RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000351328.7

CS-201, Transcript of citrate synthase, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 2,975 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-201ENST00000351328 C2CD5Q86YS7 1000 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-201ENST00000351328 MASTLQ96GX5 879 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-201ENST00000351328 FAM210AQ96ND0 272 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-201ENST00000351328 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
CS-201ENST00000351328 RTL9Q8NET4 1388 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-201ENST00000351328 MYH3P11055 1940 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-201ENST00000351328 CCDC172P0C7W6 258 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-201ENST00000351328 NPR1P16066 1061 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-201ENST00000351328 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
CS-201ENST00000351328 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
CS-201ENST00000351328 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
CS-201ENST00000351328 CRAMP1Q96RY5 1269 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-201ENST00000351328 GREM2Q9H772 168 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-201ENST00000351328 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
CS-201ENST00000351328 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
CS-201ENST00000351328 CCDC57Q2TAC2 916 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-201ENST00000351328 STYK1Q6J9G0 422 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-201ENST00000351328 CEP85Q6P2H3 762 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-201ENST00000351328 NCAPGQ9BPX3 1015 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-201ENST00000351328 CHMP3Q9Y3E7 222 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-201ENST00000351328 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
CS-201ENST00000351328 ITGA6P23229 1130 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-201ENST00000351328 ALDH1B1P30837 517 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-201ENST00000351328 FAM161AQ3B820 660 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-201ENST00000351328 ANKRD23Q86SG2 305 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-201ENST00000351328 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
CS-201ENST00000351328 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
CS-201ENST00000351328 KIF3AQ9Y496 699 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-201ENST00000351328 MRVI1Q9Y6F6 885 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-201ENST00000351328 A0A0G2JLW4 131 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-201ENST00000351328 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-201ENST00000351328 SRGAP3O43295 1099 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-201ENST00000351328 DPEP1P16444 411 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-201ENST00000351328 KCNA3P22001 575 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-201ENST00000351328 CHRNA5P30532 468 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-201ENST00000351328 SSH3Q8TE77 659 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-201ENST00000351328 CNKSR1Q969H4 720 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-201ENST00000351328 TSPAN18Q96SJ8 248 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-201ENST00000351328 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
CS-201ENST00000351328 SEC31BQ9NQW1 1179 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-201ENST00000351328 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-201ENST00000351328 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-201ENST00000351328 TULP2O00295 520 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-201ENST00000351328 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
CS-201ENST00000351328 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
CS-201ENST00000351328 GRAPQ13588 217 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-201ENST00000351328 POLA2Q14181 598 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-201ENST00000351328 MNS1Q8NEH6 495 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-201ENST00000351328 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
CS-201ENST00000351328 BRMS1Q9HCU9 246 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-201ENST00000351328 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
CS-201ENST00000351328 LRP5O75197 1615 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-201ENST00000351328 HMMRO75330 724 aa8.4□□□□□ -1.06
CS-201ENST00000351328 BBOX1O75936 387 aa8.4□□□□□ -1.06
CS-201ENST00000351328 RPS8P62241 208 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
CS-201ENST00000351328 SIRT2Q8IXJ6 389 aa8.4□□□□□ -1.06
CS-201ENST00000351328 ITFG2Q969R8 447 aa8.4□□□□□ -1.06
CS-201ENST00000351328 SYT17Q9BSW7 474 aa8.4□□□□□ -1.06
CS-201ENST00000351328 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa8.4□□□□□ -1.06
CS-201ENST00000351328 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
CS-201ENST00000351328 PIM2Q9P1W9 311 aa8.4□□□□□ -1.06
CS-201ENST00000351328 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.07
CS-201ENST00000351328 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.07
CS-201ENST00000351328 TTLL6Q8N841 843 aa8.4□□□□□ -1.07
CS-201ENST00000351328 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.07
CS-201ENST00000351328 TIGD1Q96MW7 591 aa8.4□□□□□ -1.07
CS-201ENST00000351328 COPRSQ9NQ92 184 aa8.4□□□□□ -1.07
CS-201ENST00000351328 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
CS-201ENST00000351328 TMC4Q7Z404 712 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-201ENST00000351328 NLGN2Q8NFZ4 835 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-201ENST00000351328 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
CS-201ENST00000351328 FAM13BQ9NYF5 915 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-201ENST00000351328 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
CS-201ENST00000351328 MYBPC2Q14324 1141 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-201ENST00000351328 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-201ENST00000351328 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
CS-201ENST00000351328 MPHOSPH8Q99549 860 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-201ENST00000351328 NBPF3Q9H094 633 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-201ENST00000351328 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-201ENST00000351328 FSD2A1L4K1 749 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-201ENST00000351328 RNF217Q8TC41 542 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-201ENST00000351328 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-201ENST00000351328 DLEC1Q9Y238 1755 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-201ENST00000351328 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
CS-201ENST00000351328 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
CS-201ENST00000351328 KLHDC4Q8TBB5 520 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-201ENST00000351328 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
CS-201ENST00000351328 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
CS-201ENST00000351328 NUB1Q9Y5A7 615 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-201ENST00000351328 EYA2O00167 538 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-201ENST00000351328 KIF3CO14782 793 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-201ENST00000351328 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
CS-201ENST00000351328 KDM4AO75164 1064 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-201ENST00000351328 CIAO1O76071 339 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-201ENST00000351328 CREBRFQ8IUR6 639 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-201ENST00000351328 SP8Q8IXZ3 490 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-201ENST00000351328 C7orf43Q8WVR3 580 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-201ENST00000351328 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-201ENST00000351328 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-201ENST00000351328 TAF1P21675 1872 aa8.37□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.1 ms