RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495357.1

CCDC39-AS1-201, CCDC39 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CCDC39-AS1, Length 283 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF806P0C7X5 589 aa2.01□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IFNAR2P48551 515 aa2.01□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 AIF1P55008 147 aa2.01□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ECH1Q13011 328 aa2.01□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP2.01□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa2.01□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ORMDL2Q53FV1 153 aa2.01□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 THEM4Q5T1C6 240 aa2.01□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC16A13Q7RTY0 426 aa2.01□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LRP11Q86VZ4 500 aa2.01□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR1S2Q8NGQ3 325 aa2.01□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR6N1Q8NGY5 312 aa2.01□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LILRB4Q8NHJ6 448 aa2.01□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RHEBL1Q8TAI7 183 aa2.01□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PIFOQ8TCI5 191 aa2.01□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PIBF1Q8WXW3 757 aa2.01□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SERPINB12Q96P63 405 aa2.01□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR52D1Q9H346 318 aa2.01□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC7A8Q9UHI5 535 aa2.01□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SHROOM3Q8TF72 1996 aa2.01□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CNTNAP1P78357 1384 aa2□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa2□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa2□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa2□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DYNC1I1O14576 645 aa2□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SSTR5P35346 364 aa2□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KCNJ2P63252 427 aa2□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ACTG2P63267 376 aa2□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TWF1Q12792 350 aa2□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GPM6BQ13491 265 aa2□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP2□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PDIK1LQ8N165 341 aa2□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MS4A15Q8N5U1 240 aa2□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa2□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF488Q96MN9 340 aa2□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC39A3Q9BRY0 314 aa2□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KCNJ16Q9NPI9 418 aa2□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ETNK2Q9NVF9 386 aa2□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ING4Q9UNL4 249 aa2□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF716A6NP11 495 aa1.99□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 H0YJW9 148 aa1.99□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CHST1O43916 411 aa1.99□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF735P0CB33 412 aa1.99□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR5H8P0DN80 308 aa1.99□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IFNA8P32881 189 aa1.99□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SSR4P51571 173 aa1.99□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CDH17Q12864 832 aa1.99□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa1.99□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TEX9Q8N6V9 391 aa1.99□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa1.99□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR2L3Q8NG85 312 aa1.99□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CXorf40AQ8TE69 158 aa1.99□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC25A46Q96AG3 418 aa1.99□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GALNT14Q96FL9 552 aa1.99□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TIMM17AQ99595 171 aa1.99□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa1.99□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP1.99□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BLOC1S6Q9UL45 172 aa1.99□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PPP1R2P9O14990 202 aa1.98□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IGHDP01880 384 aa1.98□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR8U9P0C7N5 309 aa1.98□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP1.98□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IL24Q13007 206 aa1.98□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 AP1ARQ63HQ0 302 aa1.98□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 WDFY1Q8IWB7 410 aa1.98□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EID2Q8N6I1 236 aa1.98□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LRRC52Q8N7C0 313 aa1.98□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BHLHE23Q8NDY6 225 aa1.98□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GON7Q9BXV9 100 aa1.98□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP1.98□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ADGRL1O94910 1474 aa1.98□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LTBP4Q8N2S1 1624 aa1.98□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa1.97□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SURF6O75683 361 aaKnown RBP1.97□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 P0C880 135 aa1.97□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF250P15622 560 aa1.97□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CRYBB2P43320 205 aa1.97□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP1.97□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SPIN3Q5JUX0 258 aa1.97□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 AVPI1Q5T686 147 aa1.97□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa1.97□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KDELC1Q6UW63 502 aa1.97□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EGFL6Q8IUX8 553 aa1.97□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 METTL13Q8N6R0 699 aa1.97□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR8J1Q8NGP2 316 aa1.97□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR13G1Q8NGZ3 307 aa1.97□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa1.97□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PTX4Q96A99 478 aa1.97□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NTAN1Q96AB6 310 aa1.97□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CNDP1Q96KN2 507 aa1.97□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PKNOX2Q96KN3 472 aa1.97□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KLHL28Q9NXS3 571 aa1.97□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SEC16AO15027 2179 aa1.97□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SCN4AP35499 1836 aa1.96□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HMCN1Q96RW7 5635 aa1.96□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C5orf63A6NC05 138 aa1.96□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EEDO75530 441 aaKnown RBP1.96□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.8 ms