RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC9A3P48764 834 aa22.27■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MMP15P51511 669 aa22.27■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PPP1CBP62140 327 aa22.27■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FHL1Q13642 323 aa22.27■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF730Q6ZMV8 503 aa22.27■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa22.27■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR13C2Q8NGS9 318 aa22.27■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TIMD4Q96H15 378 aa22.27■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WIPI2Q9Y4P8 454 aa22.27■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A0A0A6YYJ9 748 aa22.26■■□□□ 1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C12orf71A8MTZ7 269 aa22.26■■□□□ 1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PNPP00491 289 aa22.26■■□□□ 1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MSR1P21757 451 aa22.26■■□□□ 1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GUCY1A3Q02108 690 aa22.26■■□□□ 1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IFI44LQ53G44 452 aa22.26■■□□□ 1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM255AQ5JRV8 349 aa22.26■■□□□ 1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF774Q6NX45 483 aa22.26■■□□□ 1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RAB1CQ92928 201 aa22.26■■□□□ 1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ELOVL3Q9HB03 270 aa22.26■■□□□ 1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CYSLTR2Q9NS75 346 aa22.26■■□□□ 1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A0A087WUU8 490 aa22.25■■□□□ 1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 H3BSA7 217 aa22.25■■□□□ 1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ICMTO60725 284 aa22.25■■□□□ 1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MPZL1O95297 269 aa22.25■■□□□ 1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 COX4I1P13073 169 aa22.25■■□□□ 1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RPL4P36578 427 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARL9Q6T311 187 aa22.25■■□□□ 1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa22.25■■□□□ 1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FKBP9P1Q75LS8 142 aa22.25■■□□□ 1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CBLL1Q75N03 491 aa22.25■■□□□ 1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SYT9Q86SS6 491 aa22.25■■□□□ 1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EGLN1Q9GZT9 426 aa22.25■■□□□ 1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCDC134Q9H6E4 229 aa22.25■■□□□ 1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 POLE4Q9NR33 117 aa22.25■■□□□ 1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GRHPRQ9UBQ7 328 aa22.25■■□□□ 1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa22.24■■□□□ 1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 H7C1C5 153 aa22.24■■□□□ 1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NGFP01138 241 aa22.24■■□□□ 1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LIPAP38571 399 aa22.24■■□□□ 1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GPR4P46093 362 aa22.24■■□□□ 1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARHGDIAP52565 204 aa22.24■■□□□ 1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC7A2P52569 658 aa22.24■■□□□ 1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LCN6P62502 163 aa22.24■■□□□ 1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TBPL2Q6SJ96 375 aa22.24■■□□□ 1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 THSD4Q6ZMP0 1018 aa22.24■■□□□ 1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TEX29Q8N6K0 151 aa22.24■■□□□ 1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCL17Q92583 94 aa22.24■■□□□ 1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HSH2DQ96JZ2 352 aa22.24■■□□□ 1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C4orf45Q96LM5 186 aa22.24■■□□□ 1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 G6PC2Q9NQR9 355 aa22.24■■□□□ 1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NME4O00746 187 aa22.23■■□□□ 1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PLPP2O43688 288 aa22.23■■□□□ 1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRSS23O95084 383 aa22.23■■□□□ 1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 VENTXO95231 258 aa22.23■■□□□ 1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGHV2-5P01817 119 aa22.23■■□□□ 1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa22.23■■□□□ 1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RRM2BQ7LG56 351 aa22.23■■□□□ 1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM156AQ8NDB6 213 aa22.23■■□□□ 1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WACQ9BTA9 647 aa22.23■■□□□ 1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa22.23■■□□□ 1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa22.23■■□□□ 1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 XKRYO14609 159 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CDC42EP2O14613 210 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SERPINA1P01009 418 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SCG5P05408 212 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ADH4P08319 380 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CD14P08571 375 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GSK3BP49841 420 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC3A1Q07837 685 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZBED5Q49AG3 693 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZMAT1Q5H9K5 638 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CYP4Z1Q86W10 505 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 Q96M85 177 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DIRC2Q96SL1 478 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NDEL1Q9GZM8 345 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EFCAB1Q9HAE3 211 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EMC7Q9NPA0 242 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KLHL21Q9UJP4 597 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A0A0G2JMP0 313 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A0A0X1KG70 313 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AHCYL1O43865 530 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCDC22O60826 627 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UBOX5O94941 541 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 COX5BP10606 129 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR4M2Q8NGB6 313 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM162AQ96A26 154 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF570Q96NI8 536 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GAL3ST1Q99999 423 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ANKRD19PQ9H560 264 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MSL2Q9HCI7 577 aa22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38 ms