RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495357.1

CCDC39-AS1-201, CCDC39 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CCDC39-AS1, Length 283 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KLHL41O60662 606 aa1.88□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC22A5O76082 557 aa1.88□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP1.88□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PRMT2P55345 433 aa1.88□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PPP1CBP62140 327 aa1.88□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RBX1P62877 108 aa1.88□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ANKDD1AQ495B1 522 aa1.88□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 VPS26BQ4G0F5 336 aa1.88□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF101Q8IZC7 436 aa1.88□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR5M1Q8NGP8 315 aa1.88□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR5B3Q8NH48 314 aa1.88□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CCDC126Q96EE4 140 aa1.88□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IP6K3Q96PC2 410 aa1.88□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RSG1Q9BU20 258 aa1.88□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SAMD10Q9BYL1 202 aa1.88□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP1.88□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP1.88□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 STARD10Q9Y365 291 aa1.88□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KRBOX1C9JBD0 128 aa1.87□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SEMA3DO95025 777 aa1.87□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 H6PDO95479 791 aa1.87□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ERGP11308 486 aa1.87□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FOXN2P32314 431 aa1.87□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMED10P49755 219 aaKnown RBP1.87□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BAMBIQ13145 260 aa1.87□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SASS6Q6UVJ0 657 aa1.87□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CERS6Q6ZMG9 384 aa1.87□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMEM150AQ86TG1 271 aa1.87□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMEM104Q8NE00 496 aa1.87□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SPATA4Q8NEY3 305 aa1.87□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR5B12Q96R08 314 aa1.87□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RACGAP1Q9H0H5 632 aa1.87□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NEUROG2Q9H2A3 272 aa1.87□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C21orf62Q9NYP8 219 aa1.87□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP1.87□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 A0A1B0GW55 424 aa1.86□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 H7C417 338 aa1.86□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RAB29O14966 203 aa1.86□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RDH16O75452 317 aa1.86□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GLSO94925 669 aaPredicted RBP1.86□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DUX4L2P0CJ85 424 aa1.86□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DUX4L3P0CJ86 424 aa1.86□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DUX4L5P0CJ88 424 aa1.86□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DUX4L6P0CJ89 424 aa1.86□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DUX4L7P0CJ90 424 aa1.86□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GGT1P19440 569 aa1.86□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PRLHRP49683 370 aa1.86□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP1.86□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 UBE2UQ5VVX9 321 aa1.86□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GPR107Q5VW38 600 aa1.86□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ADNP2Q6IQ32 1131 aa1.86□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CASP12Q6UXS9 341 aa1.86□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF664Q8N3J9 261 aa1.86□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LRRC29Q8WV35 223 aa1.86□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP1.86□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP1.86□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC29A1Q99808 456 aa1.86□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa1.86□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR51M1Q9H341 326 aa1.86□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP1.86□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DUX4Q9UBX2 424 aa1.86□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MTFP1Q9UDX5 166 aa1.86□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ITGB4P16144 1822 aa1.85□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LHBP01229 141 aa1.85□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IGHV3-11P01762 117 aa1.85□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP1.85□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PRPHP41219 470 aa1.85□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP1.85□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TNFSF9P41273 254 aa1.85□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CCNG1P51959 295 aa1.85□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RPL23P62829 140 aaKnown RBP1.85□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM53BQ14153 422 aa1.85□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF235Q14590 738 aa1.85□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TEX30Q5JUR7 227 aa1.85□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa1.85□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa1.85□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 H3F3CQ6NXT2 135 aa1.85□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CASC1Q6TDU7 716 aa1.85□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMEM136Q6ZRR5 245 aa1.85□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 WDR34Q96EX3 536 aa1.85□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 COL21A1Q96P44 957 aa1.85□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MICU1Q9BPX6 476 aa1.85□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PISDQ9UG56 409 aa1.85□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LGALS13Q9UHV8 139 aa1.85□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 USP47Q96K76 1375 aa1.85□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR5H1A6NKK0 313 aa1.84□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GABRR3A8MPY1 467 aa1.84□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NVLO15381 856 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP1.84□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ACSM4P0C7M7 580 aa1.84□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP1.84□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CHMLP26374 656 aa1.84□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CDH6P55285 790 aa1.84□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TGM3Q08188 693 aa1.84□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SOHLH1Q5JUK2 328 aa1.84□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NPSR1Q6W5P4 371 aa1.84□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP1.84□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RGS9BPQ6ZS82 235 aa1.84□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NKAIN4Q8IVV8 208 aa1.84□□□□□ -2.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CHST4Q8NCG5 386 aa1.84□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.8 ms