RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439418.1

C9orf135-AS1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene C9orf135-AS1, Length 1,375 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 Q6ZSN1 163 aa4.88□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 P4HA3Q7Z4N8 544 aa4.88□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DHDDSQ86SQ9 333 aa4.88□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LHFPL3Q86UP9 236 aa4.88□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SLC22A15Q8IZD6 547 aa4.88□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SLC38A6Q8IZM9 456 aa4.88□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LINC00518Q8N0U6 118 aa4.88□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PARP16Q8N5Y8 322 aa4.88□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SDR9C7Q8NEX9 313 aa4.88□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 OR1J2Q8NGS2 313 aa4.88□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 OR6X1Q8NH79 312 aa4.88□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NEIL3Q8TAT5 605 aa4.88□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IFT81Q8WYA0 676 aa4.88□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ATG4AQ8WYN0 398 aa4.88□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HGDQ93099 445 aa4.88□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PELI1Q96FA3 418 aa4.88□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 OLFM3Q96PB7 478 aa4.88□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF670Q9BS34 389 aa4.88□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MED18Q9BUE0 208 aa4.88□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SLA2Q9H6Q3 261 aa4.88□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 OR14J1Q9UGF5 321 aa4.88□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NDRG3Q9UGV2 375 aa4.88□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KCNE5Q9UJ90 142 aa4.88□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP4.88□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF337Q9Y3M9 751 aa4.88□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CHST2Q9Y4C5 530 aa4.88□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 F5H697 171 aa4.87□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SPRY2O43597 315 aa4.87□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 OR1I1O60431 355 aa4.87□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LDB3O75112 727 aa4.87□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 VENTXO95231 258 aa4.87□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FGGP02679 453 aa4.87□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NR2C1P13056 603 aa4.87□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CREB1P16220 341 aa4.87□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PMCHP20382 165 aa4.87□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HOXA5P20719 270 aa4.87□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ME2P23368 584 aa4.87□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GLRA1P23415 457 aa4.87□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CMPK1P30085 196 aa4.87□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CCR7P32248 378 aa4.87□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 OMPP47874 163 aa4.87□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 COMPP49747 757 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RIDAP52758 137 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CLDN15P56746 228 aa4.87□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RPS7P62081 194 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KCNJ2P63252 427 aa4.87□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SMCO1Q147U7 214 aa4.87□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TNXAQ16473 311 aa4.87□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TMEM35AQ53FP2 167 aa4.87□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MTX3Q5HYI7 312 aa4.87□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 REEP3Q6NUK4 255 aa4.87□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 UQCC3Q6UW78 93 aa4.87□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa4.87□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FCRLAQ7L513 359 aa4.87□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LINGO2Q7L985 606 aa4.87□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HDDC2Q7Z4H3 204 aa4.87□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HS3ST5Q8IZT8 346 aa4.87□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa4.87□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GJC3Q8NFK1 279 aa4.87□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa4.87□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 OR10J5Q8NHC4 309 aa4.87□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LGALS14Q8TCE9 139 aa4.87□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CDS1Q92903 461 aa4.87□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HIST1H2ACQ93077 130 aa4.87□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MYDGFQ969H8 173 aa4.87□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PHF21AQ96BD5 680 aa4.87□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PYCR2Q96C36 320 aa4.87□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RNF183Q96D59 192 aa4.87□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LGALS12Q96DT0 336 aa4.87□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa4.87□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TIMP4Q99727 224 aa4.87□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NDUFAF3Q9BU61 184 aa4.87□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF426Q9BUY5 554 aa4.87□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ANKHQ9HCJ1 492 aa4.87□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ABHD10Q9NUJ1 306 aa4.87□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ASB6Q9NWX5 421 aa4.87□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SYBUQ9NX95 663 aa4.87□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF226Q9NYT6 803 aa4.87□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C1RLQ9NZP8 487 aa4.87□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KIF25Q9UIL4 384 aa4.87□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TMCO1Q9UM00 188 aa4.87□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SLC6A5Q9Y345 797 aa4.87□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MMACHCQ9Y4U1 282 aa4.87□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PLCE1Q9P212 2302 aa4.86□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms