RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000603538.1

YTHDF3-AS1-201, Transcript of YTHDF3 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

BASIC

Gene YTHDF3-AS1, Length 718 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 RPS8P62241 208 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 KRT26Q7Z3Y9 468 aa20.62■□□□□ 0.89
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 DOK7Q18PE1 504 aa20.61■□□□□ 0.89
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 FAM161AQ3B820 660 aa20.61■□□□□ 0.89
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 RIC3Q7Z5B4 369 aa20.61■□□□□ 0.89
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 IFT57Q9NWB7 429 aa20.61■□□□□ 0.89
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa20.6■□□□□ 0.89
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 DLK2Q6UY11 383 aa20.6■□□□□ 0.89
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 KCNQ5Q9NR82 932 aa20.6■□□□□ 0.89
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 ADM5C9JUS6 153 aa20.59■□□□□ 0.89
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 UFL1O94874 794 aa20.59■□□□□ 0.89
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 SEC31BQ9NQW1 1179 aa20.59■□□□□ 0.89
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 CCDC85CA6NKD9 419 aa20.58■□□□□ 0.89
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 VIL1P09327 827 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 GNAI1P63096 354 aa20.58■□□□□ 0.89
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 CCDC152Q4G0S7 254 aa20.58■□□□□ 0.89
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 CCDC191Q8NCU4 936 aa20.58■□□□□ 0.89
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 ZIC5Q96T25 663 aa20.58■□□□□ 0.89
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 MYD88Q99836 296 aa20.58■□□□□ 0.89
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 GGA3Q9NZ52 723 aa20.58■□□□□ 0.89
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 RGMBQ6NW40 437 aa20.57■□□□□ 0.88
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 MCOLN1Q9GZU1 580 aa20.57■□□□□ 0.88
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 GGA1Q9UJY5 639 aa20.57■□□□□ 0.88
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa20.57■□□□□ 0.88
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 SPEF2Q9C093 1822 aa20.56■□□□□ 0.88
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 PDE8AO60658 829 aa20.56■□□□□ 0.88
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 C2orf69Q8N8R5 385 aa20.56■□□□□ 0.88
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa20.56■□□□□ 0.88
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 MYH3P11055 1940 aa20.56■□□□□ 0.88
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa20.56■□□□□ 0.88
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 APAF1O14727 1248 aa20.55■□□□□ 0.88
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 RGS19P49795 217 aa20.55■□□□□ 0.88
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 SAGE1Q9NXZ1 904 aa20.55■□□□□ 0.88
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 XDHP47989 1333 aa20.54■□□□□ 0.88
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 SULF1Q8IWU6 871 aa20.54■□□□□ 0.88
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 AGBL3Q8NEM8 1001 aa20.54■□□□□ 0.88
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 CCDC102AQ96A19 550 aa20.54■□□□□ 0.88
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 DDX58O95786 925 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 C8orf58Q8NAV2 365 aa20.53■□□□□ 0.88
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 G3V3G9 751 aa20.52■□□□□ 0.88
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 SLC10A3P09131 477 aa20.52■□□□□ 0.88
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 DGKZQ13574 1117 aa20.52■□□□□ 0.88
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 DCAF8Q5TAQ9 597 aa20.52■□□□□ 0.88
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa20.52■□□□□ 0.88
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 CDCA5Q96FF9 252 aa20.52■□□□□ 0.88
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 MED23Q9ULK4 1368 aa20.51■□□□□ 0.87
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 CTSWP56202 376 aa20.51■□□□□ 0.87
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 CCDC30Q5VVM6 783 aa20.51■□□□□ 0.87
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 GMLQ99445 158 aa20.51■□□□□ 0.87
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 CHMP4AQ9BY43 222 aa20.51■□□□□ 0.87
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa20.51■□□□□ 0.87
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa20.5■□□□□ 0.87
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 AKAP11Q9UKA4 1901 aa20.5■□□□□ 0.87
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 ATP2B4P23634 1241 aa20.49■□□□□ 0.87
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 IGKV5-2P06315 115 aa20.48■□□□□ 0.87
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 SCARF1Q14162 830 aa20.48■□□□□ 0.87
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 PODNQ7Z5L7 613 aa20.48■□□□□ 0.87
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 MYOZ2Q9NPC6 264 aa20.48■□□□□ 0.87
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 USP17L3A6NCW0 530 aa20.47■□□□□ 0.87
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 USP17L4A6NCW7 530 aa20.47■□□□□ 0.87
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 USP17L8P0C7I0 530 aa20.47■□□□□ 0.87
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 FKBP1BP68106 108 aa20.47■□□□□ 0.87
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 KSR2Q6VAB6 950 aa20.47■□□□□ 0.87
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 USP17L1Q7RTZ2 530 aa20.47■□□□□ 0.87
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 RASAL3Q86YV0 1011 aa20.47■□□□□ 0.87
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 TSPYL6Q8N831 410 aa20.47■□□□□ 0.87
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 RNF186Q9NXI6 227 aa20.47■□□□□ 0.87
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 TTLL11Q8NHH1 800 aa20.46■□□□□ 0.87
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 PI4KAP2A4QPH2 592 aa20.45■□□□□ 0.86
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 SLC34A2O95436 690 aa20.45■□□□□ 0.86
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa20.45■□□□□ 0.86
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 GREM2Q9H772 168 aa20.45■□□□□ 0.86
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 TRPA1O75762 1119 aa20.44■□□□□ 0.86
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 NEXNQ0ZGT2 675 aa20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.1 ms