RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564841.1

LINC00554-201, long intergenic non-protein coding RNA 554, humanhuman

BASIC

Gene LINC00554, Length 3,011 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00554-201ENST00000564841 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa14.49□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 CDRT4Q8N9R6 151 aa14.49□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 SPACA5Q96QH8 159 aa14.49□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 OR5B2Q96R09 309 aa14.49□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 G6PC3Q9BUM1 346 aa14.49□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 FBXL17Q9UF56 701 aa14.49□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 FREM3P0C091 2139 aa14.49□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa14.49□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 QDPRP09417 244 aa14.49□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 HKR1P10072 659 aa14.49□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 FABP4P15090 132 aa14.49□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 PMELP40967 661 aa14.49□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 ALG10Q5BKT4 473 aa14.49□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 ZNF529Q6P280 563 aa14.49□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 OR9A4Q8NGU2 314 aa14.49□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 OR4C3Q8NH37 302 aa14.49□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 SPACA7Q96KW9 195 aa14.49□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 AQP10Q96PS8 301 aa14.49□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 OR2A5Q96R48 311 aa14.49□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 RARRES2Q99969 163 aa14.49□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 DUSP22Q9NRW4 184 aa14.49□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 PARPBPQ9NWS1 579 aa14.49□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 LRIT1Q9P2V4 623 aa14.49□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 TNFP01375 233 aa14.48□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 SNCAP37840 140 aa14.48□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 C4orf17Q53FE4 359 aa14.48□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 ZNF679Q8IYX0 411 aa14.48□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 AVL9Q8NBF6 648 aa14.48□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 RSC1A1Q92681 617 aa14.48□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 GAL3ST3Q96A11 431 aa14.48□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 NTNG2Q96CW9 530 aa14.48□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 GNRHR2Q96P88 292 aa14.48□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 NICN1Q9BSH3 213 aa14.48□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 SLC5A6Q9Y289 635 aa14.48□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa14.48□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 TCAPO15273 167 aa14.48□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 SPARCP09486 303 aa14.48□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 CX3CR1P49238 355 aa14.48□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 C14orf28Q4W4Y0 310 aa14.48□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 ZDHHC22Q8N966 263 aa14.48□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 AQP3Q92482 292 aa14.48□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 ERGIC1Q969X5 290 aa14.48□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 SLC25A36Q96CQ1 311 aa14.48□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 TCTN2Q96GX1 697 aa14.48□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 TUBA4BQ9H853 241 aa14.48□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 PARP11Q9NR21 331 aa14.48□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa14.48□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa14.48□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa14.48□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 A0A087WUJ7 227 aa14.47□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 C11orf98E9PRG8 122 aa14.47□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 RAP1AP62834 184 aa14.47□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa14.47□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 Q7L0L9 218 aa14.47□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 TSPAN32Q96QS1 320 aa14.47□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 STARD10Q9Y365 291 aa14.47□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 APBB3O95704 486 aa14.47□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 GLRA1P23415 457 aa14.47□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 PSG6Q00889 435 aa14.47□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 TMEM268Q5VZI3 342 aa14.47□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 FBRSQ9HAH7 460 aa14.47□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 CRLF2Q9HC73 371 aa14.47□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa14.47□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 GRHPRQ9UBQ7 328 aa14.47□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 HIST1H2BKO60814 126 aa14.47□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 MPZL1O95297 269 aa14.47□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 F10P00742 488 aa14.47□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 HIST1H2BJP06899 126 aa14.47□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 NR2C1P13056 603 aa14.47□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 HIST1H2BOP23527 126 aa14.47□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 HIST1H2BBP33778 126 aa14.47□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 TMEM33P57088 247 aa14.47□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 HIST1H2BDP58876 126 aa14.47□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 HIST1H2BCP62807 126 aa14.47□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 UNC119Q13432 240 aa14.47□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 HIST2H2BEQ16778 126 aa14.47□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 TEX30Q5JUR7 227 aa14.47□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa14.47□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 OR9K2Q8NGE7 335 aa14.47□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 OR4K15Q8NH41 348 aa14.47□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 HIST1H2BHQ93079 126 aa14.47□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 HIST1H2BNQ99877 126 aa14.47□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 HIST1H2BMQ99879 126 aa14.47□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 CNTD2Q9H8S5 307 aa14.47□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 SLC17A5Q9NRA2 495 aa14.47□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 DNAJB11Q9UBS4 358 aa14.47□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 FBXL21Q9UKT6 434 aa14.47□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa14.46□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 FCGR2CP31995 323 aa14.46□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 SLC17A1Q14916 467 aa14.46□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 TMEM68Q96MH6 324 aa14.46□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 LPAR4Q99677 370 aa14.46□□□□□ -0.09
LINC00554-201ENST00000564841 SH3BGRL3Q9H299 93 aa14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.8 ms