RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592911.5

SMAD4-215, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 5

Gene SMAD4, Length 475 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-215ENST00000592911 TMEM19Q96HH6 336 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 EMC6Q9BV81 110 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 RMND5AQ9H871 391 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 RNF121Q9H920 327 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 SIAEQ9HAT2 523 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 TMEM27Q9HBJ8 222 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 NPHS2Q9NP85 383 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 MIOXQ9UGB7 285 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 RAP2CQ9Y3L5 183 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 CACNG2Q9Y698 323 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 NPIPB13A6NJU9 1138 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 NPIPB4C9JG80 1138 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 PHYHO14832 338 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 EREGO14944 169 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 SPRY3O43610 288 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 OR6A2O95222 327 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 IGF2P01344 180 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 LIPFP07098 398 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 WNT2P09544 360 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 SBK2P0C263 348 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 GSTM3P21266 225 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 PCGF2P35227 344 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 CRATP43155 626 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 NPY4RP50391 375 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 RPL14P50914 215 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 BIDP55957 195 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 HSF2Q03933 536 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 BEAN1Q3B7T3 259 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 ZNF774Q6NX45 483 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 SLC27A4Q6P1M0 643 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 ZNF613Q6PF04 617 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 C11orf88Q6PI97 169 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 LRFN4Q6PJG9 635 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 NLRC3Q7RTR2 1065 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 KRT73Q86Y46 540 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 DTX3Q8N9I9 347 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 HIPK4Q8NE63 616 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 OR4K5Q8NGD3 323 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 TXNDC15Q96J42 360 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 POM121L2Q96KW2 1035 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 C16orf95Q9H693 158 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 MEAF6Q9HAF1 191 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 TPT1P8Q9HAU6 139 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 TCF7L1Q9HCS4 588 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 AIG1Q9NVV5 245 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 FRRS1LQ9P0K9 344 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 ASH2LQ9UBL3 628 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 ZNF229Q9UJW7 825 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 GMEB1Q9Y692 573 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 TRAV40A0A0B4J280 105 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 CEACAM18A8MTB9 384 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 P2RY10O00398 339 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 BIRC5O15392 142 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 OPN1MWP04001 364 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 SERPINE1P05121 402 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 ADORA3P0DMS8 318 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 OPN1MW2P0DN77 364 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 OPN1MW3P0DN78 364 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 COX5BP10606 129 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 ETFAP13804 333 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 KITLGP21583 273 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 HTR2AP28223 471 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 ETV4P43268 484 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 GDI2P50395 445 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 PCBD1P61457 104 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 ERVS71-1P61550 626 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 GNB2P62879 340 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 TTMPQ5BVD1 217 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 WDR88Q6ZMY6 472 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 LDLRAD3Q86YD5 345 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 C1orf87Q8N0U7 546 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 MIER2Q8N344 545 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 GALNT4Q8N4A0 578 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 POU5F2Q8N7G0 328 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 OR10S1Q8NGN2 331 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 LINC01006Q8NI28 216 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 FGFBP3Q8TAT2 258 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 TCP10LQ8TDR4 215 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 ITCHQ96J02 903 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 DMRTB1Q96MA1 342 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 SIGLEC11Q96RL6 698 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 SH3GL3Q99963 347 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 TBCCD1Q9NVR7 557 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 LGALS13Q9UHV8 139 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 C5orf58C9J3I9 102 aa7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.7 ms