RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317221.11

ZNF559-201, Transcript of zinc finger protein 559, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ZNF559, Length 2,732 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559-201ENST00000317221 ATP2B1P20020 1258 aa6.65□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 MAP3K9P80192 1104 aa6.65□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 FLIIQ13045 1269 aa6.65□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa6.65□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa6.65□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa6.65□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 NECTIN2Q92692 538 aa6.65□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 COG3Q96JB2 828 aa6.65□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 SDF4Q9BRK5 362 aa6.65□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa6.65□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 VPS18Q9P253 973 aa6.65□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 RCOR1Q9UKL0 485 aa6.65□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 USP6P35125 1406 aa6.65□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 ADCY9O60503 1353 aa6.65□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 TTC41PQ6P2S7 1318 aa6.65□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 ANKRD65E5RJM6 399 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 PRR29P0C7W0 189 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 RESTQ13127 1097 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 E2F4Q16254 413 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 ENGASEQ8NFI3 743 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 PPM1EQ8WY54 764 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 MAP4K1Q92918 833 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 BRF1Q92994 677 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 TSPYL4Q9UJ04 414 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 MAP2K7O14733 419 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 SRGAP3O43295 1099 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 JAK2O60674 1132 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 ADD1P35611 737 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 FAM160A1Q05DH4 1040 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 MCM6Q14566 821 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 RABGGTAQ92696 567 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP6.64□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 PDE11AQ9HCR9 933 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 SLC27A2O14975 620 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 ZSCAN12O43309 604 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 APOBRQ0VD83 1088 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 MPHOSPH8Q99549 860 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 CCDC151A5D8V7 595 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 RPS6KA5O75582 802 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 RPS6KB1P23443 525 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 TXLNAP40222 546 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 ME1P48163 572 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 CORO7P57737 925 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 GNG11P61952 73 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 PPP2R3AQ06190 1150 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 TSGA10IPQ3SY00 556 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 KRT28Q7Z3Y7 464 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 FSIP1Q8NA03 581 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 WDR24Q96S15 920 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 POLA2Q14181 598 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 DPCR1Q3MIW9 517 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 CCDC30Q5VVM6 783 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 FAM227BQ96M60 508 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 KIAA1468Q9P260 1216 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 TAF6LQ9Y6J9 622 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 C1orf167Q5SNV9 1468 aa6.62□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 MAP3K19Q56UN5 1328 aa6.62□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 FMN2Q9NZ56 1722 aa6.62□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 A0A1B0GVL5 298 aa6.62□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 VWA3AA6NCI4 1184 aa6.62□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 FANCCQ00597 558 aa6.62□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 BRD3Q15059 726 aa6.62□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 SKIDA1Q1XH10 827 aa6.62□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 NBPF6Q5VWK0 638 aa6.62□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 HDXQ7Z353 690 aa6.62□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 USHBP1Q8N6Y0 703 aa6.62□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 NBPF4Q96M43 638 aa6.62□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa6.62□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa6.62□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 MRFAP1Q9Y605 127 aa6.62□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 BIN1O00499 593 aa6.62□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 CCDC172P0C7W6 258 aa6.62□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 PIP4K2BP78356 416 aa6.62□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 LRRC31Q6UY01 552 aa6.62□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 BRINP3Q76B58 766 aa6.62□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 CCDC91Q7Z6B0 441 aa6.62□□□□□ -1.35
ZNF559-201ENST00000317221 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.4 ms