RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527273.5

RPS3-208, Transcript of ribosomal protein S3, humanhuman

TSL 3

Gene RPS3, Length 390 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3-208ENST00000527273 USP17L3A6NCW0 530 aa14.76□□□□□ -0.05
RPS3-208ENST00000527273 USP17L4A6NCW7 530 aa14.76□□□□□ -0.05
RPS3-208ENST00000527273 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
RPS3-208ENST00000527273 USP17L1Q7RTZ2 530 aa14.76□□□□□ -0.05
RPS3-208ENST00000527273 PODNQ7Z5L7 613 aa14.76□□□□□ -0.05
RPS3-208ENST00000527273 FBXW7Q969H0 707 aa14.76□□□□□ -0.05
RPS3-208ENST00000527273 GMLQ99445 158 aa14.76□□□□□ -0.05
RPS3-208ENST00000527273 MXD3Q9BW11 206 aa14.76□□□□□ -0.05
RPS3-208ENST00000527273 PLA2G12BQ9BX93 195 aa14.76□□□□□ -0.05
RPS3-208ENST00000527273 ZNF609O15014 1411 aa14.75□□□□□ -0.05
RPS3-208ENST00000527273 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa14.75□□□□□ -0.05
RPS3-208ENST00000527273 CSF1RP07333 972 aa14.75□□□□□ -0.05
RPS3-208ENST00000527273 USP17L8P0C7I0 530 aa14.75□□□□□ -0.05
RPS3-208ENST00000527273 SCARF1Q14162 830 aa14.75□□□□□ -0.05
RPS3-208ENST00000527273 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
RPS3-208ENST00000527273 TXNRD3Q86VQ6 643 aa14.75□□□□□ -0.05
RPS3-208ENST00000527273 SULF1Q8IWU6 871 aa14.75□□□□□ -0.05
RPS3-208ENST00000527273 ZIC5Q96T25 663 aa14.75□□□□□ -0.05
RPS3-208ENST00000527273 MPHOSPH8Q99549 860 aa14.75□□□□□ -0.05
RPS3-208ENST00000527273 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
RPS3-208ENST00000527273 MYOZ2Q9NPC6 264 aa14.75□□□□□ -0.05
RPS3-208ENST00000527273 KLRK1P26718 216 aa14.74□□□□□ -0.05
RPS3-208ENST00000527273 C2orf69Q8N8R5 385 aa14.74□□□□□ -0.05
RPS3-208ENST00000527273 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
RPS3-208ENST00000527273 LEMD3Q9Y2U8 911 aa14.74□□□□□ -0.05
RPS3-208ENST00000527273 ZNF804BA4D1E1 1349 aa14.73□□□□□ -0.05
RPS3-208ENST00000527273 DACT2Q5SW24 774 aa14.73□□□□□ -0.05
RPS3-208ENST00000527273 BEND3Q5T5X7 828 aa14.73□□□□□ -0.05
RPS3-208ENST00000527273 RGMBQ6NW40 437 aa14.73□□□□□ -0.05
RPS3-208ENST00000527273 CDCA5Q96FF9 252 aa14.73□□□□□ -0.05
RPS3-208ENST00000527273 COA1Q9GZY4 146 aa14.73□□□□□ -0.05
RPS3-208ENST00000527273 CHMP3Q9Y3E7 222 aa14.73□□□□□ -0.05
RPS3-208ENST00000527273 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa14.72□□□□□ -0.05
RPS3-208ENST00000527273 SNAP23O00161 211 aa14.72□□□□□ -0.05
RPS3-208ENST00000527273 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
RPS3-208ENST00000527273 FOXO4P98177 505 aa14.72□□□□□ -0.05
RPS3-208ENST00000527273 CHRNDQ07001 517 aa14.72□□□□□ -0.05
RPS3-208ENST00000527273 NOGQ13253 232 aa14.72□□□□□ -0.05
RPS3-208ENST00000527273 ANKRD2Q9GZV1 360 aa14.72□□□□□ -0.05
RPS3-208ENST00000527273 AKAP11Q9UKA4 1901 aa14.72□□□□□ -0.05
RPS3-208ENST00000527273 KCNJ4P48050 445 aa14.71□□□□□ -0.05
RPS3-208ENST00000527273 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
RPS3-208ENST00000527273 NBPF9Q3BBW0 867 aa14.71□□□□□ -0.05
RPS3-208ENST00000527273 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
RPS3-208ENST00000527273 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
RPS3-208ENST00000527273 TAF5LO75529 589 aa14.7□□□□□ -0.06
RPS3-208ENST00000527273 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
RPS3-208ENST00000527273 EPHA10Q5JZY3 1008 aa14.7□□□□□ -0.06
RPS3-208ENST00000527273 STRIP1Q5VSL9 837 aa14.7□□□□□ -0.06
RPS3-208ENST00000527273 TTLL5Q6EMB2 1281 aa14.7□□□□□ -0.06
RPS3-208ENST00000527273 SLC4A10Q6U841 1118 aa14.7□□□□□ -0.06
RPS3-208ENST00000527273 LMBR1LQ6UX01 489 aa14.7□□□□□ -0.06
RPS3-208ENST00000527273 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa14.69□□□□□ -0.06
RPS3-208ENST00000527273 GRM8O00222 908 aa14.69□□□□□ -0.06
RPS3-208ENST00000527273 CA12O43570 354 aa14.69□□□□□ -0.06
RPS3-208ENST00000527273 GTF2IP78347 998 aa14.69□□□□□ -0.06
RPS3-208ENST00000527273 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa14.69□□□□□ -0.06
RPS3-208ENST00000527273 OGFOD1Q8N543 542 aa14.69□□□□□ -0.06
RPS3-208ENST00000527273 ABHD8Q96I13 439 aa14.69□□□□□ -0.06
RPS3-208ENST00000527273 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
RPS3-208ENST00000527273 MYO3BQ8WXR4 1341 aa14.68□□□□□ -0.06
RPS3-208ENST00000527273 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa14.68□□□□□ -0.06
RPS3-208ENST00000527273 WNT10BO00744 389 aa14.68□□□□□ -0.06
RPS3-208ENST00000527273 SASH1O94885 1247 aa14.68□□□□□ -0.06
RPS3-208ENST00000527273 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
RPS3-208ENST00000527273 MOB2Q70IA6 237 aa14.68□□□□□ -0.06
RPS3-208ENST00000527273 KIAA0825Q8IV33 1275 aa14.68□□□□□ -0.06
RPS3-208ENST00000527273 CCDC102AQ96A19 550 aa14.68□□□□□ -0.06
RPS3-208ENST00000527273 CD209Q9NNX6 404 aa14.68□□□□□ -0.06
RPS3-208ENST00000527273 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
RPS3-208ENST00000527273 PLIN1O60240 522 aa14.67□□□□□ -0.06
RPS3-208ENST00000527273 SLC10A3P09131 477 aa14.67□□□□□ -0.06
RPS3-208ENST00000527273 CCDC57Q2TAC2 916 aa14.67□□□□□ -0.06
RPS3-208ENST00000527273 TAF7LQ5H9L4 462 aa14.67□□□□□ -0.06
RPS3-208ENST00000527273 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa14.67□□□□□ -0.06
RPS3-208ENST00000527273 ZNF521Q96K83 1311 aa14.66□□□□□ -0.06
RPS3-208ENST00000527273 IRS2Q9Y4H2 1338 aa14.66□□□□□ -0.06
RPS3-208ENST00000527273 ECM29Q5VYK3 1845 aa14.66□□□□□ -0.06
RPS3-208ENST00000527273 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa14.66□□□□□ -0.06
RPS3-208ENST00000527273 UBE2Q2LH0YL09 131 aa14.65□□□□□ -0.06
RPS3-208ENST00000527273 ALDH1L1O75891 902 aa14.65□□□□□ -0.06
RPS3-208ENST00000527273 RASAL3Q86YV0 1011 aa14.65□□□□□ -0.06
RPS3-208ENST00000527273 SUCLG2Q96I99 432 aa14.65□□□□□ -0.06
RPS3-208ENST00000527273 CNNM1Q9NRU3 951 aa14.65□□□□□ -0.06
RPS3-208ENST00000527273 HDAC9Q9UKV0 1011 aa14.65□□□□□ -0.06
RPS3-208ENST00000527273 TRPA1O75762 1119 aa14.64□□□□□ -0.07
RPS3-208ENST00000527273 FKBP1BP68106 108 aa14.64□□□□□ -0.07
RPS3-208ENST00000527273 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RPS3-208ENST00000527273 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RPS3-208ENST00000527273 ZNF804AQ7Z570 1209 aa14.64□□□□□ -0.07
RPS3-208ENST00000527273 CERS5Q8N5B7 392 aa14.64□□□□□ -0.07
RPS3-208ENST00000527273 CSRNP1Q96S65 589 aa14.64□□□□□ -0.07
RPS3-208ENST00000527273 JAG2Q9Y219 1238 aa14.64□□□□□ -0.07
RPS3-208ENST00000527273 CCDC85CA6NKD9 419 aa14.63□□□□□ -0.07
RPS3-208ENST00000527273 F8W031 263 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
RPS3-208ENST00000527273 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
RPS3-208ENST00000527273 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
RPS3-208ENST00000527273 KAZALD1Q96I82 304 aa14.63□□□□□ -0.07
RPS3-208ENST00000527273 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
RPS3-208ENST00000527273 MCOLN1Q9GZU1 580 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 118.2 ms