RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	MMP9	P14780	707 aa		8.93	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	TGFBR2	P37173	567 aa		8.93	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	RAD23A	P54725	363 aa		8.93	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	LCN6	P62502	163 aa		8.93	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	AQP6	Q13520	282 aa		8.93	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	8.93	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	FBXW12	Q6X9E4	464 aa		8.93	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF841	Q6ZN19	808 aa		8.93	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	FOXL2NB	Q6ZUU3	175 aa		8.93	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	MAVS	Q7Z434	540 aa		8.93	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	PCYOX1L	Q8NBM8	494 aa		8.93	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	OR1F12	Q8NHA8	337 aa		8.93	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	C10orf82	Q8WW14	230 aa		8.93	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	CPPED1	Q9BRF8	314 aa	Predicted RBP	8.93	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	PCDHAC1	Q9H158	963 aa		8.93	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	WDR76	Q9H967	626 aa		8.93	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	SMURF1	Q9HCE7	757 aa		8.93	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	RIMS3	Q9UJD0	308 aa		8.93	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	VPREB3	Q9UKI3	123 aa		8.93	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	RYR3	Q15413	4870 aa		8.92	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	XKRY	O14609	159 aa		8.92	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	MLNR	O43193	412 aa		8.92	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	SHOX2	O60902	331 aa	Predicted RBP	8.92	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM20B	O75063	409 aa		8.92	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	TSPAN9	O75954	239 aa		8.92	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	OR5F1	O95221	314 aa		8.92	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	IFI30	P13284	250 aa		8.92	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	EEF1B2	P24534	225 aa	Known RBP	8.92	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	IFNA8	P32881	189 aa		8.92	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	RPL4	P36578	427 aa	Known RBP	8.92	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	PSMB10	P40306	273 aa		8.92	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	PMEL	P40967	661 aa		8.92	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	MTPN	P58546	118 aa		8.92	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	AGK	Q53H12	422 aa		8.92	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	PRAMEF6	Q5VXH4	476 aa		8.92	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	DHDDS	Q86SQ9	333 aa		8.92	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	FUNDC1	Q8IVP5	155 aa		8.92	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	MICU2	Q8IYU8	434 aa		8.92	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	OR51A7	Q8NH64	312 aa		8.92	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	AEN	Q8WTP8	325 aa	Known RBP	8.92	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	ERGIC1	Q969X5	290 aa		8.92	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	APOBEC3D	Q96AK3	386 aa	Predicted RBP	8.92	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	TAMM41	Q96BW9	452 aa		8.92	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF583	Q96ND8	569 aa		8.92	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	PPA2	Q9H2U2	334 aa		8.92	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	TOR3A	Q9H497	397 aa		8.92	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	FN3KRP	Q9HA64	309 aa		8.92	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	TRIM36	Q9NQ86	728 aa		8.92	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	NECAP2	Q9NVZ3	263 aa		8.92	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	NKIRAS1	Q9NYS0	192 aa		8.92	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	ONECUT1	Q9UBC0	465 aa		8.92	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	RNF7	Q9UBF6	113 aa		8.92	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		8.92	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	GMEB1	Q9Y692	573 aa		8.92	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	TRBV5-3	A0A0A0MS03	114 aa		8.91	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM120B	A0PK00	339 aa		8.91	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	OR6C6	A6NF89	314 aa		8.91	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	IQCF6	A8MYZ5	107 aa		8.91	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	LGALS8	O00214	317 aa		8.91	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	XPNPEP2	O43895	674 aa		8.91	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	IGF2	P01344	180 aa		8.91	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	TNFRSF1B	P20333	461 aa		8.91	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	PIN1	Q13526	163 aa	Predicted RBP	8.91	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	BEND6	Q5SZJ8	279 aa	Predicted RBP	8.91	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	OTP	Q5XKR4	325 aa		8.91	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC35E4	Q6ICL7	350 aa		8.91	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	BTN2A1	Q7KYR7	527 aa		8.91	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	VMO1	Q7Z5L0	202 aa		8.91	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	ZSCAN2	Q7Z7L9	614 aa	Predicted RBP	8.91	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	SPERT	Q8NA61	448 aa		8.91	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	OR4S1	Q8NGB4	309 aa		8.91	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	SPRYD4	Q8WW59	207 aa	Predicted RBP	8.91	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	LIPH	Q8WWY8	451 aa		8.91	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	ST8SIA4	Q92187	359 aa		8.91	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	BPIFA2	Q96DR5	249 aa		8.91	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	ECSIT	Q9BQ95	431 aa		8.91	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	SIRPD	Q9H106	197 aa		8.91	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	SEMA6A	Q9H2E6	1030 aa		8.91	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	CTSZ	Q9UBR2	303 aa		8.91	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	DNAJB11	Q9UBS4	358 aa		8.91	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	BAG5	Q9UL15	447 aa		8.91	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	TRAV27	A0A087WT01	109 aa		8.9	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	TRAV38-1	A0A0B4J264	116 aa		8.9	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A1B0GVI7	797 aa		8.9	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A1W2PRD5	423 aa		8.9	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A1W2PRF3	423 aa		8.9	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A1W2PRM7	423 aa		8.9	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	ANGPT2	O15123	496 aa		8.9	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	NDUFA2	O43678	99 aa		8.9	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	OR10H3	O60404	316 aa		8.9	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	ECD	O95905	644 aa	Predicted RBP	8.9	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	GYPA	P02724	150 aa		8.9	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	CENPA	P49450	140 aa		8.9	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	COX10	Q12887	443 aa		8.9	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	MALL	Q13021	153 aa		8.9	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	OR8G1	Q15617	311 aa		8.9	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	CDON	Q4KMG0	1287 aa		8.9	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	EPGN	Q6UW88	154 aa		8.9	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	OAF	Q86UD1	273 aa		8.9	□□□□□ -0.98
SKAP2-209	ENST00000497511	CMTM4	Q8IZR5	234 aa		8.9	□□□□□ -0.98

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