RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359238.6

SNX11-201, Transcript of sorting nexin 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SNX11, Length 2,315 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX11-201ENST00000359238 SNX14Q9Y5W7 946 aa22.16■■□□□ 1.14
SNX11-201ENST00000359238 TAF1LQ8IZX4 1826 aa22.16■■□□□ 1.14
SNX11-201ENST00000359238 RXRBP28702 533 aa22.15■■□□□ 1.14
SNX11-201ENST00000359238 PI16Q6UXB8 463 aa22.15■■□□□ 1.14
SNX11-201ENST00000359238 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa22.15■■□□□ 1.14
SNX11-201ENST00000359238 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa22.15■■□□□ 1.14
SNX11-201ENST00000359238 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SNX11-201ENST00000359238 CEP126Q9P2H0 1117 aa22.15■■□□□ 1.14
SNX11-201ENST00000359238 NARFQ9UHQ1 456 aa22.15■■□□□ 1.14
SNX11-201ENST00000359238 SYCE3A1L190 88 aa22.15■■□□□ 1.14
SNX11-201ENST00000359238 C3orf67Q6ZVT6 689 aa22.15■■□□□ 1.14
SNX11-201ENST00000359238 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
SNX11-201ENST00000359238 PRIMPOLQ96LW4 560 aa22.15■■□□□ 1.14
SNX11-201ENST00000359238 C4BP0C0L5 1744 aa22.15■■□□□ 1.14
SNX11-201ENST00000359238 GOLIM4O00461 696 aa22.14■■□□□ 1.14
SNX11-201ENST00000359238 ZPR1O75312 459 aa22.14■■□□□ 1.14
SNX11-201ENST00000359238 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
SNX11-201ENST00000359238 GPR108Q9NPR9 543 aa22.14■■□□□ 1.14
SNX11-201ENST00000359238 SNRKQ9NRH2 765 aa22.14■■□□□ 1.14
SNX11-201ENST00000359238 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
SNX11-201ENST00000359238 ADCK5Q3MIX3 580 aa22.14■■□□□ 1.13
SNX11-201ENST00000359238 XAGE2Q96GT9 111 aa22.14■■□□□ 1.13
SNX11-201ENST00000359238 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
SNX11-201ENST00000359238 ZDHHC9Q9Y397 364 aa22.14■■□□□ 1.13
SNX11-201ENST00000359238 MBD3O95983 291 aa22.13■■□□□ 1.13
SNX11-201ENST00000359238 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
SNX11-201ENST00000359238 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa22.13■■□□□ 1.13
SNX11-201ENST00000359238 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP22.13■■□□□ 1.13
SNX11-201ENST00000359238 VGLL2Q8N8G2 317 aa22.13■■□□□ 1.13
SNX11-201ENST00000359238 MED23Q9ULK4 1368 aa22.13■■□□□ 1.13
SNX11-201ENST00000359238 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SNX11-201ENST00000359238 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SNX11-201ENST00000359238 CCDC24Q8N4L8 307 aa22.12■■□□□ 1.13
SNX11-201ENST00000359238 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SNX11-201ENST00000359238 CCDC171Q6TFL3 1326 aa22.12■■□□□ 1.13
SNX11-201ENST00000359238 SCN7AQ01118 1682 aa22.12■■□□□ 1.13
SNX11-201ENST00000359238 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SNX11-201ENST00000359238 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SNX11-201ENST00000359238 MCCP23508 829 aa22.11■■□□□ 1.13
SNX11-201ENST00000359238 ERFEQ4G0M1 354 aa22.11■■□□□ 1.13
SNX11-201ENST00000359238 METTL24Q5JXM2 366 aa22.11■■□□□ 1.13
SNX11-201ENST00000359238 IL17RAQ96F46 866 aa22.11■■□□□ 1.13
SNX11-201ENST00000359238 CNNM1Q9NRU3 951 aa22.11■■□□□ 1.13
SNX11-201ENST00000359238 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.13
SNX11-201ENST00000359238 ST18O60284 1047 aa22.11■■□□□ 1.13
SNX11-201ENST00000359238 DTNBO60941 627 aa22.11■■□□□ 1.13
SNX11-201ENST00000359238 PTMAP06454 111 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SNX11-201ENST00000359238 RFC4P35249 363 aa22.11■■□□□ 1.13
SNX11-201ENST00000359238 ANAPC15P60006 121 aa22.11■■□□□ 1.13
SNX11-201ENST00000359238 TRAPPC3LQ5T215 181 aa22.11■■□□□ 1.13
SNX11-201ENST00000359238 LRP5O75197 1615 aa22.1■■□□□ 1.13
SNX11-201ENST00000359238 AKAP11Q9UKA4 1901 aa22.1■■□□□ 1.13
SNX11-201ENST00000359238 NECTIN1Q15223 517 aa22.1■■□□□ 1.13
SNX11-201ENST00000359238 RUFY2Q8WXA3 655 aa22.1■■□□□ 1.13
SNX11-201ENST00000359238 PAG1Q9NWQ8 432 aa22.1■■□□□ 1.13
SNX11-201ENST00000359238 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SNX11-201ENST00000359238 POTEAQ6S8J7 498 aa22.09■■□□□ 1.13
SNX11-201ENST00000359238 PROM2Q8N271 834 aa22.09■■□□□ 1.13
SNX11-201ENST00000359238 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SNX11-201ENST00000359238 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SNX11-201ENST00000359238 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
SNX11-201ENST00000359238 TAF5LO75529 589 aa22.09■■□□□ 1.13
SNX11-201ENST00000359238 LAMB2P55268 1798 aa22.09■■□□□ 1.13
SNX11-201ENST00000359238 TXNRD1Q16881 649 aa22.08■■□□□ 1.13
SNX11-201ENST00000359238 SLC27A3Q5K4L6 730 aa22.08■■□□□ 1.13
SNX11-201ENST00000359238 ZNF710Q8N1W2 664 aa22.08■■□□□ 1.13
SNX11-201ENST00000359238 KBTBD3Q8NAB2 608 aa22.08■■□□□ 1.13
SNX11-201ENST00000359238 MAP4K1Q92918 833 aa22.08■■□□□ 1.13
SNX11-201ENST00000359238 TMX3Q96JJ7 454 aa22.08■■□□□ 1.13
SNX11-201ENST00000359238 SETDB2Q96T68 719 aa22.08■■□□□ 1.13
SNX11-201ENST00000359238 TSPY26PQ9H489 355 aa22.08■■□□□ 1.13
SNX11-201ENST00000359238 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
SNX11-201ENST00000359238 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.12
SNX11-201ENST00000359238 ATP2B3Q16720 1220 aa22.08■■□□□ 1.12
SNX11-201ENST00000359238 C4AP0C0L4 1744 aa22.07■■□□□ 1.12
SNX11-201ENST00000359238 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
SNX11-201ENST00000359238 ABCC12Q96J65 1359 aa22.07■■□□□ 1.12
SNX11-201ENST00000359238 KIF20AO95235 890 aa22.07■■□□□ 1.12
SNX11-201ENST00000359238 PIBF1Q8WXW3 757 aa22.07■■□□□ 1.12
SNX11-201ENST00000359238 FBXO3Q9UK99 471 aa22.07■■□□□ 1.12
SNX11-201ENST00000359238 A0A0G2JLW4 131 aa22.06■■□□□ 1.12
SNX11-201ENST00000359238 APBA3O96018 575 aa22.06■■□□□ 1.12
SNX11-201ENST00000359238 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
SNX11-201ENST00000359238 VPS53Q5VIR6 699 aa22.06■■□□□ 1.12
SNX11-201ENST00000359238 RNF214Q8ND24 703 aa22.06■■□□□ 1.12
SNX11-201ENST00000359238 FBXO41Q8TF61 875 aa22.06■■□□□ 1.12
SNX11-201ENST00000359238 PDE8BO95263 885 aa22.06■■□□□ 1.12
SNX11-201ENST00000359238 ZAP70P43403 619 aa22.06■■□□□ 1.12
SNX11-201ENST00000359238 CCDC152Q4G0S7 254 aa22.06■■□□□ 1.12
SNX11-201ENST00000359238 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
SNX11-201ENST00000359238 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
SNX11-201ENST00000359238 MCAMP43121 646 aa22.05■■□□□ 1.12
SNX11-201ENST00000359238 CREB3L3Q68CJ9 461 aa22.05■■□□□ 1.12
SNX11-201ENST00000359238 SLC51AQ86UW1 340 aa22.05■■□□□ 1.12
SNX11-201ENST00000359238 TTC14Q96N46 770 aa22.05■■□□□ 1.12
SNX11-201ENST00000359238 HIP1O00291 1037 aa22.05■■□□□ 1.12
SNX11-201ENST00000359238 TTC39AQ5SRH9 613 aa22.05■■□□□ 1.12
SNX11-201ENST00000359238 SLC27A2O14975 620 aa22.04■■□□□ 1.12
SNX11-201ENST00000359238 CASTP20810 708 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
SNX11-201ENST00000359238 GORABQ5T7V8 394 aa22.04■■□□□ 1.12
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