RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462322.2

SMKR1-201, Transcript of small lysine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMKR1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1-201ENST00000462322 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP30.09■■■□□ 2.41
SMKR1-201ENST00000462322 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP30.08■■■□□ 2.41
SMKR1-201ENST00000462322 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
SMKR1-201ENST00000462322 SAMD7Q7Z3H4 446 aa30.07■■■□□ 2.4
SMKR1-201ENST00000462322 AGBL3Q8NEM8 1001 aa30.07■■■□□ 2.4
SMKR1-201ENST00000462322 CREBZFQ9NS37 354 aa30.07■■■□□ 2.4
SMKR1-201ENST00000462322 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
SMKR1-201ENST00000462322 FBXW7Q969H0 707 aa30.06■■■□□ 2.4
SMKR1-201ENST00000462322 KLRG1Q96E93 195 aa30.06■■■□□ 2.4
SMKR1-201ENST00000462322 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
SMKR1-201ENST00000462322 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
SMKR1-201ENST00000462322 PSME4Q14997 1843 aa30.05■■■□□ 2.4
SMKR1-201ENST00000462322 TRIM27P14373 513 aa30.04■■■□□ 2.4
SMKR1-201ENST00000462322 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
SMKR1-201ENST00000462322 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa30.04■■■□□ 2.4
SMKR1-201ENST00000462322 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
SMKR1-201ENST00000462322 PGAP2Q9UHJ9 254 aa30.04■■■□□ 2.4
SMKR1-201ENST00000462322 HDAC5Q9UQL6 1122 aa30.04■■■□□ 2.4
SMKR1-201ENST00000462322 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa30.04■■■□□ 2.4
SMKR1-201ENST00000462322 A0A1B0GUL6 1792 aa30.04■■■□□ 2.4
SMKR1-201ENST00000462322 TMEM88BA6NKF7 163 aa30.03■■■□□ 2.4
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF609O15014 1411 aa30.03■■■□□ 2.4
SMKR1-201ENST00000462322 MROH5Q6ZUA9 1318 aa30.02■■■□□ 2.4
SMKR1-201ENST00000462322 IRS2Q9Y4H2 1338 aa30.02■■■□□ 2.4
SMKR1-201ENST00000462322 EGFRP00533 1210 aa30.02■■■□□ 2.4
SMKR1-201ENST00000462322 DACT2Q5SW24 774 aa30.02■■■□□ 2.4
SMKR1-201ENST00000462322 STRIP1Q5VSL9 837 aa30.02■■■□□ 2.4
SMKR1-201ENST00000462322 KLHDC4Q8TBB5 520 aa30.02■■■□□ 2.4
SMKR1-201ENST00000462322 GMLQ99445 158 aa30.02■■■□□ 2.4
SMKR1-201ENST00000462322 CD209Q9NNX6 404 aa30.02■■■□□ 2.4
SMKR1-201ENST00000462322 LRRC24Q50LG9 513 aa30.01■■■□□ 2.39
SMKR1-201ENST00000462322 TTLL5Q6EMB2 1281 aa30.01■■■□□ 2.39
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF804AQ7Z570 1209 aa30.01■■■□□ 2.39
SMKR1-201ENST00000462322 MEIS3Q99687 375 aa30.01■■■□□ 2.39
SMKR1-201ENST00000462322 TNNQ9UQP3 1299 aa30.01■■■□□ 2.39
SMKR1-201ENST00000462322 TRAF5O00463 557 aa30■■■□□ 2.39
SMKR1-201ENST00000462322 USP17L8P0C7I0 530 aa30■■■□□ 2.39
SMKR1-201ENST00000462322 UBE4AQ14139 1066 aa30■■■□□ 2.39
SMKR1-201ENST00000462322 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa30■■■□□ 2.39
SMKR1-201ENST00000462322 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa30■■■□□ 2.39
SMKR1-201ENST00000462322 CLUAP1Q96AJ1 413 aa30■■■□□ 2.39
SMKR1-201ENST00000462322 MXD3Q9BW11 206 aa30■■■□□ 2.39
SMKR1-201ENST00000462322 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
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SMKR1-201ENST00000462322 GTF2IP78347 998 aa29.99■■■□□ 2.39
SMKR1-201ENST00000462322 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP29.99■■■□□ 2.39
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SMKR1-201ENST00000462322 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP29.99■■■□□ 2.39
SMKR1-201ENST00000462322 MYO3BQ8WXR4 1341 aa29.97■■■□□ 2.39
SMKR1-201ENST00000462322 GNAI3P08754 354 aa29.97■■■□□ 2.39
SMKR1-201ENST00000462322 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP29.97■■■□□ 2.39
SMKR1-201ENST00000462322 CDC37L1Q7L3B6 337 aa29.97■■■□□ 2.39
SMKR1-201ENST00000462322 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
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SMKR1-201ENST00000462322 OGFOD1Q8N543 542 aa29.95■■■□□ 2.39
SMKR1-201ENST00000462322 MYOZ2Q9NPC6 264 aa29.95■■■□□ 2.39
SMKR1-201ENST00000462322 EYA2O00167 538 aa29.94■■■□□ 2.38
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SMKR1-201ENST00000462322 KRT26Q7Z3Y9 468 aa29.92■■■□□ 2.38
SMKR1-201ENST00000462322 VGLL2Q8N8G2 317 aa29.92■■■□□ 2.38
SMKR1-201ENST00000462322 CST9Q5W186 159 aa29.91■■■□□ 2.38
SMKR1-201ENST00000462322 KIAA0825Q8IV33 1275 aa29.91■■■□□ 2.38
SMKR1-201ENST00000462322 TMEM57Q8N5G2 664 aa29.91■■■□□ 2.38
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SMKR1-201ENST00000462322 GGA3Q9NZ52 723 aa29.91■■■□□ 2.38
SMKR1-201ENST00000462322 TRPM7Q96QT4 1865 aa29.91■■■□□ 2.38
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SMKR1-201ENST00000462322 HDAC9Q9UKV0 1011 aa29.89■■■□□ 2.38
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SMKR1-201ENST00000462322 CIAO1O76071 339 aa29.87■■■□□ 2.37
SMKR1-201ENST00000462322 GNAI2P04899 355 aa29.87■■■□□ 2.37
SMKR1-201ENST00000462322 DEFB115Q30KQ5 88 aa29.87■■■□□ 2.37
SMKR1-201ENST00000462322 CAVIN4Q5BKX8 364 aa29.87■■■□□ 2.37
SMKR1-201ENST00000462322 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP29.87■■■□□ 2.37
SMKR1-201ENST00000462322 SULF1Q8IWU6 871 aa29.87■■■□□ 2.37
SMKR1-201ENST00000462322 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP29.87■■■□□ 2.37
SMKR1-201ENST00000462322 CERS5Q8N5B7 392 aa29.87■■■□□ 2.37
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