RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312492.2

HOXC5-201, Transcript of homeobox C5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXC5, Length 1,805 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5-201ENST00000312492 SCRN3Q0VDG4 424 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 COMMD2Q86X83 199 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 OR8B12Q8NGG6 310 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 A0A0G2JMP0 313 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 A0A0X1KG70 313 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 IGHV3-9P01782 118 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 APOC1P02654 83 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 PITPNBP48739 271 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 CLDN12P56749 244 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 RAB35Q15286 201 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 TRIQKQ629K1 86 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 ASPHD2Q6ICH7 369 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 FAM57BQ71RH2 274 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 SLC22A24Q8N4F4 322 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 OR4M2Q8NGB6 313 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 OR51E1Q8TCB6 317 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 SPTSSAQ969W0 71 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 APH1AQ96BI3 265 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 HDHD2Q9H0R4 259 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 STEAP1Q9UHE8 339 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 ETV7Q9Y603 341 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 DNAJC13O75165 2243 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 SLC22A20A6NK97 555 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 ZNF587BE7ETH6 402 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 F5H5K5 113 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 SGCEO43556 437 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 FARS2O95363 451 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 FCGR2AP12318 317 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 SDHBP21912 280 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 SLC6A9P48067 706 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 STK11Q15831 433 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 NRN1LQ496H8 165 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 GLT8D1Q68CQ7 371 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 PYHIN1Q6K0P9 492 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 ZNF813Q6ZN06 617 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 PGAM5Q96HS1 289 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 SCNM1Q9BWG6 230 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 SLC7A10Q9NS82 523 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 TBC1D24Q9ULP9 559 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 ZNF175Q9Y473 711 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 A0A1B0GVC2 190 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 A6NIN4 97 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 LMX1BO60663 402 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 CFPP27918 469 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 SCAND1P57086 179 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 PCBD1P61457 104 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 TAB1Q15750 504 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 IGFL3Q6UXB1 125 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 SLC16A14Q7RTX9 510 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 DTX3Q8N9I9 347 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 C19orf18Q8NEA5 215 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 FGGYQ96C11 551 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 WACQ9BTA9 647 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 PRDM14Q9GZV8 571 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 TBCCD1Q9NVR7 557 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 UPB1Q9UBR1 384 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 OR5V1Q9UGF6 321 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 A0A1B0GTI1 187 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 MEGF11A6BM72 1044 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 M0R135 149 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 ZNF32P17041 273 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 NR4A2P43354 598 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 PITPNAQ00169 270 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 ECH1Q13011 328 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 PRSS45Q7RTY3 260 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 SERPINA12Q8IW75 414 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 ZNF799Q96GE5 643 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 GPR84Q9NQS5 396 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 SLC17A2O00624 439 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 PFDN1O60925 122 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 UBL3O95164 117 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 TGM6O95932 706 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 ZNF20P17024 532 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 GNALP38405 381 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 INPP1P49441 399 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 RAB11BQ15907 218 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 DOK3Q7L591 496 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 P4HA3Q7Z4N8 544 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 ZNF100Q8IYN0 542 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 CMTM4Q8IZR5 234 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 NKAIN3Q8N8D7 197 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 PLPP7Q8NBV4 271 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 OR1J2Q8NGS2 313 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 GP6Q9HCN6 339 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 ZNF319Q9P2F9 582 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 RABL2BQ9UNT1 228 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXC5-201ENST00000312492 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.2 ms