RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392415.6

UBE2E3-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,347 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-201ENST00000392415 SAMD7Q7Z3H4 446 aa25.91■■□□□ 1.74
UBE2E3-201ENST00000392415 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
UBE2E3-201ENST00000392415 KLRK1P26718 216 aa25.9■■□□□ 1.74
UBE2E3-201ENST00000392415 ANKRD44Q8N8A2 993 aa25.9■■□□□ 1.74
UBE2E3-201ENST00000392415 CNNM1Q9NRU3 951 aa25.9■■□□□ 1.74
UBE2E3-201ENST00000392415 KIF16BQ96L93 1317 aa25.9■■□□□ 1.74
UBE2E3-201ENST00000392415 SNAP23O00161 211 aa25.89■■□□□ 1.74
UBE2E3-201ENST00000392415 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
UBE2E3-201ENST00000392415 ARHGAP45Q92619 1136 aa25.89■■□□□ 1.74
UBE2E3-201ENST00000392415 GMLQ99445 158 aa25.89■■□□□ 1.74
UBE2E3-201ENST00000392415 IRS2Q9Y4H2 1338 aa25.89■■□□□ 1.74
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.73
UBE2E3-201ENST00000392415 TRPM7Q96QT4 1865 aa25.89■■□□□ 1.73
UBE2E3-201ENST00000392415 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
UBE2E3-201ENST00000392415 EGFRP00533 1210 aa25.88■■□□□ 1.73
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
UBE2E3-201ENST00000392415 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP25.88■■□□□ 1.73
UBE2E3-201ENST00000392415 TRAF5O00463 557 aa25.87■■□□□ 1.73
UBE2E3-201ENST00000392415 DACT2Q5SW24 774 aa25.87■■□□□ 1.73
UBE2E3-201ENST00000392415 STRIP1Q5VSL9 837 aa25.87■■□□□ 1.73
UBE2E3-201ENST00000392415 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
UBE2E3-201ENST00000392415 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
UBE2E3-201ENST00000392415 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
UBE2E3-201ENST00000392415 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
UBE2E3-201ENST00000392415 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
UBE2E3-201ENST00000392415 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa25.86■■□□□ 1.73
UBE2E3-201ENST00000392415 CNTNAP1P78357 1384 aa25.85■■□□□ 1.73
UBE2E3-201ENST00000392415 PLIN1O60240 522 aa25.85■■□□□ 1.73
UBE2E3-201ENST00000392415 USP17L8P0C7I0 530 aa25.85■■□□□ 1.73
UBE2E3-201ENST00000392415 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa25.85■■□□□ 1.73
UBE2E3-201ENST00000392415 CDC37L1Q7L3B6 337 aa25.85■■□□□ 1.73
UBE2E3-201ENST00000392415 CD209Q9NNX6 404 aa25.85■■□□□ 1.73
UBE2E3-201ENST00000392415 TTLL5Q6EMB2 1281 aa25.84■■□□□ 1.73
UBE2E3-201ENST00000392415 ZBED9Q6R2W3 1325 aa25.83■■□□□ 1.73
UBE2E3-201ENST00000392415 MYO3BQ8WXR4 1341 aa25.83■■□□□ 1.73
UBE2E3-201ENST00000392415 UBE4AQ14139 1066 aa25.83■■□□□ 1.73
UBE2E3-201ENST00000392415 CST9Q5W186 159 aa25.83■■□□□ 1.73
UBE2E3-201ENST00000392415 MROH5Q6ZUA9 1318 aa25.82■■□□□ 1.72
UBE2E3-201ENST00000392415 RASSF10A6NK89 507 aa25.82■■□□□ 1.72
UBE2E3-201ENST00000392415 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
UBE2E3-201ENST00000392415 BCAR3O75815 825 aa25.82■■□□□ 1.72
UBE2E3-201ENST00000392415 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
UBE2E3-201ENST00000392415 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF804AQ7Z570 1209 aa25.82■■□□□ 1.72
UBE2E3-201ENST00000392415 MXD3Q9BW11 206 aa25.82■■□□□ 1.72
UBE2E3-201ENST00000392415 IL1R1P14778 569 aa25.81■■□□□ 1.72
UBE2E3-201ENST00000392415 LRRC24Q50LG9 513 aa25.81■■□□□ 1.72
UBE2E3-201ENST00000392415 FBXW7Q969H0 707 aa25.81■■□□□ 1.72
UBE2E3-201ENST00000392415 MYOZ2Q9NPC6 264 aa25.81■■□□□ 1.72
UBE2E3-201ENST00000392415 GTF2IP78347 998 aa25.8■■□□□ 1.72
UBE2E3-201ENST00000392415 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
UBE2E3-201ENST00000392415 TRIM27P14373 513 aa25.79■■□□□ 1.72
UBE2E3-201ENST00000392415 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
UBE2E3-201ENST00000392415 MMP14P50281 582 aa25.79■■□□□ 1.72
UBE2E3-201ENST00000392415 DEFB115Q30KQ5 88 aa25.79■■□□□ 1.72
UBE2E3-201ENST00000392415 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa25.79■■□□□ 1.72
UBE2E3-201ENST00000392415 USP48Q86UV5 1035 aa25.79■■□□□ 1.72
UBE2E3-201ENST00000392415 KLHDC4Q8TBB5 520 aa25.79■■□□□ 1.72
UBE2E3-201ENST00000392415 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
UBE2E3-201ENST00000392415 HDAC5Q9UQL6 1122 aa25.79■■□□□ 1.72
UBE2E3-201ENST00000392415 CELF2O95319 508 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
UBE2E3-201ENST00000392415 KRT26Q7Z3Y9 468 aa25.78■■□□□ 1.72
UBE2E3-201ENST00000392415 OGFOD1Q8N543 542 aa25.78■■□□□ 1.72
UBE2E3-201ENST00000392415 MEIS3Q99687 375 aa25.78■■□□□ 1.72
UBE2E3-201ENST00000392415 SCARF1Q14162 830 aa25.77■■□□□ 1.72
UBE2E3-201ENST00000392415 VGLL2Q8N8G2 317 aa25.77■■□□□ 1.72
UBE2E3-201ENST00000392415 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
UBE2E3-201ENST00000392415 GGA3Q9NZ52 723 aa25.77■■□□□ 1.72
UBE2E3-201ENST00000392415 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
UBE2E3-201ENST00000392415 PDE8BO95263 885 aa25.76■■□□□ 1.71
UBE2E3-201ENST00000392415 VEGFBP49765 207 aa25.76■■□□□ 1.71
UBE2E3-201ENST00000392415 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
UBE2E3-201ENST00000392415 METTL24Q5JXM2 366 aa25.76■■□□□ 1.71
UBE2E3-201ENST00000392415 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
UBE2E3-201ENST00000392415 TLL2Q9Y6L7 1015 aa25.76■■□□□ 1.71
UBE2E3-201ENST00000392415 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
UBE2E3-201ENST00000392415 TNNQ9UQP3 1299 aa25.75■■□□□ 1.71
UBE2E3-201ENST00000392415 EYA2O00167 538 aa25.74■■□□□ 1.71
UBE2E3-201ENST00000392415 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
UBE2E3-201ENST00000392415 DLK2Q6UY11 383 aa25.74■■□□□ 1.71
UBE2E3-201ENST00000392415 KIAA0825Q8IV33 1275 aa25.74■■□□□ 1.71
UBE2E3-201ENST00000392415 SULF1Q8IWU6 871 aa25.74■■□□□ 1.71
UBE2E3-201ENST00000392415 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa25.73■■□□□ 1.71
UBE2E3-201ENST00000392415 ADM5C9JUS6 153 aa25.73■■□□□ 1.71
UBE2E3-201ENST00000392415 SASH1O94885 1247 aa25.73■■□□□ 1.71
UBE2E3-201ENST00000392415 GNAI3P08754 354 aa25.73■■□□□ 1.71
UBE2E3-201ENST00000392415 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
UBE2E3-201ENST00000392415 GYG1P46976 350 aa25.73■■□□□ 1.71
UBE2E3-201ENST00000392415 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
UBE2E3-201ENST00000392415 SAPCD2Q86UD0 394 aa25.73■■□□□ 1.71
UBE2E3-201ENST00000392415 CERS5Q8N5B7 392 aa25.73■■□□□ 1.71
UBE2E3-201ENST00000392415 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF408Q9H9D4 720 aa25.73■■□□□ 1.71
UBE2E3-201ENST00000392415 HDAC9Q9UKV0 1011 aa25.73■■□□□ 1.71
UBE2E3-201ENST00000392415 NBPF9Q3BBW0 867 aa25.72■■□□□ 1.71
UBE2E3-201ENST00000392415 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa25.72■■□□□ 1.71
UBE2E3-201ENST00000392415 FBXO3Q9UK99 471 aa25.72■■□□□ 1.71
UBE2E3-201ENST00000392415 FAM205AQ6ZU69 1335 aa25.71■■□□□ 1.71
UBE2E3-201ENST00000392415 WNT10BO00744 389 aa25.71■■□□□ 1.71
UBE2E3-201ENST00000392415 FBXO33Q7Z6M2 555 aa25.71■■□□□ 1.71
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