RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249501.4

HOXD10-201, Transcript of homeobox D10, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD10, Length 1,989 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10-201ENST00000249501 TNFSF8P32971 234 aa16.78■□□□□ 0.28
HOXD10-201ENST00000249501 CEACAM16Q2WEN9 425 aa16.78■□□□□ 0.28
HOXD10-201ENST00000249501 TPRA1Q86W33 373 aa16.78■□□□□ 0.28
HOXD10-201ENST00000249501 SNX29P2Q8IUI4 249 aa16.78■□□□□ 0.28
HOXD10-201ENST00000249501 MIXL1Q9H2W2 232 aa16.78■□□□□ 0.28
HOXD10-201ENST00000249501 GPR35Q9HC97 309 aa16.78■□□□□ 0.28
HOXD10-201ENST00000249501 ABCB9Q9NP78 766 aa16.78■□□□□ 0.28
HOXD10-201ENST00000249501 OR52A1Q9UKL2 312 aa16.78■□□□□ 0.28
HOXD10-201ENST00000249501 CMAHPQ9Y471 501 aa16.78■□□□□ 0.28
HOXD10-201ENST00000249501 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa16.78■□□□□ 0.28
HOXD10-201ENST00000249501 CEP295Q9C0D2 2601 aa16.78■□□□□ 0.28
HOXD10-201ENST00000249501 RAB3BP20337 219 aa16.78■□□□□ 0.28
HOXD10-201ENST00000249501 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
HOXD10-201ENST00000249501 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa16.78■□□□□ 0.28
HOXD10-201ENST00000249501 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
HOXD10-201ENST00000249501 CPT1CQ8TCG5 803 aa16.78■□□□□ 0.28
HOXD10-201ENST00000249501 GPR148Q8TDV2 347 aa16.78■□□□□ 0.28
HOXD10-201ENST00000249501 CEP19Q96LK0 163 aa16.78■□□□□ 0.28
HOXD10-201ENST00000249501 BCO1Q9HAY6 547 aa16.78■□□□□ 0.28
HOXD10-201ENST00000249501 FAM206AQ9NX38 181 aa16.78■□□□□ 0.28
HOXD10-201ENST00000249501 EMC3Q9P0I2 261 aa16.78■□□□□ 0.28
HOXD10-201ENST00000249501 COMMD3Q9UBI1 195 aa16.78■□□□□ 0.28
HOXD10-201ENST00000249501 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
HOXD10-201ENST00000249501 SPTBN4Q9H254 2564 aa16.77■□□□□ 0.28
HOXD10-201ENST00000249501 SRMP19623 302 aa16.77■□□□□ 0.28
HOXD10-201ENST00000249501 CEP78Q5JTW2 689 aa16.77■□□□□ 0.28
HOXD10-201ENST00000249501 IDNKQ5T6J7 187 aa16.77■□□□□ 0.28
HOXD10-201ENST00000249501 KLHL24Q6TFL4 600 aa16.77■□□□□ 0.28
HOXD10-201ENST00000249501 Q6ZS92 163 aa16.77■□□□□ 0.28
HOXD10-201ENST00000249501 CCDC190Q86UF4 302 aa16.77■□□□□ 0.28
HOXD10-201ENST00000249501 AP3S1Q92572 193 aa16.77■□□□□ 0.28
HOXD10-201ENST00000249501 FBXO17Q96EF6 278 aa16.77■□□□□ 0.28
HOXD10-201ENST00000249501 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa16.77■□□□□ 0.28
HOXD10-201ENST00000249501 SLC7A10Q9NS82 523 aa16.77■□□□□ 0.28
HOXD10-201ENST00000249501 TMEM38BQ9NVV0 291 aa16.77■□□□□ 0.28
HOXD10-201ENST00000249501 RTTNQ86VV8 2226 aa16.77■□□□□ 0.28
HOXD10-201ENST00000249501 B4GALT1P15291 398 aa16.77■□□□□ 0.27
HOXD10-201ENST00000249501 HSD11B1P28845 292 aa16.77■□□□□ 0.27
HOXD10-201ENST00000249501 PRKXP51817 358 aa16.77■□□□□ 0.27
HOXD10-201ENST00000249501 TAF13Q15543 124 aa16.77■□□□□ 0.27
HOXD10-201ENST00000249501 ZNF544Q6NX49 715 aa16.77■□□□□ 0.27
HOXD10-201ENST00000249501 SFXN4Q6P4A7 337 aa16.77■□□□□ 0.27
HOXD10-201ENST00000249501 C16orf87Q6PH81 154 aa16.77■□□□□ 0.27
HOXD10-201ENST00000249501 SIAH3Q8IW03 269 aa16.77■□□□□ 0.27
HOXD10-201ENST00000249501 MCEMP1Q8IX19 187 aa16.77■□□□□ 0.27
HOXD10-201ENST00000249501 PARP16Q8N5Y8 322 aa16.77■□□□□ 0.27
HOXD10-201ENST00000249501 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.27
HOXD10-201ENST00000249501 PHYHIPQ92561 330 aa16.77■□□□□ 0.27
HOXD10-201ENST00000249501 FOXB1Q99853 325 aa16.77■□□□□ 0.27
HOXD10-201ENST00000249501 A0A1B0GVC2 190 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXD10-201ENST00000249501 ZNF724A8MTY0 619 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXD10-201ENST00000249501 KRT33AO76009 404 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXD10-201ENST00000249501 YES1P07947 543 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXD10-201ENST00000249501 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
HOXD10-201ENST00000249501 MMP16P51512 607 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXD10-201ENST00000249501 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
HOXD10-201ENST00000249501 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXD10-201ENST00000249501 FAM27BQ5VT28 67 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXD10-201ENST00000249501 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
HOXD10-201ENST00000249501 GFI1Q99684 422 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXD10-201ENST00000249501 PRDM14Q9GZV8 571 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXD10-201ENST00000249501 RNF122Q9H9V4 155 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXD10-201ENST00000249501 LUZP4Q9P127 313 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXD10-201ENST00000249501 DAPK2Q9UIK4 370 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXD10-201ENST00000249501 SLC5A6Q9Y289 635 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXD10-201ENST00000249501 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXD10-201ENST00000249501 SLC22A20A6NK97 555 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXD10-201ENST00000249501 ANOS1P23352 680 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXD10-201ENST00000249501 THBS2P35442 1172 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXD10-201ENST00000249501 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
HOXD10-201ENST00000249501 GJC3Q8NFK1 279 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXD10-201ENST00000249501 TMEM106AQ96A25 262 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXD10-201ENST00000249501 PARPBPQ9NWS1 579 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXD10-201ENST00000249501 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXD10-201ENST00000249501 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
HOXD10-201ENST00000249501 AQP7O14520 342 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXD10-201ENST00000249501 SLC2A1P11166 492 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXD10-201ENST00000249501 NPR2P20594 1047 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXD10-201ENST00000249501 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
HOXD10-201ENST00000249501 DCTDP32321 178 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXD10-201ENST00000249501 ETV6P41212 452 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXD10-201ENST00000249501 BCL2L15Q5TBC7 163 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXD10-201ENST00000249501 WDFY2Q96P53 400 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXD10-201ENST00000249501 SLC30A2Q9BRI3 323 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXD10-201ENST00000249501 OCEL1Q9H607 264 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXD10-201ENST00000249501 SVILO95425 2214 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXD10-201ENST00000249501 MKRN2OSH3BPM6 223 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXD10-201ENST00000249501 K7ENP7 123 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXD10-201ENST00000249501 TAF4O00268 1085 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXD10-201ENST00000249501 P2RY10O00398 339 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXD10-201ENST00000249501 HPGDSO60760 199 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXD10-201ENST00000249501 TTRP02766 147 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXD10-201ENST00000249501 PATE4P0C8F1 98 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXD10-201ENST00000249501 PPP5CP53041 499 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXD10-201ENST00000249501 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
HOXD10-201ENST00000249501 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
HOXD10-201ENST00000249501 HIST1H3AP68431 136 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXD10-201ENST00000249501 GALK2Q01415 458 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXD10-201ENST00000249501 IFITM3Q01628 133 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXD10-201ENST00000249501 SPANXN2Q5MJ10 180 aa16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.9 ms