RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293922.1

PTX4-201, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX4, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-201ENST00000293922 FKBP7Q9Y680 259 aa16.02■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 FREM1Q5H8C1 2179 aa16.01■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 PRODHO43272 600 aa16.01■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 CLUP10909 449 aa16.01■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 SPI1P17947 270 aa16.01■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 CD53P19397 219 aa16.01■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 SLC2A5P22732 501 aa16.01■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 OR3A2P47893 321 aa16.01■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 CXCR4P61073 352 aa16.01■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 DEFB113Q30KQ7 82 aa16.01■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 C6orf141Q5SZD1 244 aa16.01■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 OR6V1Q8N148 313 aa16.01■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa16.01■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 OR6N1Q8NGY5 312 aa16.01■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 APH1AQ96BI3 265 aa16.01■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 OTULINQ96BN8 352 aa16.01■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 TSSK2Q96PF2 358 aa16.01■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 LINC00470Q9BZP3 86 aa16.01■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 NUAK2Q9H093 628 aa16.01■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 RACGAP1Q9H0H5 632 aa16.01■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa16.01■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 ASB6Q9NWX5 421 aa16.01■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 MED13LQ71F56 2210 aa16■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 ACANP16112 2415 aa16■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa16■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 DCTN6O00399 190 aa16■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 SLC16A7O60669 478 aa16■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 CTLA4P16410 223 aa16■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 CRABP1P29762 137 aa16■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 FMODQ06828 376 aa16■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 TSC22D1Q15714 1073 aa16■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 SFRP5Q5T4F7 317 aa16■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 LRFN4Q6PJG9 635 aa16■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 DNM1P34Q6PK57 102 aa16■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 POMGNT2Q8NAT1 580 aa16■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 RFKQ969G6 155 aa16■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 MCHR2Q969V1 340 aa16■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 S100PBPQ96BU1 408 aa16■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 OR51V1Q9H2C8 321 aa16■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 B9D1Q9UPM9 204 aa16■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 ROS1P08922 2347 aa16■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 PRR14LQ5THK1 2151 aa15.99■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa15.99■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 UPK3AO75631 287 aa15.99■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 GYPBP06028 91 aa15.99■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 QDPRP09417 244 aa15.99■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 HTR1FP30939 366 aa15.99■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 CDH11P55287 796 aa15.99■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 TMED1Q13445 227 aa15.99■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 P2RY6Q15077 328 aa15.99■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 BEX5Q5H9J7 111 aa15.99■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 SLC35D3Q5M8T2 416 aa15.99■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 PHYHD1Q5SRE7 291 aa15.99■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 C10orf128Q5T292 105 aa15.99■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 LINC01590Q5TEZ4 76 aa15.99■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 TSPO2Q5TGU0 170 aa15.99■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa15.99■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 Q6ZT83 130 aa15.99■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 STEAP2Q8NFT2 490 aa15.99■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 HDHD5Q9BXW7 423 aa15.99■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa15.99■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 PRSS50Q9UI38 385 aa15.99■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP15.99■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 MOKQ9UQ07 419 aa15.99■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 CCDC182A6NF36 153 aa15.98■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 SLC22A31A6NKX4 558 aa15.98■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 SNTNA6NMZ2 147 aa15.98■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 CCDC159P0C7I6 412 aa15.98■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 FMO3P31513 532 aa15.98■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 CSNK2BP67870 215 aa15.98■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 LGALS3BPQ08380 585 aa15.98■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 APOFQ13790 326 aa15.98■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 KLHL12Q53G59 568 aa15.98■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 UGT2A3Q6UWM9 527 aa15.98■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 WFDC8Q8IUA0 241 aa15.98■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 ZNF100Q8IYN0 542 aa15.98■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 GPR137CQ8N3F9 429 aa15.98■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 ZNRF4Q8WWF5 429 aa15.98■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 TEAD3Q99594 435 aa15.98■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 ULBP2Q9BZM5 246 aa15.98■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa15.98■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 SLC7A10Q9NS82 523 aa15.98■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 HAO2Q9NYQ3 351 aa15.98■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP15.98■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa15.97■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 SLC1A7O00341 560 aa15.97■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 GLCEO94923 617 aa15.97■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 IL32P24001 234 aa15.97■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 PYCR1P32322 319 aa15.97■□□□□ 0.15
PTX4-201ENST00000293922 CENPAP49450 140 aa15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 97.3 ms