RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485349.5

SKIV2L-211, Transcript of Ski2 like RNA helicase, humanhuman

TSL 2

Gene SKIV2L, Length 734 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2L-211ENST00000485349 CA12O43570 354 aa21.64■■□□□ 1.05
SKIV2L-211ENST00000485349 SCARF1Q14162 830 aa21.64■■□□□ 1.05
SKIV2L-211ENST00000485349 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
SKIV2L-211ENST00000485349 RGMBQ6NW40 437 aa21.64■■□□□ 1.05
SKIV2L-211ENST00000485349 C2orf69Q8N8R5 385 aa21.64■■□□□ 1.05
SKIV2L-211ENST00000485349 DNAAF4Q8WXU2 420 aa21.64■■□□□ 1.05
SKIV2L-211ENST00000485349 CDCA5Q96FF9 252 aa21.64■■□□□ 1.05
SKIV2L-211ENST00000485349 MYOZ2Q9NPC6 264 aa21.64■■□□□ 1.05
SKIV2L-211ENST00000485349 USP17L8P0C7I0 530 aa21.63■■□□□ 1.05
SKIV2L-211ENST00000485349 ITGA6P23229 1130 aa21.63■■□□□ 1.05
SKIV2L-211ENST00000485349 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
SKIV2L-211ENST00000485349 MXD3Q9BW11 206 aa21.63■■□□□ 1.05
SKIV2L-211ENST00000485349 PLA2G12BQ9BX93 195 aa21.63■■□□□ 1.05
SKIV2L-211ENST00000485349 ANP32CO43423 234 aa21.62■■□□□ 1.05
SKIV2L-211ENST00000485349 VAMP4O75379 141 aa21.62■■□□□ 1.05
SKIV2L-211ENST00000485349 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
SKIV2L-211ENST00000485349 TXNRD3Q86VQ6 643 aa21.62■■□□□ 1.05
SKIV2L-211ENST00000485349 MYH16Q9H6N6 1097 aa21.62■■□□□ 1.05
SKIV2L-211ENST00000485349 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa21.61■■□□□ 1.05
SKIV2L-211ENST00000485349 KLRK1P26718 216 aa21.61■■□□□ 1.05
SKIV2L-211ENST00000485349 DACT2Q5SW24 774 aa21.61■■□□□ 1.05
SKIV2L-211ENST00000485349 WDR63Q8IWG1 891 aa21.61■■□□□ 1.05
SKIV2L-211ENST00000485349 LINS1Q8NG48 757 aa21.61■■□□□ 1.05
SKIV2L-211ENST00000485349 FBXW7Q969H0 707 aa21.61■■□□□ 1.05
SKIV2L-211ENST00000485349 CSF1RP07333 972 aa21.6■■□□□ 1.05
SKIV2L-211ENST00000485349 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
SKIV2L-211ENST00000485349 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
SKIV2L-211ENST00000485349 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
SKIV2L-211ENST00000485349 AKAP11Q9UKA4 1901 aa21.6■■□□□ 1.05
SKIV2L-211ENST00000485349 ZNF804BA4D1E1 1349 aa21.59■■□□□ 1.05
SKIV2L-211ENST00000485349 COA1Q9GZY4 146 aa21.59■■□□□ 1.05
SKIV2L-211ENST00000485349 LEMD3Q9Y2U8 911 aa21.59■■□□□ 1.05
SKIV2L-211ENST00000485349 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa21.58■■□□□ 1.05
SKIV2L-211ENST00000485349 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
SKIV2L-211ENST00000485349 F6X3S4 739 aa21.58■■□□□ 1.05
SKIV2L-211ENST00000485349 CCDC102AQ96A19 550 aa21.58■■□□□ 1.05
SKIV2L-211ENST00000485349 MPHOSPH8Q99549 860 aa21.58■■□□□ 1.05
SKIV2L-211ENST00000485349 SLC10A3P09131 477 aa21.57■■□□□ 1.04
SKIV2L-211ENST00000485349 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
SKIV2L-211ENST00000485349 NBPF9Q3BBW0 867 aa21.57■■□□□ 1.04
SKIV2L-211ENST00000485349 STRIP1Q5VSL9 837 aa21.57■■□□□ 1.04
SKIV2L-211ENST00000485349 ANKRD2Q9GZV1 360 aa21.57■■□□□ 1.04
SKIV2L-211ENST00000485349 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
SKIV2L-211ENST00000485349 CHRNDQ07001 517 aa21.56■■□□□ 1.04
SKIV2L-211ENST00000485349 MYO3BQ8WXR4 1341 aa21.55■■□□□ 1.04
SKIV2L-211ENST00000485349 FOXO4P98177 505 aa21.55■■□□□ 1.04
SKIV2L-211ENST00000485349 BEND3Q5T5X7 828 aa21.55■■□□□ 1.04
SKIV2L-211ENST00000485349 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa21.54■■□□□ 1.04
SKIV2L-211ENST00000485349 SASH1O94885 1247 aa21.54■■□□□ 1.04
SKIV2L-211ENST00000485349 KCNJ4P48050 445 aa21.54■■□□□ 1.04
SKIV2L-211ENST00000485349 RASAL3Q86YV0 1011 aa21.54■■□□□ 1.04
SKIV2L-211ENST00000485349 OGFOD1Q8N543 542 aa21.54■■□□□ 1.04
SKIV2L-211ENST00000485349 MCOLN1Q9GZU1 580 aa21.54■■□□□ 1.04
SKIV2L-211ENST00000485349 IRS2Q9Y4H2 1338 aa21.54■■□□□ 1.04
SKIV2L-211ENST00000485349 CCDC85CA6NKD9 419 aa21.53■■□□□ 1.04
SKIV2L-211ENST00000485349 SNAP23O00161 211 aa21.53■■□□□ 1.04
SKIV2L-211ENST00000485349 WNT10BO00744 389 aa21.53■■□□□ 1.04
SKIV2L-211ENST00000485349 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa21.53■■□□□ 1.04
SKIV2L-211ENST00000485349 MOB2Q70IA6 237 aa21.53■■□□□ 1.04
SKIV2L-211ENST00000485349 SAGE1Q9NXZ1 904 aa21.53■■□□□ 1.04
SKIV2L-211ENST00000485349 CHMP3Q9Y3E7 222 aa21.53■■□□□ 1.04
SKIV2L-211ENST00000485349 ECM29Q5VYK3 1845 aa21.52■■□□□ 1.04
SKIV2L-211ENST00000485349 TAF5LO75529 589 aa21.52■■□□□ 1.04
SKIV2L-211ENST00000485349 FKBP1BP68106 108 aa21.52■■□□□ 1.04
SKIV2L-211ENST00000485349 GTF2IP78347 998 aa21.52■■□□□ 1.04
SKIV2L-211ENST00000485349 TTLL5Q6EMB2 1281 aa21.52■■□□□ 1.04
SKIV2L-211ENST00000485349 KIAA0825Q8IV33 1275 aa21.52■■□□□ 1.04
SKIV2L-211ENST00000485349 FAM9BQ8IZU0 186 aa21.52■■□□□ 1.04
SKIV2L-211ENST00000485349 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
SKIV2L-211ENST00000485349 EPHA10Q5JZY3 1008 aa21.51■■□□□ 1.03
SKIV2L-211ENST00000485349 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
SKIV2L-211ENST00000485349 RNF186Q9NXI6 227 aa21.51■■□□□ 1.03
SKIV2L-211ENST00000485349 TRPA1O75762 1119 aa21.5■■□□□ 1.03
SKIV2L-211ENST00000485349 DGKZQ13574 1117 aa21.5■■□□□ 1.03
SKIV2L-211ENST00000485349 CSRNP1Q96S65 589 aa21.5■■□□□ 1.03
SKIV2L-211ENST00000485349 CD209Q9NNX6 404 aa21.5■■□□□ 1.03
SKIV2L-211ENST00000485349 UBE2Q2LH0YL09 131 aa21.49■■□□□ 1.03
SKIV2L-211ENST00000485349 GRM8O00222 908 aa21.49■■□□□ 1.03
SKIV2L-211ENST00000485349 LMBR1LQ6UX01 489 aa21.49■■□□□ 1.03
SKIV2L-211ENST00000485349 CERS5Q8N5B7 392 aa21.48■■□□□ 1.03
SKIV2L-211ENST00000485349 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
SKIV2L-211ENST00000485349 MMP14P50281 582 aa21.47■■□□□ 1.03
SKIV2L-211ENST00000485349 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
SKIV2L-211ENST00000485349 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
SKIV2L-211ENST00000485349 HDAC9Q9UKV0 1011 aa21.47■■□□□ 1.03
SKIV2L-211ENST00000485349 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
SKIV2L-211ENST00000485349 CCDC57Q2TAC2 916 aa21.46■■□□□ 1.03
SKIV2L-211ENST00000485349 SLC4A10Q6U841 1118 aa21.46■■□□□ 1.03
SKIV2L-211ENST00000485349 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
SKIV2L-211ENST00000485349 TAF7LQ5H9L4 462 aa21.45■■□□□ 1.02
SKIV2L-211ENST00000485349 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
SKIV2L-211ENST00000485349 ARAP2Q8WZ64 1704 aa21.45■■□□□ 1.02
SKIV2L-211ENST00000485349 ZNF521Q96K83 1311 aa21.45■■□□□ 1.02
SKIV2L-211ENST00000485349 IL1R1P14778 569 aa21.44■■□□□ 1.02
SKIV2L-211ENST00000485349 NF2P35240 595 aa21.44■■□□□ 1.02
SKIV2L-211ENST00000485349 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa21.44■■□□□ 1.02
SKIV2L-211ENST00000485349 ZNF804AQ7Z570 1209 aa21.44■■□□□ 1.02
SKIV2L-211ENST00000485349 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
SKIV2L-211ENST00000485349 JAG2Q9Y219 1238 aa21.44■■□□□ 1.02
SKIV2L-211ENST00000485349 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 125.8 ms