RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 ATG16L2Q8NAA4 619 aa5.44□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 NPEPL1Q8NDH3 523 aa5.44□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 OR13C2Q8NGS9 318 aa5.44□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 PTP4A1Q93096 173 aa5.44□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 BPIFA2Q96DR5 249 aa5.44□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 CLPTM1LQ96KA5 538 aa5.44□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 Q96M85 177 aa5.44□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF583Q96ND8 569 aa5.44□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 CHIAQ9BZP6 476 aa5.44□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 VCX3BQ9H321 246 aa5.44□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 MARCH7Q9H992 704 aa5.44□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 PTTG3PQ9NZH4 202 aa5.44□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 RHCGQ9UBD6 479 aa5.44□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 IL20RAQ9UHF4 553 aa5.44□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 POMPQ9Y244 141 aa5.44□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa5.44□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 SNX13Q9Y5W8 968 aa5.44□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 OR6C6A6NF89 314 aa5.43□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 F5H5P2 479 aa5.43□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 CDC42EP2O14613 210 aa5.43□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 FFAR1O14842 300 aa5.43□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 FCN3O75636 299 aa5.43□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 SFTPBP07988 381 aa5.43□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 MELTFP08582 738 aa5.43□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 VHLP40337 213 aa5.43□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 RAG2P55895 527 aa5.43□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 FGF12P61328 243 aa5.43□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 GNB2P62879 340 aa5.43□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 FLOT2Q14254 428 aa5.43□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF404Q494X3 552 aa5.43□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 CYBRD1Q53TN4 286 aa5.43□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 OLFML2AQ68BL7 652 aa5.43□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 ASPHD2Q6ICH7 369 aa5.43□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 SLC27A4Q6P1M0 643 aa5.43□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 ZFP1Q6P2D0 407 aa5.43□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 TBPL2Q6SJ96 375 aa5.43□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 BTNL3Q6UXE8 466 aa5.43□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 FBXW12Q6X9E4 464 aa5.43□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 Q6YL49 198 aa5.43□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 FAM122BQ7Z309 247 aa5.43□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 ARPINQ7Z6K5 226 aa5.43□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 MOGAT3Q86VF5 341 aa5.43□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 NRMQ8IXM6 262 aa5.43□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 OR8G5Q8NG78 346 aa5.43□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 RASSF5Q8WWW0 418 aa5.43□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 LRGUKQ96M69 825 aa5.43□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 PKP2Q99959 881 aa5.43□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 TRIM15Q9C019 465 aa5.43□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 WDR76Q9H967 626 aa5.43□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 CTSZQ9UBR2 303 aa5.43□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 MIOXQ9UGB7 285 aa5.43□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 NOTCH1P46531 2555 aa5.42□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 A0A087WUU8 490 aa5.42□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 A0A1B0GWJ7 208 aa5.42□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 A6NIZ1 184 aa5.42□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 RER1O15258 196 aa5.42□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 SURF4O15260 269 aa5.42□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 GMNNO75496 209 aa5.42□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 KRT36O76013 467 aa5.42□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 NDUFA7O95182 113 aa5.42□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 HLA-DPB1P04440 258 aa5.42□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 NR2C1P13056 603 aa5.42□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 MMP9P14780 707 aa5.42□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 TUBG1P23258 451 aa5.42□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 ANOS1P23352 680 aa5.42□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 KDELR2P33947 212 aa5.42□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 GPR4P46093 362 aa5.42□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 PITPNBP48739 271 aa5.42□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 RAP1BP61224 184 aa5.42□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 RAP1AP62834 184 aa5.42□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 PRKCDQ05655 676 aa5.42□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 SCRN3Q0VDG4 424 aa5.42□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 ST3GAL3Q11203 375 aa5.42□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 MAB21L1Q13394 359 aa5.42□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF181Q2M3W8 571 aa5.42□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa5.42□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 FAM205BPQ63HN1 556 aa5.42□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 CRIP3Q6Q6R5 217 aa5.42□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 ARL9Q6T311 187 aa5.42□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 BHLHE23Q8NDY6 225 aa5.42□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 OR1F12Q8NHA8 337 aa5.42□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 FNDC8Q8TC99 324 aa5.42□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 RASD2Q96D21 266 aa5.42□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 ASB9Q96DX5 294 aa5.42□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 PRRC1Q96M27 445 aa5.42□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 C8orf49Q96NF6 230 aa5.42□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 TBX15Q96SF7 602 aa5.42□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.6 ms