RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488087.1

ECHDC1-217, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 3

Gene ECHDC1, Length 473 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-217ENST00000488087 CMTM6Q9NX76 183 aa3□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 BTNL2Q9UIR0 455 aa3□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 ADAM28Q9UKQ2 775 aa3□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 IKZF3Q9UKT9 509 aa3□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 ING4Q9UNL4 249 aa3□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 DHRS7Q9Y394 339 aa3□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 TPRKBQ9Y3C4 175 aa3□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 SIPA1L1O43166 1804 aa3□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 MAST2Q6P0Q8 1798 aa3□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 MYH3P11055 1940 aa2.99□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 ASTN1O14525 1302 aa2.99□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 PTPRJQ12913 1337 aa2.99□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa2.99□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 ALS2Q96Q42 1657 aa2.99□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa2.99□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 A0A1B0GVI7 797 aa2.99□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 EFCAB7A8K855 629 aa2.99□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 EFCAB9A8MZ26 197 aa2.99□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 E5RI56 91 aa2.99□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 NPIPA2E9PIF3 369 aa2.99□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 H3BTX0 84 aa2.99□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 H7C2Y5 167 aa2.99□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 KCNK1O00180 336 aa2.99□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 CDC7O00311 574 aa2.99□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 SULT1C2O00338 296 aa2.99□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 BTN3A3O00478 584 aa2.99□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 PHYHO14832 338 aa2.99□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 GMFGO60234 142 aa2.99□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 HCN1O60741 890 aa2.99□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 ZMPSTE24O75844 475 aa2.99□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 SRP72O76094 671 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 VENTXO95231 258 aa2.99□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 LGI1O95970 557 aa2.99□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 SERPINA5P05154 406 aa2.99□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 S100A9P06702 114 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 OR56A5P0C7T3 313 aa2.99□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 HSMCR30P0CW71 290 aa2.99□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 IL1RNP18510 177 aa2.99□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 ATP6V1B2P21281 511 aa2.99□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 UCP1P25874 307 aa2.99□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 PAX6P26367 422 aa2.99□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 SHMT2P34897 504 aa2.99□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 RPL22P35268 128 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 CEACAM6P40199 344 aa2.99□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 ACTR1BP42025 376 aa2.99□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 CSRP3P50461 194 aa2.99□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 RPL14P50914 215 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 PRMT2P55345 433 aa2.99□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 PKNOX1P55347 436 aa2.99□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 TAS2R60P59551 318 aa2.99□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 SPIBQ01892 262 aa2.99□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 TNFRSF17Q02223 184 aa2.99□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 HSF2Q03933 536 aa2.99□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 SLAMF1Q13291 335 aa2.99□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 PLD1Q13393 1074 aa2.99□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 QPRTQ15274 297 aa2.99□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa2.99□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 CDNFQ49AH0 187 aa2.99□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 SLC22A6Q4U2R8 563 aa2.99□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 C14orf28Q4W4Y0 310 aa2.99□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 C1orf185Q5T7R7 199 aa2.99□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 ZNF691Q5VV52 312 aa2.99□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 LAIR2Q6ISS4 152 aa2.99□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 SLC25A25Q6KCM7 469 aa2.99□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 CLEC2AQ6UVW9 174 aa2.99□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 APOOLQ6UXV4 268 aa2.99□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa2.99□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 ERASQ7Z444 233 aa2.99□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 P4HA3Q7Z4N8 544 aa2.99□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 SKA3Q8IX90 412 aa2.99□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 RIMKLAQ8IXN7 391 aa2.99□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 MCOLN2Q8IZK6 566 aa2.99□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 SPAG16Q8N0X2 631 aa2.99□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa2.99□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 SVOPLQ8N434 492 aa2.99□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 CERS5Q8N5B7 392 aa2.99□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 BCORP1Q8N888 145 aa2.99□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 ZNF491Q8N8L2 437 aa2.99□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 FADS6Q8N9I5 356 aa2.99□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 ZNF555Q8NEP9 628 aa2.99□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 OR13C2Q8NGS9 318 aa2.99□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa2.99□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 TYMSOSQ8TAI1 123 aa2.99□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 CANT1Q8WVQ1 401 aa2.99□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 OSTF1Q92882 214 aa2.99□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 MYLPFQ96A32 169 aa2.99□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 C19orf60Q96EN9 201 aa2.99□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 CSPG4P5Q96PW8 444 aa2.99□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 P2RY13Q9BPV8 354 aa2.99□□□□□ -1.93
ECHDC1-217ENST00000488087 FAM173AQ9BQD7 235 aa2.99□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 132.8 ms