RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511481.5

SEC24D-211, Transcript of SEC24 homolog D, COPII coat complex component, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SEC24D, Length 2,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24D-211ENST00000511481 IL20RAQ9UHF4 553 aa4.9□□□□□ -1.62
SEC24D-211ENST00000511481 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.62
SEC24D-211ENST00000511481 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa4.9□□□□□ -1.62
SEC24D-211ENST00000511481 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa4.9□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 METTL21EPA6NDL7 271 aa4.9□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 CASTOR2A6NHX0 329 aa4.9□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 ARGFXA6NJG6 315 aa4.9□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 FAM183AA6NL82 134 aa4.9□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 GFYI3L273 518 aa4.9□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 J3QR06 171 aa4.9□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 OR10H2O60403 315 aa4.9□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 RAD51DO75771 328 aa4.9□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 ACTL6AO96019 429 aa4.9□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 IGHA1P01876 353 aa4.9□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 MMP3P08254 477 aa4.9□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 RPA2P15927 270 aa4.9□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 NQO2P16083 231 aa4.9□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 NSG1P42857 185 aa4.9□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 SLC6A12P48065 614 aa4.9□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 CSNK1DP48730 415 aa4.9□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 NFATC2Q13469 925 aa4.9□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 ENTPD8Q5MY95 495 aa4.9□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 C10orf91Q5T1B1 145 aa4.9□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 CYB5R2Q6BCY4 276 aa4.9□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 CERS6Q6ZMG9 384 aa4.9□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 SLC29A4Q7RTT9 530 aa4.9□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 OLIG3Q7RTU3 272 aa4.9□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 C17orf47Q8NEP4 570 aa4.9□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 KLHDC9Q8NEP7 349 aa4.9□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 OR2AK2Q8NG84 335 aa4.9□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 OR56B2PQ8NGI1 322 aa4.9□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 ZNF671Q8TAW3 534 aa4.9□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 GRAMD2BQ96HH9 432 aa4.9□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 TIMP4Q99727 224 aa4.9□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 GAL3ST1Q99999 423 aa4.9□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 TCEAL7Q9BRU2 100 aa4.9□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 FNDC11Q9BVV2 318 aa4.9□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa4.9□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 OR51I1Q9H343 314 aa4.9□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 UCK1Q9HA47 277 aa4.9□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa4.9□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 TREM1Q9NP99 234 aa4.9□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 MMP25Q9NPA2 562 aa4.9□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 TMEM138Q9NPI0 162 aa4.9□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 DMRT1Q9Y5R6 373 aa4.9□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 A0A087WZY1 265 aa4.89□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa4.89□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa4.89□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 ANTXRLA6NF34 631 aa4.89□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 NAP1L6A6NFF2 107 aa4.89□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 DBX1A6NMT0 343 aa4.89□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa4.89□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 SAP18O00422 153 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 SCGB2A1O75556 95 aa4.89□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 SC5DO75845 299 aa4.89□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 KRT33AO76009 404 aa4.89□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 ATP1B1P05026 303 aa4.89□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 FOLR2P14207 255 aa4.89□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 ABOP16442 354 aa4.89□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 HTR2AP28223 471 aa4.89□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 AKR1C3P42330 323 aa4.89□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 HCCSP53701 268 aa4.89□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 MTCP1P56278 107 aa4.89□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 SMIM11AP58511 58 aa4.89□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 PFN3P60673 137 aa4.89□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 SEMG2Q02383 582 aa4.89□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 TWF1Q12792 350 aa4.89□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 SKP2Q13309 424 aa4.89□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 UBE2V1Q13404 147 aa4.89□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 ACSM3Q53FZ2 586 aa4.89□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 MFSD12Q6NUT3 480 aa4.89□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 C1orf94Q6P1W5 598 aa4.89□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 NUDT13Q86X67 352 aa4.89□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 ZNF573Q86YE8 665 aa4.89□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 TMEM99Q8N816 258 aa4.89□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa4.89□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 MORN4Q8NDC4 146 aa4.89□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 OR6K2Q8NGY2 324 aa4.89□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 LGALS14Q8TCE9 139 aa4.89□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 EDAQ92838 391 aa4.89□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 C14orf144Q96I85 54 aa4.89□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 GGACTQ9BVM4 153 aa4.89□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 TPPP3Q9BW30 176 aa4.89□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa4.89□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 REEP4Q9H6H4 257 aa4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.4 ms