RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509784.1

CALCOCO2-216, Transcript of calcium binding and coiled-coil domain 2, human

TSL 4

Gene CALCOCO2, Length 578 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CALCOCO2-216	ENST00000509784	GGT7	Q9UJ14	662 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CALCOCO2-216	ENST00000509784	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CALCOCO2-216	ENST00000509784	NFKBIE	O00221	500 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CALCOCO2-216	ENST00000509784	IGSF3	O75054	1194 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CALCOCO2-216	ENST00000509784	FBXO24	O75426	580 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ARAF	P10398	606 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ADH6	P28332	368 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ADH7	P40394	386 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ST13	P50502	369 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ZNF394	Q53GI3	561 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CALCOCO2-216	ENST00000509784	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CEP135	Q66GS9	1140 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TMEM102	Q8N9M5	508 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CALCOCO2-216	ENST00000509784	NXPE3	Q969Y0	559 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CCSER2	Q9H7U1	834 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CALCOCO2-216	ENST00000509784	MBIP	Q9NS73	344 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CALCOCO2-216	ENST00000509784	USP35	Q9P2H5	1018 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SLC6A14	Q9UN76	642 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CALCOCO2-216	ENST00000509784	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PCDHGB7	Q9Y5F8	929 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CALCOCO2-216	ENST00000509784		A0A096LPE4	126 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CALCOCO2-216	ENST00000509784		A0A1W2PPZ6	126 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SMNDC1	O75940	238 aa	Known RBP eCLIP	4.97	□□□□□ -1.61
CALCOCO2-216	ENST00000509784	XRCC5	P13010	732 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CALCOCO2-216	ENST00000509784	MAP2K3	P46734	347 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CCDC85B	Q15834	202 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CALCOCO2-216	ENST00000509784	RNFT1	Q5M7Z0	435 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PERM1	Q5SV97	790 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ZNF787	Q6DD87	383 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ELMSAN1	Q6PJG2	1045 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CALCOCO2-216	ENST00000509784	USP48	Q86UV5	1035 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TNFRSF25	Q93038	417 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CALCOCO2-216	ENST00000509784	C8orf37	Q96NL8	207 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CALCOCO2-216	ENST00000509784	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CALCOCO2-216	ENST00000509784	COL25A1	Q9BXS0	654 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CALCOCO2-216	ENST00000509784	BHLHE41	Q9C0J9	482 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TGIF2	Q9GZN2	237 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SMG9	Q9H0W8	520 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ACBD3	Q9H3P7	528 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CALCOCO2-216	ENST00000509784	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CALCOCO2-216	ENST00000509784	GGA1	Q9UJY5	639 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CALCOCO2-216	ENST00000509784	NAGPA	Q9UK23	515 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CALCOCO2-216	ENST00000509784	EPB41L3	Q9Y2J2	1087 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CALCOCO2-216	ENST00000509784	IGF1R	P08069	1367 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784		F6X3S4	739 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	RACK1	P63244	317 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	NPAS3	Q8IXF0	933 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PLD4	Q96BZ4	506 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	MUC3B	Q9H195	1237 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ZFYVE1	Q9HBF4	777 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CAPN10	Q9HC96	672 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	COPRS	Q9NQ92	184 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PPM1H	Q9ULR3	514 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ELOA3C	A0A087WX78	387 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ELOA3D	A6NLF2	546 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ADARB2-AS1	A8MUL3	147 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TERT	O14746	1132 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ITPKA	P23677	461 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TNNI2	P48788	182 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	MAP3K11	Q16584	847 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ELOA3B	Q3SY89	546 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PSAPL1	Q6NUJ1	521 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ERMP1	Q7Z2K6	904 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ELOA3	Q8NG57	546 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TRIM56	Q9BRZ2	755 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	LACRT	Q9GZZ8	138 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ZNF576	Q9H609	170 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SRA1	Q9HD15	236 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TRIM33	Q9UPN9	1127 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ERBB4	Q15303	1308 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CELA3A	P09093	270 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	VSIG8	P0DPA2	414 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PTPRA	P18433	802 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ALAS2	P22557	587 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	MAP3K10	Q02779	954 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	FAAP100	Q0VG06	881 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ADAMTSL4	Q6UY14	1074 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SV2B	Q7L1I2	683 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	RELL1	Q8IUW5	271 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	GOLGA6L1	Q8N7Z2	621 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	NUDT8	Q8WV74	236 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	BSND	Q8WZ55	320 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	LPIN3	Q9BQK8	851 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CEP44	Q9C0F1	390 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	INPP5F	Q9Y2H2	1132 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-216	ENST00000509784	FAM177B	A6PVY3	158 aa		4.93	□□□□□ -1.62

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