RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468253.1

NPHP4-206, Transcript of nephrocystin 4, humanhuman

TSL 2

Gene NPHP4, Length 781 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4-206ENST00000468253 SNAP23O00161 211 aa24.92■■□□□ 1.58
NPHP4-206ENST00000468253 RPS12P25398 132 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
NPHP4-206ENST00000468253 IL15P40933 162 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
NPHP4-206ENST00000468253 KCNQ5Q9NR82 932 aa24.92■■□□□ 1.58
NPHP4-206ENST00000468253 PSMD14O00487 310 aa24.91■■□□□ 1.58
NPHP4-206ENST00000468253 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
NPHP4-206ENST00000468253 C1QTNF8P60827 252 aa24.91■■□□□ 1.58
NPHP4-206ENST00000468253 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
NPHP4-206ENST00000468253 WDR90Q96KV7 1748 aa24.91■■□□□ 1.58
NPHP4-206ENST00000468253 TIAM2Q8IVF5 1701 aa24.9■■□□□ 1.58
NPHP4-206ENST00000468253 USP17L3A6NCW0 530 aa24.9■■□□□ 1.58
NPHP4-206ENST00000468253 USP17L4A6NCW7 530 aa24.9■■□□□ 1.58
NPHP4-206ENST00000468253 SCNN1DP51172 638 aa24.9■■□□□ 1.58
NPHP4-206ENST00000468253 USP17L1Q7RTZ2 530 aa24.9■■□□□ 1.58
NPHP4-206ENST00000468253 SSH3Q8TE77 659 aa24.9■■□□□ 1.58
NPHP4-206ENST00000468253 CD209Q9NNX6 404 aa24.9■■□□□ 1.58
NPHP4-206ENST00000468253 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa24.9■■□□□ 1.58
NPHP4-206ENST00000468253 GPRC5DQ9NZD1 345 aa24.9■■□□□ 1.58
NPHP4-206ENST00000468253 CEP126Q9P2H0 1117 aa24.9■■□□□ 1.58
NPHP4-206ENST00000468253 COG6Q9Y2V7 657 aa24.9■■□□□ 1.58
NPHP4-206ENST00000468253 EPHX2P34913 555 aa24.89■■□□□ 1.58
NPHP4-206ENST00000468253 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
NPHP4-206ENST00000468253 POLA2Q14181 598 aa24.89■■□□□ 1.58
NPHP4-206ENST00000468253 STRIP1Q5VSL9 837 aa24.89■■□□□ 1.58
NPHP4-206ENST00000468253 ZNF804AQ7Z570 1209 aa24.89■■□□□ 1.58
NPHP4-206ENST00000468253 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa24.88■■□□□ 1.57
NPHP4-206ENST00000468253 IL1R1P14778 569 aa24.88■■□□□ 1.57
NPHP4-206ENST00000468253 FGFR2P21802 821 aa24.88■■□□□ 1.57
NPHP4-206ENST00000468253 KLRK1P26718 216 aa24.88■■□□□ 1.57
NPHP4-206ENST00000468253 FSTL1Q12841 308 aa24.88■■□□□ 1.57
NPHP4-206ENST00000468253 AGBL3Q8NEM8 1001 aa24.88■■□□□ 1.57
NPHP4-206ENST00000468253 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
NPHP4-206ENST00000468253 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
NPHP4-206ENST00000468253 MMP14P50281 582 aa24.87■■□□□ 1.57
NPHP4-206ENST00000468253 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
NPHP4-206ENST00000468253 FBXO33Q7Z6M2 555 aa24.87■■□□□ 1.57
NPHP4-206ENST00000468253 SIL1Q9H173 461 aa24.87■■□□□ 1.57
NPHP4-206ENST00000468253 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
NPHP4-206ENST00000468253 EPS15P42566 896 aa24.86■■□□□ 1.57
NPHP4-206ENST00000468253 C20orf194Q5TEA3 1177 aa24.86■■□□□ 1.57
NPHP4-206ENST00000468253 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
NPHP4-206ENST00000468253 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
NPHP4-206ENST00000468253 LPIN2Q92539 896 aa24.86■■□□□ 1.57
NPHP4-206ENST00000468253 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
NPHP4-206ENST00000468253 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
NPHP4-206ENST00000468253 H7C1D1 291 aa24.85■■□□□ 1.57
NPHP4-206ENST00000468253 SASH1O94885 1247 aa24.85■■□□□ 1.57
NPHP4-206ENST00000468253 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
NPHP4-206ENST00000468253 TTLL5Q6EMB2 1281 aa24.85■■□□□ 1.57
NPHP4-206ENST00000468253 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
NPHP4-206ENST00000468253 SMC1BQ8NDV3 1235 aa24.85■■□□□ 1.57
NPHP4-206ENST00000468253 GMLQ99445 158 aa24.85■■□□□ 1.57
NPHP4-206ENST00000468253 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
NPHP4-206ENST00000468253 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP24.84■■□□□ 1.57
NPHP4-206ENST00000468253 CAVIN4Q5BKX8 364 aa24.84■■□□□ 1.57
NPHP4-206ENST00000468253 DACT2Q5SW24 774 aa24.84■■□□□ 1.57
NPHP4-206ENST00000468253 LDHDQ86WU2 507 aa24.84■■□□□ 1.57
NPHP4-206ENST00000468253 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
NPHP4-206ENST00000468253 C1orf115Q9H7X2 142 aa24.84■■□□□ 1.57
NPHP4-206ENST00000468253 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
NPHP4-206ENST00000468253 RRP1P56182 461 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
NPHP4-206ENST00000468253 CEP85Q6P2H3 762 aa24.83■■□□□ 1.57
NPHP4-206ENST00000468253 ZNF609O15014 1411 aa24.83■■□□□ 1.57
NPHP4-206ENST00000468253 SLC5A1P13866 664 aa24.82■■□□□ 1.56
NPHP4-206ENST00000468253 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
NPHP4-206ENST00000468253 AKAP2Q9Y2D5 859 aa24.82■■□□□ 1.56
NPHP4-206ENST00000468253 MYO3BQ8WXR4 1341 aa24.82■■□□□ 1.56
NPHP4-206ENST00000468253 ZBTB22O15209 634 aa24.81■■□□□ 1.56
NPHP4-206ENST00000468253 GYG1P46976 350 aa24.81■■□□□ 1.56
NPHP4-206ENST00000468253 CHADLQ6NUI6 762 aa24.81■■□□□ 1.56
NPHP4-206ENST00000468253 VPS37DQ86XT2 251 aa24.81■■□□□ 1.56
NPHP4-206ENST00000468253 SCN4AP35499 1836 aa24.8■■□□□ 1.56
NPHP4-206ENST00000468253 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
NPHP4-206ENST00000468253 GTF2IP78347 998 aa24.8■■□□□ 1.56
NPHP4-206ENST00000468253 ATP2B3Q16720 1220 aa24.8■■□□□ 1.56
NPHP4-206ENST00000468253 MICALL2Q8IY33 904 aa24.8■■□□□ 1.56
NPHP4-206ENST00000468253 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
NPHP4-206ENST00000468253 FAM205AQ6ZU69 1335 aa24.8■■□□□ 1.56
NPHP4-206ENST00000468253 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
NPHP4-206ENST00000468253 PGAP2Q9UHJ9 254 aa24.79■■□□□ 1.56
NPHP4-206ENST00000468253 SPEF2Q9C093 1822 aa24.79■■□□□ 1.56
NPHP4-206ENST00000468253 SURF6O75683 361 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
NPHP4-206ENST00000468253 USP17L8P0C7I0 530 aa24.78■■□□□ 1.56
NPHP4-206ENST00000468253 TFCP2Q12800 502 aa24.78■■□□□ 1.56
NPHP4-206ENST00000468253 GPR108Q9NPR9 543 aa24.78■■□□□ 1.56
NPHP4-206ENST00000468253 HMMRO75330 724 aa24.77■■□□□ 1.56
NPHP4-206ENST00000468253 POTEIP0CG38 1075 aa24.77■■□□□ 1.56
NPHP4-206ENST00000468253 POTEJP0CG39 1038 aa24.77■■□□□ 1.56
NPHP4-206ENST00000468253 BCAMP50895 628 aa24.77■■□□□ 1.56
NPHP4-206ENST00000468253 CLEC11AQ9Y240 323 aa24.77■■□□□ 1.56
NPHP4-206ENST00000468253 OGFOD1Q8N543 542 aa24.76■■□□□ 1.55
NPHP4-206ENST00000468253 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
NPHP4-206ENST00000468253 TIMM10P62072 90 aa24.75■■□□□ 1.55
NPHP4-206ENST00000468253 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa24.75■■□□□ 1.55
NPHP4-206ENST00000468253 FBXW7Q969H0 707 aa24.75■■□□□ 1.55
NPHP4-206ENST00000468253 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
NPHP4-206ENST00000468253 SIRT2Q8IXJ6 389 aa24.74■■□□□ 1.55
NPHP4-206ENST00000468253 SHTN1A0MZ66 631 aa24.73■■□□□ 1.55
NPHP4-206ENST00000468253 SAMD7Q7Z3H4 446 aa24.73■■□□□ 1.55
NPHP4-206ENST00000468253 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.3 ms