RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495357.1

CCDC39-AS1-201, CCDC39 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CCDC39-AS1, Length 283 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CTNNA3Q9UI47 895 aa2.06□□□□□ -2.08
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF639Q9UID6 485 aa2.06□□□□□ -2.08
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SCN1AP35498 2009 aa2.06□□□□□ -2.08
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa2.06□□□□□ -2.08
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa2.05□□□□□ -2.08
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CLRN2A0PK11 232 aa2.05□□□□□ -2.08
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BICDL2A1A5D9 508 aa2.05□□□□□ -2.08
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 F6UB75 175 aa2.05□□□□□ -2.08
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GOSR2O14653 212 aa2.05□□□□□ -2.08
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GMFGO60234 142 aa2.05□□□□□ -2.08
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HLA-DQA1P01909 254 aa2.05□□□□□ -2.08
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IL4P05112 153 aa2.05□□□□□ -2.08
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CALM1P0DP23 149 aa2.05□□□□□ -2.08
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CALM2P0DP24 149 aa2.05□□□□□ -2.08
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CALM3P0DP25 149 aa2.05□□□□□ -2.08
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CD34P28906 385 aa2.05□□□□□ -2.08
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CXCL12P48061 93 aa2.05□□□□□ -2.08
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SEC61GP60059 68 aa2.05□□□□□ -2.08
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KRTAP12-4P60329 112 aa2.05□□□□□ -2.08
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 UBE2HP62256 183 aa2.05□□□□□ -2.08
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GK3PQ14409 553 aa2.05□□□□□ -2.08
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IRF4Q15306 451 aa2.05□□□□□ -2.08
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PLET1Q6UQ28 207 aa2.05□□□□□ -2.08
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CALHM1Q8IU99 346 aa2.05□□□□□ -2.08
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF547Q8IVP9 402 aa2.05□□□□□ -2.08
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa2.05□□□□□ -2.08
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR4K5Q8NGD3 323 aa2.05□□□□□ -2.08
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR52M1Q8NGK5 317 aa2.05□□□□□ -2.08
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LINC01560Q8TB33 94 aa2.05□□□□□ -2.08
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C17orf50Q8WW18 174 aa2.05□□□□□ -2.08
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TBC1D31Q96DN5 1066 aa2.05□□□□□ -2.08
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IFT74Q96LB3 600 aa2.05□□□□□ -2.08
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CAMK2N2Q96S95 79 aa2.05□□□□□ -2.08
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa2.05□□□□□ -2.08
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CWH43Q9H720 699 aa2.05□□□□□ -2.08
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF229Q9UJW7 825 aa2.05□□□□□ -2.08
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SOCS1O15524 211 aa2.04□□□□□ -2.08
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMEM50AO95807 157 aa2.04□□□□□ -2.08
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KRTAP12-3P60328 96 aa2.04□□□□□ -2.08
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP2.04□□□□□ -2.08
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZFP1Q6P2D0 407 aa2.04□□□□□ -2.08
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa2.04□□□□□ -2.08
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SDR9C7Q8NEX9 313 aa2.04□□□□□ -2.08
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 STMN2Q93045 179 aa2.04□□□□□ -2.08
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SULT4A1Q9BR01 284 aa2.04□□□□□ -2.08
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 VCX2Q9H322 139 aa2.04□□□□□ -2.08
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP2.04□□□□□ -2.08
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PCP4L1A6NKN8 68 aa2.03□□□□□ -2.08
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 H0YCG3 227 aa2.03□□□□□ -2.08
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NDC80O14777 642 aa2.03□□□□□ -2.08
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CD74P04233 296 aa2.03□□□□□ -2.08
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CCNB1P14635 433 aa2.03□□□□□ -2.08
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KITLGP21583 273 aa2.03□□□□□ -2.08
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 COL8A2P25067 703 aa2.03□□□□□ -2.08
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SSR1P43307 286 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KIR3DL2P43630 455 aa2.03□□□□□ -2.08
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CCNJQ5T5M9 372 aa2.03□□□□□ -2.08
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PRSS58Q8IYP2 241 aa2.03□□□□□ -2.08
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP2.03□□□□□ -2.08
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MRGPRFQ96AM1 343 aa2.03□□□□□ -2.08
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SEH1LQ96EE3 360 aa2.03□□□□□ -2.08
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TEKT3Q9BXF9 490 aa2.03□□□□□ -2.08
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NT5MQ9NPB1 228 aa2.03□□□□□ -2.08
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CLEC4AQ9UMR7 237 aa2.03□□□□□ -2.08
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NPTNQ9Y639 398 aa2.03□□□□□ -2.08
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa2.02□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LGALS9O00182 355 aa2.02□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP2.02□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PSTPIP1O43586 416 aa2.02□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MTX2O75431 263 aa2.02□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IGKV1D-16P01601 117 aa2.02□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FGGP02679 453 aa2.02□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RAB3BP20337 219 aa2.02□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GLRA2P23416 452 aa2.02□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DTYMKP23919 212 aa2.02□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP2.02□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PRRX1P54821 245 aa2.02□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MXD1Q05195 221 aa2.02□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP2.02□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PTPN20Q4JDL3 420 aa2.02□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C6orf226Q5I0X4 101 aa2.02□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 METTL21CQ5VZV1 264 aa2.02□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PMF1Q6P1K2 205 aa2.02□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SGK2Q9HBY8 427 aa2.02□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM49BQ9NUQ9 324 aa2.02□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ST3GAL6Q9Y274 331 aa2.02□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMED5Q9Y3A6 229 aa2.02□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IKBKGQ9Y6K9 419 aa2.02□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ANKRD12Q6UB98 2062 aa2.02□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NID2Q14112 1375 aa2.01□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BTBD17A6NE02 478 aa2.01□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR52A4PA6NMU1 304 aa2.01□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 VGLL3A8MV65 326 aa2.01□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP2.01□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DPM1O60762 260 aa2.01□□□□□ -2.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IL1BP01584 269 aa2.01□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 99 ms