RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370002.7

PITX3-201, Transcript of paired like homeodomain 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX3, Length 1,391 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3-201ENST00000370002 BTG1P62324 171 aa17.13■□□□□ 0.33
PITX3-201ENST00000370002 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP17.13■□□□□ 0.33
PITX3-201ENST00000370002 SPRNQ5BIV9 151 aa17.13■□□□□ 0.33
PITX3-201ENST00000370002 DRAM2Q6UX65 266 aa17.13■□□□□ 0.33
PITX3-201ENST00000370002 USP43Q70EL4 1123 aa17.13■□□□□ 0.33
PITX3-201ENST00000370002 CBR4Q8N4T8 237 aa17.13■□□□□ 0.33
PITX3-201ENST00000370002 CYB561A3Q8NBI2 242 aa17.13■□□□□ 0.33
PITX3-201ENST00000370002 ZNF799Q96GE5 643 aa17.13■□□□□ 0.33
PITX3-201ENST00000370002 SIGLEC11Q96RL6 698 aa17.13■□□□□ 0.33
PITX3-201ENST00000370002 FN3KQ9H479 309 aa17.13■□□□□ 0.33
PITX3-201ENST00000370002 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP17.13■□□□□ 0.33
PITX3-201ENST00000370002 PCDHB10Q9UN67 800 aa17.13■□□□□ 0.33
PITX3-201ENST00000370002 U3KQV3 271 aa17.13■□□□□ 0.33
PITX3-201ENST00000370002 LRRC30A6NM36 301 aa17.12■□□□□ 0.33
PITX3-201ENST00000370002 TMEM178BH3BS89 294 aa17.12■□□□□ 0.33
PITX3-201ENST00000370002 LCATP04180 440 aa17.12■□□□□ 0.33
PITX3-201ENST00000370002 SBK2P0C263 348 aa17.12■□□□□ 0.33
PITX3-201ENST00000370002 DCAF12L2Q5VW00 463 aa17.12■□□□□ 0.33
PITX3-201ENST00000370002 PGAP1Q75T13 922 aa17.12■□□□□ 0.33
PITX3-201ENST00000370002 GALNT4Q8N4A0 578 aa17.12■□□□□ 0.33
PITX3-201ENST00000370002 OR10G2Q8NGC3 310 aa17.12■□□□□ 0.33
PITX3-201ENST00000370002 GIPC3Q8TF64 312 aa17.12■□□□□ 0.33
PITX3-201ENST00000370002 MEGF10Q96KG7 1140 aa17.12■□□□□ 0.33
PITX3-201ENST00000370002 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa17.12■□□□□ 0.33
PITX3-201ENST00000370002 OPA3Q9H6K4 179 aa17.12■□□□□ 0.33
PITX3-201ENST00000370002 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP17.12■□□□□ 0.33
PITX3-201ENST00000370002 CMC2Q9NRP2 79 aa17.12■□□□□ 0.33
PITX3-201ENST00000370002 LRRC42Q9Y546 428 aa17.12■□□□□ 0.33
PITX3-201ENST00000370002 RIIAD1A6NNX1 92 aa17.11■□□□□ 0.33
PITX3-201ENST00000370002 ZNF3P17036 446 aa17.11■□□□□ 0.33
PITX3-201ENST00000370002 ENTPD1P49961 510 aa17.11■□□□□ 0.33
PITX3-201ENST00000370002 CRMP1Q14194 572 aa17.11■□□□□ 0.33
PITX3-201ENST00000370002 C1QL2Q7Z5L3 287 aa17.11■□□□□ 0.33
PITX3-201ENST00000370002 C1orf87Q8N0U7 546 aa17.11■□□□□ 0.33
PITX3-201ENST00000370002 OR5AS1Q8N127 324 aa17.11■□□□□ 0.33
PITX3-201ENST00000370002 PLPP7Q8NBV4 271 aa17.11■□□□□ 0.33
PITX3-201ENST00000370002 NANPQ8TBE9 248 aa17.11■□□□□ 0.33
PITX3-201ENST00000370002 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
PITX3-201ENST00000370002 C19orf24Q9BVV8 132 aa17.11■□□□□ 0.33
PITX3-201ENST00000370002 VNN3Q9NY84 501 aa17.11■□□□□ 0.33
PITX3-201ENST00000370002 UBAP1Q9NZ09 502 aa17.11■□□□□ 0.33
PITX3-201ENST00000370002 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa17.11■□□□□ 0.33
PITX3-201ENST00000370002 A8MXK9 166 aa17.1■□□□□ 0.33
PITX3-201ENST00000370002 SPI1P17947 270 aa17.1■□□□□ 0.33
PITX3-201ENST00000370002 PYCR1P32322 319 aa17.1■□□□□ 0.33
PITX3-201ENST00000370002 SLC15A1P46059 708 aa17.1■□□□□ 0.33
PITX3-201ENST00000370002 MMP16P51512 607 aa17.1■□□□□ 0.33
PITX3-201ENST00000370002 AQP4P55087 323 aa17.1■□□□□ 0.33
PITX3-201ENST00000370002 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP17.1■□□□□ 0.33
PITX3-201ENST00000370002 OR10S1Q8NGN2 331 aa17.1■□□□□ 0.33
PITX3-201ENST00000370002 TEX47Q8TBZ9 253 aa17.1■□□□□ 0.33
PITX3-201ENST00000370002 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP17.1■□□□□ 0.33
PITX3-201ENST00000370002 FEVQ99581 238 aa17.1■□□□□ 0.33
PITX3-201ENST00000370002 SLC29A1Q99808 456 aa17.1■□□□□ 0.33
PITX3-201ENST00000370002 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP17.1■□□□□ 0.33
PITX3-201ENST00000370002 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa17.1■□□□□ 0.33
PITX3-201ENST00000370002 Q9H521 79 aa17.1■□□□□ 0.33
PITX3-201ENST00000370002 SP140LQ9H930 580 aa17.1■□□□□ 0.33
PITX3-201ENST00000370002 F5H0A9 414 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
PITX3-201ENST00000370002 EI24O14681 340 aa17.09■□□□□ 0.33
PITX3-201ENST00000370002 MLNRO43193 412 aa17.09■□□□□ 0.33
PITX3-201ENST00000370002 APOC1P02654 83 aa17.09■□□□□ 0.33
PITX3-201ENST00000370002 GRK5P34947 590 aa17.09■□□□□ 0.33
PITX3-201ENST00000370002 SLC6A9P48067 706 aa17.09■□□□□ 0.33
PITX3-201ENST00000370002 ALDH3A2P51648 485 aa17.09■□□□□ 0.33
PITX3-201ENST00000370002 ZMYND11Q15326 602 aa17.09■□□□□ 0.33
PITX3-201ENST00000370002 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
PITX3-201ENST00000370002 DCXRQ7Z4W1 244 aa17.09■□□□□ 0.33
PITX3-201ENST00000370002 KLBQ86Z14 1044 aa17.09■□□□□ 0.33
PITX3-201ENST00000370002 OR10AD1Q8NGE0 317 aa17.09■□□□□ 0.33
PITX3-201ENST00000370002 OR4Q3Q8NH05 313 aa17.09■□□□□ 0.33
PITX3-201ENST00000370002 Q8TCH9 128 aa17.09■□□□□ 0.33
PITX3-201ENST00000370002 RDH12Q96NR8 316 aa17.09■□□□□ 0.33
PITX3-201ENST00000370002 KCNJ15Q99712 375 aa17.09■□□□□ 0.33
PITX3-201ENST00000370002 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa17.09■□□□□ 0.33
PITX3-201ENST00000370002 TOR3AQ9H497 397 aa17.09■□□□□ 0.33
PITX3-201ENST00000370002 WDR76Q9H967 626 aa17.09■□□□□ 0.33
PITX3-201ENST00000370002 USE1Q9NZ43 259 aa17.09■□□□□ 0.33
PITX3-201ENST00000370002 ORC6Q9Y5N6 252 aa17.09■□□□□ 0.33
PITX3-201ENST00000370002 ZNF878C9JN71 531 aa17.08■□□□□ 0.32
PITX3-201ENST00000370002 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
PITX3-201ENST00000370002 GMDSO60547 372 aa17.08■□□□□ 0.32
PITX3-201ENST00000370002 SOX14O95416 240 aa17.08■□□□□ 0.32
PITX3-201ENST00000370002 CD200P41217 278 aa17.08■□□□□ 0.32
PITX3-201ENST00000370002 GRB2P62993 217 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
PITX3-201ENST00000370002 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
PITX3-201ENST00000370002 NAA40Q86UY6 237 aa17.08■□□□□ 0.32
PITX3-201ENST00000370002 SPERTQ8NA61 448 aa17.08■□□□□ 0.32
PITX3-201ENST00000370002 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa17.08■□□□□ 0.32
PITX3-201ENST00000370002 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
PITX3-201ENST00000370002 ZNRF4Q8WWF5 429 aa17.08■□□□□ 0.32
PITX3-201ENST00000370002 JMJD8Q96S16 334 aa17.08■□□□□ 0.32
PITX3-201ENST00000370002 OCEL1Q9H607 264 aa17.08■□□□□ 0.32
PITX3-201ENST00000370002 C7orf69Q9H7B7 122 aa17.08■□□□□ 0.32
PITX3-201ENST00000370002 MARCH7Q9H992 704 aa17.08■□□□□ 0.32
PITX3-201ENST00000370002 DCAF16Q9NXF7 216 aa17.08■□□□□ 0.32
PITX3-201ENST00000370002 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
PITX3-201ENST00000370002 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
PITX3-201ENST00000370002 LRCH1Q9Y2L9 728 aa17.08■□□□□ 0.32
PITX3-201ENST00000370002 TVP23AA6NH52 213 aa17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.7 ms