RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467464.1

PTPRF-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, human

TSL 3

Gene PTPRF, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRF-211	ENST00000467464	ANOS1	P23352	680 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	CRABP1	P29762	137 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	RRM2	P31350	389 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	SLC3A1	Q07837	685 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	KRT72	Q14CN4	511 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	ZMYND11	Q15326	602 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	C1orf94	Q6P1W5	598 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	PGBD2	Q6P3X8	592 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	LEG1	Q6P5S2	330 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	CFAP77	Q6ZQR2	320 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	OR2Z1	Q8NG97	314 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	OR4M2	Q8NGB6	313 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	PTP4A1	Q93096	173 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	NSMCE2	Q96MF7	247 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	COG8	Q96MW5	612 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	DDO	Q99489	341 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	COQ7	Q99807	217 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	NSRP1	Q9H0G5	558 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	HDHD2	Q9H0R4	259 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	FN3K	Q9H479	309 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	KRCC1	Q9NPI7	259 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	PNRC2	Q9NPJ4	139 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	PTTG3P	Q9NZH4	202 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	IL19	Q9UHD0	177 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	TAGLN3	Q9UI15	199 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	POLR3K	Q9Y2Y1	108 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	LYVE1	Q9Y5Y7	322 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	PPIAL4E	A0A075B759	164 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	PPIAL4C	A0A0B4J2A2	164 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	OR6C68	A6NDL8	312 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	PPIAL4D	F5H284	164 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	MLNR	O43193	412 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	FABP3	P05413	133 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	PPIAL4F	P0DN26	164 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	ADRA2C	P18825	462 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	SLC6A6	P31641	620 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	GGT2	P36268	569 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	MAGEA2	P43356	314 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	RGS6	P49758	472 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	MMP16	P51512	607 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	HMGA2	P52926	109 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	SMIM11A	P58511	58 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	HILS1	P60008	231 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	SEC61A1	P61619	476 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	LCN2	P80188	198 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	TSPAN31	Q12999	210 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	DCAF12L2	Q5VW00	463 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	OR2T2	Q6IF00	324 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	ZNF770	Q6IQ21	691 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	PGM2L1	Q6PCE3	622 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	SHQ1	Q6PI26	577 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	USP43	Q70EL4	1123 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	CPLX4	Q7Z7G2	160 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	ZSCAN2	Q7Z7L9	614 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	LRRC28	Q86X40	367 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	LINC00346	Q8IVM7	164 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	ZDHHC21	Q8IVQ6	265 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	OR5AS1	Q8N127	324 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	DEFB108B	Q8NET1	73 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	SDR9C7	Q8NEX9	313 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	GJC3	Q8NFK1	279 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	OR4C15	Q8NGM1	316 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	OR4K13	Q8NH42	304 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	ZFAND2B	Q8WV99	257 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	ZNRF4	Q8WWF5	429 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	OR2V2	Q96R30	315 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	BTBD10	Q9BSF8	475 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	C1QTNF5	Q9BXJ0	243 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	OCEL1	Q9H607	264 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	SRA1	Q9HD15	236 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	GCM1	Q9NP62	436 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	RPRD1B	Q9NQG5	326 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	MRPL22	Q9NWU5	206 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	CYB5R1	Q9UHQ9	305 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	TCRBV5S2	A0A599	114 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	ISPD	A4D126	451 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464		A8MXK9	166 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	IQCF6	A8MYZ5	107 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464		H0YL77	283 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	TMEM178B	H3BS89	294 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	BHLHE40	O14503	412 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	IDH3B	O43837	385 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	OR10H3	O60404	316 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	GMNN	O75496	209 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	SBK2	P0C263	348 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	ACSM4	P0C7M7	580 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	GATA3	P23771	443 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	PRSS12	P56730	875 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	BTG1	P62324	171 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	GNGT1	P63211	74 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	TMEM155	Q4W5P6	130 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	DNM1P34	Q6PK57	102 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	JAZF1	Q86VZ6	243 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	DEFB107A	Q8IZN7	70 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	OR8G5	Q8NG78	346 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	OR10AD1	Q8NGE0	317 aa		10.06	□□□□□ -0.8

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