RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617055.4

UBE2C-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 C, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene UBE2C, Length 705 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2C-208ENST00000617055 NANOGQ9H9S0 305 aa15.19■□□□□ 0.02
UBE2C-208ENST00000617055 H3BSA7 217 aa15.18■□□□□ 0.02
UBE2C-208ENST00000617055 MGRN1O60291 552 aa15.18■□□□□ 0.02
UBE2C-208ENST00000617055 CH25HO95992 272 aa15.18■□□□□ 0.02
UBE2C-208ENST00000617055 SELEP16581 610 aa15.18■□□□□ 0.02
UBE2C-208ENST00000617055 MDH2P40926 338 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
UBE2C-208ENST00000617055 STX3Q13277 289 aa15.18■□□□□ 0.02
UBE2C-208ENST00000617055 CDK5R2Q13319 367 aa15.18■□□□□ 0.02
UBE2C-208ENST00000617055 MTX3Q5HYI7 312 aa15.18■□□□□ 0.02
UBE2C-208ENST00000617055 HHATQ5VTY9 493 aa15.18■□□□□ 0.02
UBE2C-208ENST00000617055 FAM205BPQ63HN1 556 aa15.18■□□□□ 0.02
UBE2C-208ENST00000617055 REEP3Q6NUK4 255 aa15.18■□□□□ 0.02
UBE2C-208ENST00000617055 LINC00114Q6XXX2 140 aa15.18■□□□□ 0.02
UBE2C-208ENST00000617055 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
UBE2C-208ENST00000617055 OR10S1Q8NGN2 331 aa15.18■□□□□ 0.02
UBE2C-208ENST00000617055 AKR7LQ8NHP1 331 aa15.18■□□□□ 0.02
UBE2C-208ENST00000617055 SIGLEC11Q96RL6 698 aa15.18■□□□□ 0.02
UBE2C-208ENST00000617055 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
UBE2C-208ENST00000617055 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
UBE2C-208ENST00000617055 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
UBE2C-208ENST00000617055 MARCH7Q9H992 704 aa15.18■□□□□ 0.02
UBE2C-208ENST00000617055 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
UBE2C-208ENST00000617055 SIAEQ9HAT2 523 aa15.18■□□□□ 0.02
UBE2C-208ENST00000617055 NANSQ9NR45 359 aa15.18■□□□□ 0.02
UBE2C-208ENST00000617055 SLC13A4Q9UKG4 626 aa15.18■□□□□ 0.02
UBE2C-208ENST00000617055 CEACAM18A8MTB9 384 aa15.17■□□□□ 0.02
UBE2C-208ENST00000617055 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
UBE2C-208ENST00000617055 WNT2P09544 360 aa15.17■□□□□ 0.02
UBE2C-208ENST00000617055 ZNF32P17041 273 aa15.17■□□□□ 0.02
UBE2C-208ENST00000617055 TNFRSF1AP19438 455 aa15.17■□□□□ 0.02
UBE2C-208ENST00000617055 TNFSF4P23510 183 aa15.17■□□□□ 0.02
UBE2C-208ENST00000617055 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
UBE2C-208ENST00000617055 GCNT6Q5T4J0 391 aa15.17■□□□□ 0.02
UBE2C-208ENST00000617055 BRD3OSQ6XYD6 125 aa15.17■□□□□ 0.02
UBE2C-208ENST00000617055 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
UBE2C-208ENST00000617055 POU5F2Q8N7G0 328 aa15.17■□□□□ 0.02
UBE2C-208ENST00000617055 NOXO1Q8NFA2 376 aa15.17■□□□□ 0.02
UBE2C-208ENST00000617055 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP15.17■□□□□ 0.02
UBE2C-208ENST00000617055 SAMD8Q96LT4 415 aa15.17■□□□□ 0.02
UBE2C-208ENST00000617055 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
UBE2C-208ENST00000617055 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa15.17■□□□□ 0.02
UBE2C-208ENST00000617055 ZIM2Q9NZV7 527 aa15.17■□□□□ 0.02
UBE2C-208ENST00000617055 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa15.16■□□□□ 0.02
UBE2C-208ENST00000617055 PRORSD1PA6NEY8 169 aa15.16■□□□□ 0.02
UBE2C-208ENST00000617055 SLC22A31A6NKX4 558 aa15.16■□□□□ 0.02
UBE2C-208ENST00000617055 HIST1H2ABP04908 130 aa15.16■□□□□ 0.02
UBE2C-208ENST00000617055 CDAP32320 146 aa15.16■□□□□ 0.02
UBE2C-208ENST00000617055 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
UBE2C-208ENST00000617055 CDK6Q00534 326 aa15.16■□□□□ 0.02
UBE2C-208ENST00000617055 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
UBE2C-208ENST00000617055 PDCD1Q15116 288 aa15.16■□□□□ 0.02
UBE2C-208ENST00000617055 TAF9Q16594 264 aa15.16■□□□□ 0.02
UBE2C-208ENST00000617055 C10orf128Q5T292 105 aa15.16■□□□□ 0.02
UBE2C-208ENST00000617055 NXNQ6DKJ4 435 aa15.16■□□□□ 0.02
UBE2C-208ENST00000617055 ZNF613Q6PF04 617 aa15.16■□□□□ 0.02
UBE2C-208ENST00000617055 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa15.16■□□□□ 0.02
UBE2C-208ENST00000617055 ZER1Q7Z7L7 766 aa15.16■□□□□ 0.02
UBE2C-208ENST00000617055 OR2Z1Q8NG97 314 aa15.16■□□□□ 0.02
UBE2C-208ENST00000617055 RAB40AQ8WXH6 277 aa15.16■□□□□ 0.02
UBE2C-208ENST00000617055 GTF2H4Q92759 462 aa15.16■□□□□ 0.02
UBE2C-208ENST00000617055 HIST1H2ACQ93077 130 aa15.16■□□□□ 0.02
UBE2C-208ENST00000617055 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
UBE2C-208ENST00000617055 SEPHS2Q99611 448 aa15.16■□□□□ 0.02
UBE2C-208ENST00000617055 SLC30A2Q9BRI3 323 aa15.16■□□□□ 0.02
UBE2C-208ENST00000617055 CHIAQ9BZP6 476 aa15.16■□□□□ 0.02
UBE2C-208ENST00000617055 NOX4Q9NPH5 578 aa15.16■□□□□ 0.02
UBE2C-208ENST00000617055 ZNF229Q9UJW7 825 aa15.16■□□□□ 0.02
UBE2C-208ENST00000617055 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa15.16■□□□□ 0.02
UBE2C-208ENST00000617055 TRPC5OSA6NMA1 111 aa15.15■□□□□ 0.02
UBE2C-208ENST00000617055 CENPBD1B2RD01 187 aa15.15■□□□□ 0.02
UBE2C-208ENST00000617055 HDAC3O15379 428 aa15.15■□□□□ 0.02
UBE2C-208ENST00000617055 CHP2O43745 196 aa15.15■□□□□ 0.02
UBE2C-208ENST00000617055 ICMTO60725 284 aa15.15■□□□□ 0.02
UBE2C-208ENST00000617055 TSPAN15O95858 294 aa15.15■□□□□ 0.02
UBE2C-208ENST00000617055 ARHGDIAP52565 204 aa15.15■□□□□ 0.02
UBE2C-208ENST00000617055 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
UBE2C-208ENST00000617055 PSG4Q00888 419 aa15.15■□□□□ 0.02
UBE2C-208ENST00000617055 BST1Q10588 318 aa15.15■□□□□ 0.02
UBE2C-208ENST00000617055 PSG7Q13046 419 aa15.15■□□□□ 0.02
UBE2C-208ENST00000617055 ZNF774Q6NX45 483 aa15.15■□□□□ 0.02
UBE2C-208ENST00000617055 Q6YL49 198 aa15.15■□□□□ 0.02
UBE2C-208ENST00000617055 OR9I1Q8NGQ6 314 aa15.15■□□□□ 0.02
UBE2C-208ENST00000617055 NABP1Q96AH0 204 aa15.15■□□□□ 0.02
UBE2C-208ENST00000617055 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
UBE2C-208ENST00000617055 ZNF607Q96SK3 696 aa15.15■□□□□ 0.02
UBE2C-208ENST00000617055 MCHR1Q99705 422 aa15.15■□□□□ 0.02
UBE2C-208ENST00000617055 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
UBE2C-208ENST00000617055 RNF114Q9Y508 228 aa15.15■□□□□ 0.02
UBE2C-208ENST00000617055 MCIDASD6RGH6 385 aa15.14■□□□□ 0.01
UBE2C-208ENST00000617055 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
UBE2C-208ENST00000617055 FMO6PO60774 539 aa15.14■□□□□ 0.01
UBE2C-208ENST00000617055 SLC2A10O95528 541 aa15.14■□□□□ 0.01
UBE2C-208ENST00000617055 ASAH2BP0C7U1 165 aa15.14■□□□□ 0.01
UBE2C-208ENST00000617055 RPS2P15880 293 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
UBE2C-208ENST00000617055 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
UBE2C-208ENST00000617055 CPT2P23786 658 aa15.14■□□□□ 0.01
UBE2C-208ENST00000617055 ERVK-25P63136 954 aa15.14■□□□□ 0.01
UBE2C-208ENST00000617055 SLC2A7Q6PXP3 512 aa15.14■□□□□ 0.01
UBE2C-208ENST00000617055 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa15.14■□□□□ 0.01
UBE2C-208ENST00000617055 ARMC8Q8IUR7 673 aa15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.4 ms