RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434333.1

HLA-B-250, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, humanhuman

Gene HLA-B, Length 863 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-B-250ENST00000434333 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
HLA-B-250ENST00000434333 USP17L1Q7RTZ2 530 aa25.6■■□□□ 1.69
HLA-B-250ENST00000434333 LEMD3Q9Y2U8 911 aa25.6■■□□□ 1.69
HLA-B-250ENST00000434333 A0A1B0GUL6 1792 aa25.59■■□□□ 1.69
HLA-B-250ENST00000434333 AOC2O75106 756 aa25.59■■□□□ 1.69
HLA-B-250ENST00000434333 LBX1P52954 281 aa25.59■■□□□ 1.69
HLA-B-250ENST00000434333 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
HLA-B-250ENST00000434333 GGA3Q9NZ52 723 aa25.59■■□□□ 1.69
HLA-B-250ENST00000434333 KLRK1P26718 216 aa25.58■■□□□ 1.69
HLA-B-250ENST00000434333 MPHOSPH8Q99549 860 aa25.58■■□□□ 1.69
HLA-B-250ENST00000434333 ZNF804BA4D1E1 1349 aa25.58■■□□□ 1.69
HLA-B-250ENST00000434333 CHRNDQ07001 517 aa25.57■■□□□ 1.68
HLA-B-250ENST00000434333 EPHA10Q5JZY3 1008 aa25.57■■□□□ 1.68
HLA-B-250ENST00000434333 DACT2Q5SW24 774 aa25.57■■□□□ 1.68
HLA-B-250ENST00000434333 ANKRD2Q9GZV1 360 aa25.57■■□□□ 1.68
HLA-B-250ENST00000434333 COA1Q9GZY4 146 aa25.57■■□□□ 1.68
HLA-B-250ENST00000434333 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa25.56■■□□□ 1.68
HLA-B-250ENST00000434333 USP17L8P0C7I0 530 aa25.56■■□□□ 1.68
HLA-B-250ENST00000434333 MAP2K2P36507 400 aa25.56■■□□□ 1.68
HLA-B-250ENST00000434333 MXD3Q9BW11 206 aa25.56■■□□□ 1.68
HLA-B-250ENST00000434333 GRM8O00222 908 aa25.55■■□□□ 1.68
HLA-B-250ENST00000434333 SCARF1Q14162 830 aa25.55■■□□□ 1.68
HLA-B-250ENST00000434333 MYOZ2Q9NPC6 264 aa25.55■■□□□ 1.68
HLA-B-250ENST00000434333 IRS2Q9Y4H2 1338 aa25.55■■□□□ 1.68
HLA-B-250ENST00000434333 CAPN15O75808 1086 aa25.54■■□□□ 1.68
HLA-B-250ENST00000434333 HUNKP57058 714 aa25.54■■□□□ 1.68
HLA-B-250ENST00000434333 SNAP23O00161 211 aa25.53■■□□□ 1.68
HLA-B-250ENST00000434333 ALDH1L1O75891 902 aa25.53■■□□□ 1.68
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HLA-B-250ENST00000434333 STRIP1Q5VSL9 837 aa25.53■■□□□ 1.68
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HLA-B-250ENST00000434333 LMBR1LQ6UX01 489 aa25.53■■□□□ 1.68
HLA-B-250ENST00000434333 SULF1Q8IWU6 871 aa25.53■■□□□ 1.68
HLA-B-250ENST00000434333 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
HLA-B-250ENST00000434333 SLC4A10Q6U841 1118 aa25.51■■□□□ 1.67
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HLA-B-250ENST00000434333 ZIC5Q96T25 663 aa25.51■■□□□ 1.67
HLA-B-250ENST00000434333 CHMP3Q9Y3E7 222 aa25.51■■□□□ 1.67
HLA-B-250ENST00000434333 MYO3BQ8WXR4 1341 aa25.51■■□□□ 1.67
HLA-B-250ENST00000434333 TAF5LO75529 589 aa25.5■■□□□ 1.67
HLA-B-250ENST00000434333 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
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HLA-B-250ENST00000434333 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa25.5■■□□□ 1.67
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HLA-B-250ENST00000434333 C2orf69Q8N8R5 385 aa25.49■■□□□ 1.67
HLA-B-250ENST00000434333 FBXW7Q969H0 707 aa25.49■■□□□ 1.67
HLA-B-250ENST00000434333 KAZALD1Q96I82 304 aa25.49■■□□□ 1.67
HLA-B-250ENST00000434333 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
HLA-B-250ENST00000434333 CD209Q9NNX6 404 aa25.49■■□□□ 1.67
HLA-B-250ENST00000434333 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
HLA-B-250ENST00000434333 KCNJ4P48050 445 aa25.48■■□□□ 1.67
HLA-B-250ENST00000434333 NBPF9Q3BBW0 867 aa25.48■■□□□ 1.67
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HLA-B-250ENST00000434333 BEGAINQ9BUH8 593 aa25.48■■□□□ 1.67
HLA-B-250ENST00000434333 UTYO14607 1347 aa25.47■■□□□ 1.67
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HLA-B-250ENST00000434333 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
HLA-B-250ENST00000434333 WNT10BO00744 389 aa25.46■■□□□ 1.67
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HLA-B-250ENST00000434333 SLFN5Q08AF3 891 aa25.46■■□□□ 1.67
HLA-B-250ENST00000434333 CCDC57Q2TAC2 916 aa25.46■■□□□ 1.67
HLA-B-250ENST00000434333 OGFOD1Q8N543 542 aa25.45■■□□□ 1.66
HLA-B-250ENST00000434333 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa25.44■■□□□ 1.66
HLA-B-250ENST00000434333 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa25.44■■□□□ 1.66
HLA-B-250ENST00000434333 KIAA0825Q8IV33 1275 aa25.44■■□□□ 1.66
HLA-B-250ENST00000434333 SSH1Q8WYL5 1049 aa25.44■■□□□ 1.66
HLA-B-250ENST00000434333 CERS5Q8N5B7 392 aa25.43■■□□□ 1.66
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HLA-B-250ENST00000434333 SASH1O94885 1247 aa25.42■■□□□ 1.66
HLA-B-250ENST00000434333 IL1R1P14778 569 aa25.42■■□□□ 1.66
HLA-B-250ENST00000434333 MMP14P50281 582 aa25.42■■□□□ 1.66
HLA-B-250ENST00000434333 TAF7LQ5H9L4 462 aa25.42■■□□□ 1.66
HLA-B-250ENST00000434333 CDCA7LQ96GN5 454 aa25.42■■□□□ 1.66
HLA-B-250ENST00000434333 SLC10A3P09131 477 aa25.41■■□□□ 1.66
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HLA-B-250ENST00000434333 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa25.4■■□□□ 1.66
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HLA-B-250ENST00000434333 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
HLA-B-250ENST00000434333 ZNF804AQ7Z570 1209 aa25.39■■□□□ 1.66
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HLA-B-250ENST00000434333 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
HLA-B-250ENST00000434333 HDAC9Q9UKV0 1011 aa25.39■■□□□ 1.66
HLA-B-250ENST00000434333 MOB2Q70IA6 237 aa25.38■■□□□ 1.65
HLA-B-250ENST00000434333 ANKRD44Q8N8A2 993 aa25.38■■□□□ 1.65
HLA-B-250ENST00000434333 RASAL3Q86YV0 1011 aa25.37■■□□□ 1.65
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